More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3832 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3832  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 		 552 aa  1072    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.826992 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3384  putative apolipoprotein N-acyltransferase transmembrane  59.65 
 
 		 526 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.466672 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0524  apolipoprotein N-acyltransferase  54.86 
 
 		 532 aa  436  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0553952 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0440  apolipoprotein N-acyltransferase  55.09 
 
 		 516 aa  432  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0540  apolipoprotein N-acyltransferase  54.48 
 
 		 532 aa  431  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1272  apolipoprotein N-acyltransferase  53.37 
 
 		 550 aa  425  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4762  apolipoprotein N-acyltransferase  54.66 
 
 		 529 aa  422  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.219906  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2158  apolipoprotein N-acyltransferase  53.17 
 
 		 536 aa  421  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4208  apolipoprotein N-acyltransferase  50.95 
 
 		 548 aa  402  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0527  apolipoprotein N-acyltransferase  46.41 
 
 		 523 aa  369  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.776126  normal  0.0299872 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3697  apolipoprotein N-acyltransferase  46.83 
 
 		 574 aa  367  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0418  apolipoprotein N-acyltransferase  46.11 
 
 		 503 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  0.927373 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0403  apolipoprotein N-acyltransferase  45.71 
 
 		 503 aa  358  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.44742 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2616  apolipoprotein N-acyltransferase  43.9 
 
 		 562 aa  352  7e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0449  apolipoprotein N-acyltransferase  46.41 
 
 		 510 aa  352  8.999999999999999e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0202397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2726  apolipoprotein N-acyltransferase  43.64 
 
 		 567 aa  351  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2751  apolipoprotein N-acyltransferase  44.08 
 
 		 562 aa  347  3e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444108  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0510  apolipoprotein N-acyltransferase  45.77 
 
 		 524 aa  347  4e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.511831  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4184  apolipoprotein N-acyltransferase  54.61 
 
 		 534 aa  347  4e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39031 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3334  apolipoprotein N-acyltransferase  42.86 
 
 		 582 aa  345  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.499479  normal  0.16189 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0625  apolipoprotein N-acyltransferase  42.14 
 
 		 567 aa  342  8e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0407  apolipoprotein N-acyltransferase  42.69 
 
 		 564 aa  342  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.78277  normal  0.233372 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6026  apolipoprotein N-acyltransferase  43.25 
 
 		 562 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0600  apolipoprotein N-acyltransferase  43.45 
 
 		 553 aa  340  5.9999999999999996e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0586  apolipoprotein N-acyltransferase  41 
 
 		 571 aa  336  5e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2087  apolipoprotein N-acyltransferase  42.24 
 
 		 567 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.187747  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2699  apolipoprotein N-acyltransferase  42.24 
 
 		 567 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000283733  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2380  apolipoprotein N-acyltransferase  39.96 
 
 		 532 aa  298  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000838838  hitchhiker  0.0000262387 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1566  apolipoprotein N-acyltransferase  37.37 
 
 		 500 aa  271  2e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.910854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3531  apolipoprotein N-acyltransferase  37.61 
 
 		 487 aa  261  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0261601 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2584  apolipoprotein N-acyltransferase  40.94 
 
 		 520 aa  260  5.0000000000000005e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.111585 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1862  apolipoprotein N-acyltransferase  34.6 
 
 		 503 aa  257  5e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.480638  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0646  apolipoprotein N-acyltransferase  37.9 
 
 		 497 aa  253  6e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0703  apolipoprotein N-acyltransferase  50.97 
 
 		 568 aa  253  9.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0883  apolipoprotein N-acyltransferase  50.97 
 
 		 568 aa  253  9.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.409344  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0869  apolipoprotein N-acyltransferase  39.96 
 
 		 509 aa  252  9.000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0718  apolipoprotein N-acyltransferase  50.97 
 
 		 568 aa  253  9.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.428564  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2726  apolipoprotein N-acyltransferase  50.58 
 
 		 568 aa  251  3e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0220  apolipoprotein N-acyltransferase  50.58 
 
 		 568 aa  251  3e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2352  apolipoprotein N-acyltransferase  50.58 
 
 		 568 aa  251  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2432  apolipoprotein N-acyltransferase  50.58 
 
 		 568 aa  251  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.959301  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0552  apolipoprotein N-acyltransferase  36.6 
 
 		 500 aa  236  9e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3783  apolipoprotein N-acyltransferase  37.47 
 
 		 507 aa  217  4e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.299433 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4666  apolipoprotein N-acyltransferase  35.21 
 
 		 505 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.372109  normal  0.737188 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4844  apolipoprotein N-acyltransferase  35.01 
 
 		 505 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.552658  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4790  apolipoprotein N-acyltransferase  35.01 
 
 		 505 aa  213  7e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.295792 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4808  apolipoprotein N-acyltransferase  35.61 
 
 		 506 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0241  apolipoprotein N-acyltransferase  33.33 
 
 		 521 aa  213  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0630  apolipoprotein N-acyltransferase  34.41 
 
 		 505 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.112466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2288  apolipoprotein N-acyltransferase  37.07 
 
 		 507 aa  204  3e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1455  apolipoprotein N-acyltransferase  35.66 
 
 		 504 aa  204  5e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0063424  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4349  apolipoprotein N-acyltransferase  35.61 
 
 		 506 aa  202  9e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0678  apolipoprotein N-acyltransferase  31.94 
 
 		 512 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4954  apolipoprotein N-acyltransferase  33.73 
 
 		 507 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2927  apolipoprotein N-acyltransferase  33.01 
 
 		 537 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.974187  decreased coverage  0.00828182 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2988  apolipoprotein N-acyltransferase  31.94 
 
 		 512 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0704  apolipoprotein N-acyltransferase  31.94 
 
 		 512 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0590  apolipoprotein N-acyltransferase  31.75 
 
 		 512 aa  197  3e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0686  apolipoprotein N-acyltransferase  31.94 
 
 		 512 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00162787  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1403  apolipoprotein N-acyltransferase  34.72 
 
 		 479 aa  197  5.000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2969  apolipoprotein N-acyltransferase  31.75 
 
 		 512 aa  196  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.948045  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0749  apolipoprotein N-acyltransferase  31.75 
 
 		 512 aa  196  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.209793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0771  apolipoprotein N-acyltransferase  31.44 
 
 		 529 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1193  apolipoprotein N-acyltransferase  31.4 
 
 		 509 aa  194  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2952  apolipoprotein N-acyltransferase  32.38 
 
 		 509 aa  193  5e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  30.28 
 
 		 510 aa  193  5e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0531  apolipoprotein N-acyltransferase  29.84 
 
 		 524 aa  194  5e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0307226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  30.84 
 
 		 509 aa  193  6e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0820  apolipoprotein N-acyltransferase  31.26 
 
 		 529 aa  193  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0710  apolipoprotein N-acyltransferase  31.26 
 
 		 529 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.145232  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0784  apolipoprotein N-acyltransferase  31.26 
 
 		 529 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1183  apolipoprotein N-acyltransferase  31.11 
 
 		 512 aa  192  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2859  apolipoprotein N-acyltransferase  30.64 
 
 		 518 aa  192  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0725  apolipoprotein N-acyltransferase  31.26 
 
 		 529 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.84443 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1180  apolipoprotein N-acyltransferase  34.17 
 
 		 509 aa  192  1e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1215  apolipoprotein N-acyltransferase  30.38 
 
 		 509 aa  192  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.814042  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2742  apolipoprotein N-acyltransferase  30.83 
 
 		 514 aa  189  8e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.447637  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0992  apolipoprotein N-acyltransferase  29.64 
 
 		 501 aa  189  9e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192008  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00616  hypothetical protein  31.79 
 
 		 508 aa  189  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00625  apolipoprotein N-acyltransferase  31.79 
 
 		 512 aa  189  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1104  apolipoprotein N-acyltransferase  30.71 
 
 		 511 aa  188  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1177  apolipoprotein N-acyltransferase  31.85 
 
 		 518 aa  187  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3475  apolipoprotein N-acyltransferase  31.15 
 
 		 519 aa  187  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00817837 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1000  apolipoprotein N-acyltransferase  32.69 
 
 		 516 aa  187  4e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.671685  normal  0.0816035 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0398  apolipoprotein N-acyltransferase  35.89 
 
 		 505 aa  186  7e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.415751 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1343  apolipoprotein N-acyltransferase  31.9 
 
 		 522 aa  186  8e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.528625 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3576  apolipoprotein N-acyltransferase  31.32 
 
 		 532 aa  185  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.708418  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2276  apolipoprotein N-acyltransferase  31.3 
 
 		 524 aa  185  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039204 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1004  apolipoprotein N-acyltransferase  31.98 
 
 		 516 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.13359 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1065  apolipoprotein N-acyltransferase  31.99 
 
 		 519 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0720615 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1834  apolipoprotein N-acyltransferase  31.07 
 
 		 515 aa  184  5.0000000000000004e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3009  apolipoprotein N-acyltransferase  31.07 
 
 		 515 aa  184  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333345  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2919  apolipoprotein N-acyltransferase  31.07 
 
 		 515 aa  184  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.476447  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004215  apolipoprotein N-acyltransferase/copper homeostasis protein CutE  31.24 
 
 		 492 aa  183  6e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3700  apolipoprotein N-acyltransferase  30.31 
 
 		 515 aa  183  9.000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.582606  hitchhiker  0.0000254581 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2579  apolipoprotein N-acyltransferase  32.65 
 
 		 511 aa  181  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.170018 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0601  apolipoprotein N-acyltransferase  34.84 
 
 		 501 aa  180  4.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.180307  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0752  apolipoprotein N-acyltransferase  34.84 
 
 		 506 aa  181  4.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179484 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1976  apolipoprotein N-acyltransferase  30.43 
 
 		 524 aa  179  1e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3141  apolipoprotein N-acyltransferase  30.02 
 
 		 511 aa  177  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218924  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>