19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1750 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_2094  hypothetical protein  100 
 
 
106 aa  225  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.263502  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1750  hypothetical protein  100 
 
 
106 aa  225  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.147174 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1199  hypothetical protein  56.63 
 
 
198 aa  105  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1368  transposase, IS4 family protein  38.36 
 
 
451 aa  52  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0449  transposase, IS4 family protein  36.71 
 
 
484 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1775  transposase, IS4 family protein  36.71 
 
 
484 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2248  transposase, IS4 family protein  36.71 
 
 
484 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2289  transposase, IS4 family protein  36.71 
 
 
484 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2903  transposase, IS4 family protein  36.71 
 
 
484 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0436  transposase, IS4 family protein  36.71 
 
 
484 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0321608  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0476  transposase, IS4 family protein  37.97 
 
 
484 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134081  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0873  transposase, IS4 family protein  37.97 
 
 
484 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.446345  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1331  transposase, IS4 family protein  37.97 
 
 
484 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000223882  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1930  transposase, IS4 family protein  37.97 
 
 
484 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.410575  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1994  transposase, IS4 family protein  37.97 
 
 
484 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936602  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2637  transposase, IS4 family protein  37.97 
 
 
484 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.523228  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0296  transposase, IS4 family protein  36.71 
 
 
484 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.600478  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1221  transposase IS4 family protein  34.78 
 
 
472 aa  40  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383855 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1144  transposase IS4 family protein  34.78 
 
 
472 aa  40  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.17697  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>