More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0039 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0039  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 370 aa  726    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0038  drug resistance secretion protein, putative  100 
 
 		 370 aa  726    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1480  secretion protein HlyD family protein  42.25 
 
 		 404 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1024  secretion protein HlyD  42.25 
 
 		 404 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1504  secretion protein HlyD family protein  42.25 
 
 		 404 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226713  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1751  efflux pump membrane protein  41.33 
 
 		 407 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0610226 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1426  secretion protein HlyD family protein  40.75 
 
 		 405 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0183071 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1386  secretion protein HlyD family protein  40.75 
 
 		 407 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3583  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  41.03 
 
 		 420 aa  236  6e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0766049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1919  multidrug resistance protein  41.34 
 
 		 411 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.666477  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4645  HlyD family secretion protein  41.64 
 
 		 404 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109619  normal  0.493066 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1767  multidrug resistance protein  41.34 
 
 		 411 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2560  multidrug resistance protein  41.64 
 
 		 410 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.634691  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1636  efflux pump membrane protein  41.34 
 
 		 424 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00067211 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1744  multidrug resistance protein  41.34 
 
 		 411 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1503  putative multidrug resistance protein  41.03 
 
 		 411 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1057  multidrug resistance protein, putative  41.03 
 
 		 411 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0394345  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0995  putative multidrug resistance protein  41.03 
 
 		 411 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0171  putative multidrug resistance protein  41.03 
 
 		 411 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.152509  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1725  efflux pump membrane protein  39.71 
 
 		 406 aa  231  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2816  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  40.77 
 
 		 413 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.106074  normal  0.653781 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0862  drug resistance transporter, putative  40.6 
 
 		 387 aa  218  1e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.184539  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0986  secretion protein HlyD family protein  40.6 
 
 		 389 aa  218  1e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.3536  hitchhiker  0.00174986 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01156  multidrug resistance efflux pump  41.54 
 
 		 372 aa  217  2.9999999999999998e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.461805  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3748  multidrug resistance protein  38.56 
 
 		 402 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.155411  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1730  secretion protein HlyD  35.96 
 
 		 402 aa  210  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5897  multidrug resistance protein  39.18 
 
 		 400 aa  210  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2027  secretion protein HlyD  39.88 
 
 		 413 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.294658  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2468  secretion protein HlyD family protein  36.86 
 
 		 393 aa  208  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68130  multidrug resistance protein  38.89 
 
 		 394 aa  207  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00130699  normal  0.0310617 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2024  secretion protein HlyD  39.63 
 
 		 429 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0436308  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2004  secretion protein HlyD family protein  37.39 
 
 		 380 aa  203  5e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0262  secretion protein HlyD family protein  41.34 
 
 		 405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123427 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0257  secretion protein HlyD family protein  41.34 
 
 		 402 aa  200  3e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1288  secretion protein HlyD family protein  40.59 
 
 		 392 aa  199  3.9999999999999996e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2416  secretion protein HlyD family protein  39.45 
 
 		 437 aa  199  6e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.975538 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1293  multidrug resistance A (translocase) transmembrane protein  39.82 
 
 		 428 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.538155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1445  secretion protein HlyD family protein  40.11 
 
 		 444 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5574  secretion protein HlyD family protein  40.52 
 
 		 480 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2021  secretion protein HlyD family protein  38.87 
 
 		 413 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0240231 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1021  multidrug resistance protein VceA  35.26 
 
 		 395 aa  196  7e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1123  secretion protein HlyD family protein  39.04 
 
 		 429 aa  195  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.911317  normal  0.519674 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2518  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  36.78 
 
 		 387 aa  194  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1214  secretion protein HlyD family protein  39.09 
 
 		 429 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.314397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2373  secretion protein HlyD family protein  37.5 
 
 		 395 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4021  secretion protein HlyD family protein  39.45 
 
 		 451 aa  193  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.228244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2654  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  36.78 
 
 		 387 aa  193  5e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02278  EmrKY-TolC multidrug resistance efflux pump, membrane fusion protein component  36.51 
 
 		 387 aa  192  6e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.29421  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02239  hypothetical protein  36.51 
 
 		 387 aa  192  6e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.371729  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1289  efflux pump membrane protein  36.51 
 
 		 387 aa  192  6e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1301  efflux pump membrane protein  36.51 
 
 		 387 aa  192  6e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.632829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2505  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  36.51 
 
 		 387 aa  192  6e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.012377  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3599  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  36.51 
 
 		 387 aa  192  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0273562 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4314  MFS efflux pump, membrane fusion protein, EmrA subfamily  40.89 
 
 		 423 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2737  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  35.97 
 
 		 387 aa  191  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.778541  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1144  secretion protein HlyD family protein  37.39 
 
 		 374 aa  190  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.143245  normal  0.639337 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3549  secretion protein HlyD family protein  36.29 
 
 		 397 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6205  secretion protein HlyD  40.94 
 
 		 450 aa  189  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127149  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3904  efflux pump membrane protein  35.6 
 
 		 381 aa  189  5.999999999999999e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3187  secretion protein HlyD family protein  36.15 
 
 		 375 aa  189  8e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4889  HlyD family secretion protein  37.97 
 
 		 459 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.392756  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3460  multidrug resistance protein A  34.85 
 
 		 390 aa  188  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3201  multidrug resistance protein A  34.85 
 
 		 390 aa  188  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0859  secretion protein HlyD  38.17 
 
 		 402 aa  187  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.556695  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2225  secretion protein HlyD family protein  36.01 
 
 		 397 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.818643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3338  efflux pump membrane protein  34.55 
 
 		 390 aa  187  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.615616  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5028  secretion protein HlyD family protein  39.76 
 
 		 396 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.826607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3743  secretion protein HlyD family protein  39.71 
 
 		 453 aa  186  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00143217  normal  0.519955 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3643  secretion protein HlyD  36.56 
 
 		 400 aa  187  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.870857  normal  0.0330116 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4503  secretion protein HlyD family protein  38.97 
 
 		 396 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0368  multidrug resistance protein  39.34 
 
 		 489 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.672597  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2100  multidrug resistance protein  39.34 
 
 		 489 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0818  multidrug resistance secretion protein  39.34 
 
 		 489 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.388202  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0464  putative multidrug resistance protein  39.94 
 
 		 388 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.387475  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0925  multidrug resistance protein  39.34 
 
 		 417 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0456  multidrug resistance protein  39.34 
 
 		 457 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0717  putative multidrug resistance protein  39.34 
 
 		 457 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.053035  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1987  putative multidrug resistance protein  39.34 
 
 		 457 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0847932  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0192  multidrug resistance protein A  39.34 
 
 		 417 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1914  multidrug resistance efflux pump  39.34 
 
 		 417 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1416  multidrug resistance protein  39.34 
 
 		 457 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.304514  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1013  putative multidrug resistance protein  39.34 
 
 		 417 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3163  efflux pump membrane protein  37.83 
 
 		 390 aa  182  6e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0732  multidrug resistance secretion protein  39.04 
 
 		 489 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3490  secretion protein HlyD family protein  39.08 
 
 		 448 aa  182  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.592297  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1634  secretion protein HlyD family protein  37.57 
 
 		 453 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.975133  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1825  multidrug resistance protein  39.04 
 
 		 489 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.996701  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3230  secretion protein HlyD family protein  39.56 
 
 		 395 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.267939 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3486  efflux pump membrane protein  33.43 
 
 		 391 aa  179  4.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3743  efflux pump membrane protein  33.13 
 
 		 390 aa  179  8e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.881561  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2078  secretion protein HlyD family protein  37.1 
 
 		 397 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3330  efflux pump membrane protein  33.43 
 
 		 391 aa  177  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1515  secretion protein HlyD  35.52 
 
 		 405 aa  176  7e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.498978  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3120  multidrug resistance protein A  36.84 
 
 		 390 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0308659 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2997  multidrug resistance protein A  36.84 
 
 		 390 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2931  multidrug resistance protein A  36.84 
 
 		 390 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3014  multidrug resistance protein A  36.84 
 
 		 390 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193784 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0562  HlyD family secretion protein  37.96 
 
 		 396 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2962  multidrug resistance protein A  36.84 
 
 		 390 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.832708  hitchhiker  0.00715907 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3930  multidrug resistance protein A  34.73 
 
 		 394 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.725166 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>