18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4079 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4079  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  320  7e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241871 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2434  hypothetical protein  36.96 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.137351  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0537  hypothetical protein  37.5 
 
 		 160 aa  73.6  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3117  hypothetical protein  46.91 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100633  normal  0.0374199 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3472  hypothetical protein  45.68 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2333  hypothetical protein  41.49 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00580597  hitchhiker  0.00510153 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3179  hypothetical protein  51.79 
 
 		 81 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0170  hypothetical protein  37.23 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01170  hypothetical protein  37.23 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.283554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  47.62 
 
 		 731 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  47.62 
 
 		 734 aa  44.3  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  47.62 
 
 		 734 aa  44.3  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  47.62 
 
 		 734 aa  44.3  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  47.62 
 
 		 734 aa  44.3  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  47.62 
 
 		 734 aa  44.3  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  47.62 
 
 		 734 aa  44.3  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  45.24 
 
 		 731 aa  44.3  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4429  Rhs element Vgr protein  34.55 
 
 		 724 aa  41.2  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>