34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2963 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2963  addiction module antitoxin  100 
 
 		 82 aa  169  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0045  addiction module toxin, Txe/YoeB family  81.71 
 
 		 87 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0870  addiction module toxin, Txe/YoeB family  82.93 
 
 		 87 aa  142  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0995  addiction module toxin, Txe/YoeB family  82.93 
 
 		 87 aa  142  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000552996 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1786  addiction module antitoxin  70.73 
 
 		 87 aa  133  7.000000000000001e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0074  addiction module toxin, Txe/YoeB family  67.07 
 
 		 87 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2607  addiction module antitoxin  65.85 
 
 		 86 aa  124  5e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1444  addiction module antitoxin  62.2 
 
 		 88 aa  120  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2262  addiction module antitoxin  58.02 
 
 		 87 aa  111  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1792  addiction module toxin, Txe/YoeB family  52.44 
 
 		 86 aa  99  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00863649  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1546  addiction module toxin, Txe/YoeB family  44.44 
 
 		 83 aa  77.4  0.00000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2483  addiction module antitoxin  40.26 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000373536  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2532  addiction module antitoxin  40.26 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000423523  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1069  addiction module antitoxin  41.94 
 
 		 87 aa  48.9  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0150746  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0408  addiction module antitoxin  37.5 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1914  addiction module toxin, Txe/YoeB family  35.44 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.197828  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1930  addiction module toxin, Txe/YoeB  34.72 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2586  addiction module toxin, Txe/YoeB family  32.79 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2939  hypothetical protein  36.14 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2478  addiction module toxin, Txe/YoeB family  31.25 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0336  hypothetical protein  35.14 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.689811  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0703  addiction module toxin, Txe/YoeB family  45.83 
 
 		 233 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.564313  normal  0.609374 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3630  addiction module toxin, Txe/YoeB family  31.25 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1443  addiction module toxin, Txe/YoeB family  30.59 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.403552  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1700  addiction module antitoxin  39.66 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4647  addiction module toxin, Txe/YoeB family  39.66 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00453645  normal  0.644511 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13394  hypothetical protein  36.59 
 
 		 85 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0756561 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2859  addiction module toxin, Txe/YoeB family  35.9 
 
 		 86 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.141742 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0312  addiction module antitoxin  39.29 
 
 		 84 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1844  hypothetical protein  39.66 
 
 		 86 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.891967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0706  addiction module toxin, Txe/YoeB family  30.77 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5886  addiction module antitoxin  36.84 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5486  addiction module toxin, Txe/YoeB  36.84 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.617612 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2573  addiction module toxin, Txe/YoeB family  45.24 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000405967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>