131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4159 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_4159  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  100 
 
 
295 aa  608  1e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0604  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  51.8 
 
 
155 aa  145  9e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4021  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  50.75 
 
 
157 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2306  hypothetical protein  49.64 
 
 
157 aa  132  5e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.674138  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4500  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  39.86 
 
 
146 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833259  normal  0.818323 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2725  hypothetical protein  44.53 
 
 
143 aa  116  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0307371  normal  0.0145206 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3225  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  40.71 
 
 
145 aa  114  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4102  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  40.88 
 
 
154 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1147  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  37.93 
 
 
147 aa  110  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5413  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.81 
 
 
156 aa  100  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0639907 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1710  hypothetical protein  34.04 
 
 
147 aa  99  7e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0511  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  39.86 
 
 
159 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.742769  normal  0.149633 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2400  hypothetical protein  35.21 
 
 
174 aa  96.3  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2420  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.97 
 
 
149 aa  95.1  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1205  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  40.83 
 
 
165 aa  94  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567309  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3940  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  41.23 
 
 
192 aa  91.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.494752  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2682  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  42.86 
 
 
165 aa  89.4  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0775646 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2931  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.9 
 
 
165 aa  87.4  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000531059  hitchhiker  0.000870821 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1380  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.43 
 
 
191 aa  75.5  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1216  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.03 
 
 
290 aa  73.9  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2192  activator of Hsp90 ATPase-like protein  32.73 
 
 
157 aa  71.2  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4061  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  42.35 
 
 
161 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2387  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30 
 
 
162 aa  70.9  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.378014 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4554  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  41.18 
 
 
161 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1335  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  41.18 
 
 
161 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.298031 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0499  activator of HSP90 ATPase 1 family protein  28.06 
 
 
148 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.218418  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5728  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  44.44 
 
 
169 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668366  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36650  hypothetical protein  31.72 
 
 
158 aa  66.6  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3346  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.05 
 
 
157 aa  65.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.398395  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2806  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.61 
 
 
157 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3849  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  38.82 
 
 
161 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2108  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.16 
 
 
158 aa  62.8  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00881054  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4182  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.21 
 
 
154 aa  62.4  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0911379 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2048  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.29 
 
 
158 aa  61.6  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.114132  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0005  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.41 
 
 
160 aa  62  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.341386  hitchhiker  0.000491866 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1959  hypothetical protein  30.2 
 
 
319 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232061  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2214  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.25 
 
 
322 aa  59.3  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7745  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32 
 
 
171 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1131  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.63 
 
 
163 aa  57.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.805713  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1855  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.67 
 
 
176 aa  57.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3813  hypothetical protein  35.87 
 
 
163 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.691325  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4120  hypothetical protein  31.3 
 
 
169 aa  56.6  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2859  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  39.53 
 
 
165 aa  56.6  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.420131 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3957  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.78 
 
 
163 aa  55.8  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3703  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.71 
 
 
159 aa  55.5  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.893545  normal  0.913769 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1126  activator of Hsp90 ATPase-like protein  28.68 
 
 
160 aa  55.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3552  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.72 
 
 
165 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5371  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.33 
 
 
161 aa  55.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3870  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.9 
 
 
163 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102029  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2882  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  40 
 
 
162 aa  55.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0105994 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1015  Hsp90 ATPase activator family protein  33.02 
 
 
158 aa  53.9  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.93281  normal  0.482465 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3783  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.06 
 
 
159 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0529  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.06 
 
 
159 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0553  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.06 
 
 
159 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4897  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.57 
 
 
164 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.486894  normal  0.32007 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0557  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.06 
 
 
159 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0189  hypothetical protein  33.33 
 
 
161 aa  53.5  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.398373 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3952  hypothetical protein  25.68 
 
 
165 aa  53.5  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.040762  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4113  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.78 
 
 
151 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.893389 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4077  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.7 
 
 
155 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0406146  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4445  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.7 
 
 
155 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6172  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.78 
 
 
186 aa  52.8  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0106151  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0823  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30 
 
 
161 aa  52.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2032  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.5 
 
 
155 aa  52.4  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100509  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1189  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  37.5 
 
 
165 aa  52.4  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.437903 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5343  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.25 
 
 
161 aa  52.4  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.621286  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4802  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.33 
 
 
161 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2779  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  38.46 
 
 
161 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.192987  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2453  hypothetical protein  37.5 
 
 
157 aa  51.6  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.924775  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5401  activator of Hsp90 ATPase-like protein  30.12 
 
 
161 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5460  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.12 
 
 
161 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2366  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.37 
 
 
165 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.370812  normal  0.678688 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1042  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  37.31 
 
 
145 aa  50.4  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293314  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0835  hypothetical protein  38.46 
 
 
158 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4809  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.12 
 
 
161 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.208056  normal  0.888607 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4558  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.85 
 
 
156 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.801675 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0992  glutathione S-transferase-like transmembrane protein  29.36 
 
 
360 aa  50.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644569  normal  0.256398 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0476  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.41 
 
 
160 aa  50.4  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  unclonable  0.0000000161717  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1108  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.33 
 
 
149 aa  50.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0940  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.88 
 
 
150 aa  49.7  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2147  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.25 
 
 
167 aa  49.7  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3251  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.39 
 
 
165 aa  49.3  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2327  activator of Hsp90 ATPase 1-like protein  28.67 
 
 
165 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.301535  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2374  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.67 
 
 
165 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.739133  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6033  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  23.08 
 
 
167 aa  48.9  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000241062  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3123  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  22.82 
 
 
162 aa  49.3  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603064  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2839  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.89 
 
 
169 aa  48.9  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.171583 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4095  hypothetical protein  32.17 
 
 
286 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1110  hypothetical protein  27.63 
 
 
167 aa  48.9  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000475267  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4171  hypothetical protein  32.17 
 
 
286 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4326  hypothetical protein  32.17 
 
 
286 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0121723  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0849  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.82 
 
 
160 aa  48.9  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.442029  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2115  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.71 
 
 
168 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.312294  decreased coverage  0.0026302 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0934  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.45 
 
 
160 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0817  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.84 
 
 
160 aa  47.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2148  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.83 
 
 
166 aa  47.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1819  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  25.69 
 
 
142 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.154967 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5333  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.62 
 
 
149 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0286  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.33 
 
 
153 aa  47.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1376  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  43.75 
 
 
162 aa  47  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>