More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1564 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1564  Adenylosuccinate synthase  100 
 
 		 431 aa  871    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000128883 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1889  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 431 aa  871    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2007  adenylosuccinate synthetase  68.16 
 
 		 431 aa  588  1e-167  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00017376  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0903  Adenylosuccinate synthase  69.21 
 
 		 430 aa  586  1e-166  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.546302  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1939  adenylosuccinate synthetase  68.57 
 
 		 431 aa  585  1e-166  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0607  adenylosuccinate synthetase  65.25 
 
 		 432 aa  581  1.0000000000000001e-165  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.272974 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0578  adenylosuccinate synthetase  66.04 
 
 		 432 aa  566  1e-160  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000001206 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4889  adenylosuccinate synthetase  64.86 
 
 		 430 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0250802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5667  adenylosuccinate synthetase  64.86 
 
 		 430 aa  561  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4765  adenylosuccinate synthetase  64.86 
 
 		 430 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4941  adenylosuccinate synthetase  64.86 
 
 		 430 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348011 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0441  adenylosuccinate synthetase  63.64 
 
 		 435 aa  560  1e-158  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.83493  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65230  adenylosuccinate synthetase  64.62 
 
 		 430 aa  560  1e-158  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1282  adenylosuccinate synthetase  64.39 
 
 		 431 aa  555  1e-157  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0641  adenylosuccinate synthetase  64.47 
 
 		 431 aa  557  1e-157  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143682 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4680  adenylosuccinate synthetase  64.62 
 
 		 430 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0676  adenylosuccinate synthetase  62 
 
 		 446 aa  549  1e-155  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.678663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1281  adenylosuccinate synthetase  62.7 
 
 		 446 aa  550  1e-155  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0577  adenylosuccinate synthetase  62.5 
 
 		 430 aa  545  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4937  adenylosuccinate synthetase  62.26 
 
 		 430 aa  544  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  62.21 
 
 		 432 aa  541  1e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000134883  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07600  Adenylosuccinate synthetase  62.03 
 
 		 430 aa  540  9.999999999999999e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0660  adenylosuccinate synthetase  64.64 
 
 		 431 aa  537  1e-151  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0694  adenylosuccinate synthetase  61.41 
 
 		 432 aa  531  1e-150  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3793  adenylosuccinate synthetase  61.41 
 
 		 432 aa  531  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3648  adenylosuccinate synthetase  61.18 
 
 		 432 aa  531  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0540  adenylosuccinate synthetase  60.71 
 
 		 432 aa  532  1e-150  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.311763  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1985  adenylosuccinate synthetase  60.75 
 
 		 444 aa  531  1e-150  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133256  normal  0.151418 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0436  adenylosuccinate synthetase  62.35 
 
 		 432 aa  534  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000472279 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2857  adenylosuccinate synthetase  60.51 
 
 		 445 aa  534  1e-150  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1712  adenylosuccinate synthetase  62.7 
 
 		 448 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.12828  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1226  adenylosuccinate synthetase  63.4 
 
 		 446 aa  530  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000419397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2076  adenylosuccinate synthetase  62.94 
 
 		 446 aa  530  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1473  adenylosuccinate synthetase  62.47 
 
 		 448 aa  529  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.209737  normal  0.290596 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002264  adenylosuccinate synthetase  60.88 
 
 		 438 aa  529  1e-149  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.151372  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1606  adenylosuccinate synthetase  62.7 
 
 		 448 aa  531  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.54976  normal  0.323715 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1162  adenylosuccinate synthetase  63.4 
 
 		 446 aa  530  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.502883 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1739  adenylosuccinate synthetase  62.7 
 
 		 448 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3914  adenylosuccinate synthetase  61.18 
 
 		 432 aa  525  1e-148  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.923104  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1434  adenylosuccinate synthetase  61.63 
 
 		 459 aa  526  1e-148  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.104272  normal  0.451204 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2974  adenylosuccinate synthetase  60.05 
 
 		 435 aa  525  1e-148  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5009  adenylosuccinate synthetase  61.4 
 
 		 458 aa  525  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5102  adenylosuccinate synthetase  62.24 
 
 		 448 aa  526  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1409  adenylosuccinate synthetase  61.54 
 
 		 448 aa  526  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000087591 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1825  adenylosuccinate synthetase  62.94 
 
 		 448 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.260214  normal  0.42401 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2245  adenylosuccinate synthetase  62.47 
 
 		 448 aa  525  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.632886  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2530  adenylosuccinate synthetase  62 
 
 		 448 aa  526  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00750177  hitchhiker  0.00000299679 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1070  adenylosuccinate synthetase  62.7 
 
 		 446 aa  525  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.763716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2661  adenylosuccinate synthetase  61.08 
 
 		 431 aa  525  1e-148  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6278  adenylosuccinate synthetase  62.94 
 
 		 448 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.544992  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3716  adenylosuccinate synthetase  61.18 
 
 		 432 aa  526  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316289  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00089  adenylosuccinate synthetase  60.19 
 
 		 438 aa  527  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1801  adenylosuccinate synthetase  62.94 
 
 		 448 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04044  adenylosuccinate synthetase  60.94 
 
 		 432 aa  523  1e-147  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3816  Adenylosuccinate synthase  60.94 
 
 		 432 aa  523  1e-147  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1095  adenylosuccinate synthetase  62.47 
 
 		 448 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0073  adenylosuccinate synthetase  62.47 
 
 		 448 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5693  adenylosuccinate synthetase  60.94 
 
 		 432 aa  523  1e-147  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.580203  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1333  adenylosuccinate synthetase  62.47 
 
 		 448 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.018876  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0550  adenylosuccinate synthetase  61.79 
 
 		 431 aa  522  1e-147  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0526  adenylosuccinate synthetase  61.56 
 
 		 431 aa  522  1e-147  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04006  hypothetical protein  60.94 
 
 		 432 aa  523  1e-147  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.263842  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2344  adenylosuccinate synthetase  62.47 
 
 		 448 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3836  adenylosuccinate synthetase  60.94 
 
 		 432 aa  523  1e-147  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.930032  hitchhiker  0.00000195768 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4708  adenylosuccinate synthetase  60.94 
 
 		 432 aa  523  1e-147  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4763  adenylosuccinate synthetase  60.94 
 
 		 432 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.707154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2178  adenylosuccinate synthetase  62.47 
 
 		 448 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4784  adenylosuccinate synthetase  60.94 
 
 		 432 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2216  adenylosuccinate synthetase  62.47 
 
 		 448 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.130698  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4420  adenylosuccinate synthetase  60.94 
 
 		 432 aa  523  1e-147  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1823  adenylosuccinate synthetase  62.47 
 
 		 448 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4644  adenylosuccinate synthetase  60.94 
 
 		 432 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4634  adenylosuccinate synthetase  60.94 
 
 		 432 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2096  adenylosuccinate synthetase  62.24 
 
 		 447 aa  522  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0821268 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0497  adenylosuccinate synthetase  60.47 
 
 		 432 aa  524  1e-147  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4648  adenylosuccinate synthetase  60.94 
 
 		 432 aa  523  1e-147  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.378806 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4736  adenylosuccinate synthetase  60.94 
 
 		 432 aa  523  1e-147  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2772  adenylosuccinate synthetase  59.72 
 
 		 438 aa  522  1e-147  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4727  adenylosuccinate synthetase  60.94 
 
 		 432 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2626  adenylosuccinate synthase  62.82 
 
 		 437 aa  521  1e-146  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000737689 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1181  adenylosuccinate synthetase  61.17 
 
 		 458 aa  520  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.4333 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0330  adenylosuccinate synthetase  60.33 
 
 		 431 aa  517  1.0000000000000001e-145  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3937  adenylosuccinate synthetase  60 
 
 		 431 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2585  adenylosuccinate synthase  60.66 
 
 		 431 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0577  adenylosuccinate synthetase  58.59 
 
 		 432 aa  517  1.0000000000000001e-145  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1101  adenylosuccinate synthetase  60.95 
 
 		 458 aa  517  1.0000000000000001e-145  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.415884  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1328  adenylosuccinate synthetase  58.59 
 
 		 432 aa  516  1.0000000000000001e-145  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3357  adenylosuccinate synthetase  59.76 
 
 		 431 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0113184  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3379  adenylosuccinate synthetase  60.93 
 
 		 436 aa  514  1.0000000000000001e-145  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1978  adenylosuccinate synthetase  60.9 
 
 		 432 aa  514  1e-144  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0528  adenylosuccinate synthetase  60.14 
 
 		 429 aa  514  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650318  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1583  adenylosuccinate synthetase  59.35 
 
 		 440 aa  513  1e-144  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.147694  unclonable  0.000000227018 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2597  adenylosuccinate synthetase  62.12 
 
 		 446 aa  513  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.615591 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00585  adenylosuccinate synthetase  59.1 
 
 		 432 aa  511  1e-144  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0747  adenylosuccinate synthetase  59.53 
 
 		 431 aa  511  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000703533  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3266  adenylosuccinate synthetase  60 
 
 		 431 aa  514  1e-144  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000110825  hitchhiker  0.0000153755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0681  adenylosuccinate synthetase  60 
 
 		 431 aa  514  1e-144  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00011524  hitchhiker  0.00031126 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3069  adenylosuccinate synthetase  59.86 
 
 		 431 aa  514  1e-144  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00455582  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0695  adenylosuccinate synthetase  60 
 
 		 431 aa  513  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000192259  hitchhiker  0.0000489804 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2296  adenylosuccinate synthetase  59.37 
 
 		 458 aa  509  1e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>