More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2864 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1992  GTP-binding protein EngA  80.58 
 
 		 446 aa  748    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.916192  normal  0.0223311 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2864  GTP-binding protein EngA  100 
 
 		 448 aa  912    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1428  GTP-binding protein EngA  75.17 
 
 		 447 aa  686    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0495777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2191  GTP-binding protein EngA  74.5 
 
 		 447 aa  681    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2303  GTP-binding protein EngA  71.08 
 
 		 447 aa  665    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0637103  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2604  GTP-binding protein EngA  74.83 
 
 		 447 aa  699    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156486  normal  0.601696 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1094  GTP-binding protein EngA  73.66 
 
 		 447 aa  653    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1174  GTP-binding protein EngA  73.44 
 
 		 447 aa  650    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.810632 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5015  GTP-binding protein EngA  74.27 
 
 		 448 aa  674    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0076  GTP-binding protein EngA  69.33 
 
 		 468 aa  634    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1876  GTP-binding protein EngA  72.93 
 
 		 445 aa  682    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.900999 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2082  GTP-binding protein EngA  63.84 
 
 		 447 aa  595  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.543675  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2537  GTP-binding protein EngA  63.68 
 
 		 445 aa  592  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358302  hitchhiker  0.0000595621 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1341  GTP-binding protein EngA  63.53 
 
 		 445 aa  591  1e-168  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.380293  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0066  GTP-binding protein EngA  63.53 
 
 		 445 aa  591  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.225046  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2350  GTP-binding protein EngA  63.53 
 
 		 445 aa  591  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1830  GTP-binding protein EngA  63.53 
 
 		 460 aa  591  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2185  GTP-binding protein EngA  63.53 
 
 		 445 aa  591  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.880216  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2238  GTP-binding protein EngA  63.31 
 
 		 445 aa  592  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.746998  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2102  GTP-binding protein EngA  63.17 
 
 		 447 aa  592  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0508209  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1102  GTP-binding protein EngA  63.53 
 
 		 445 aa  591  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.90536  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2223  GTP-binding protein EngA  63.53 
 
 		 445 aa  591  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1832  GTP-binding protein EngA  63.23 
 
 		 445 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.519459 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6271  GTP-binding protein EngA  63.23 
 
 		 445 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1808  GTP-binding protein EngA  63.23 
 
 		 445 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1219  GTP-binding protein EngA  62.86 
 
 		 447 aa  587  1e-166  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0055991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5109  GTP-binding protein EngA  63 
 
 		 445 aa  587  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1598  GTP-binding protein EngA  63.23 
 
 		 445 aa  587  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0111864  normal  0.122269 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1746  GTP-binding protein EngA  62.78 
 
 		 445 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1467  GTP-binding protein EngA  63.23 
 
 		 445 aa  585  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496612  normal  0.453892 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1719  GTP-binding protein EngA  62.33 
 
 		 445 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.576586 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1416  GTP-binding protein EngA  62.28 
 
 		 446 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000592606 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1155  GTP-binding protein EngA  62.53 
 
 		 447 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1063  GTP-binding protein EngA  61.74 
 
 		 447 aa  580  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1287  GTP-binding protein EngA  62.64 
 
 		 454 aa  574  1.0000000000000001e-162  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.720297  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0668  GTP-binding protein EngA  61.78 
 
 		 454 aa  564  1.0000000000000001e-159  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2981  GTP-binding protein EngA  60.63 
 
 		 443 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2373  GTP-binding protein EngA  58.84 
 
 		 466 aa  534  1e-150  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.537703  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1614  GTP-binding protein EngA  56.15 
 
 		 499 aa  531  1e-150  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106208 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3386  GTP-binding protein EngA  56.95 
 
 		 442 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0598  GTP-binding protein EngA  57.37 
 
 		 469 aa  506  9.999999999999999e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1172  GTP-binding protein EngA  50.86 
 
 		 489 aa  476  1e-133  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.120565  normal  0.243836 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1438  GTP-binding protein EngA  50.67 
 
 		 471 aa  464  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.432419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1131  GTP-binding protein EngA  51.9 
 
 		 473 aa  464  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2045  GTP-binding protein EngA  53.81 
 
 		 464 aa  462  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40240  GTP-binding protein EngA  51.5 
 
 		 491 aa  460  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1315  GTP-binding protein EngA  50.43 
 
 		 493 aa  455  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4247  GTP-binding protein EngA  47.91 
 
 		 498 aa  455  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1360  small GTP-binding protein  51.12 
 
 		 445 aa  458  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.508315  hitchhiker  0.00000394324 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3496  GTP-binding protein EngA  51.29 
 
 		 492 aa  457  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3010  GTP-binding protein EngA  48.41 
 
 		 495 aa  456  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3308  GTP-binding protein EngA  49.78 
 
 		 487 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1498  GTP-binding protein EngA  49.55 
 
 		 462 aa  452  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1262  GTP-binding protein EngA  47.99 
 
 		 495 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.763175  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2713  GTP-binding protein EngA  47.98 
 
 		 490 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004345  GTP-binding protein EngA  49.05 
 
 		 498 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1232  GTP-binding protein EngA  49.57 
 
 		 488 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1303  GTP-binding protein EngA  49.78 
 
 		 488 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14930  GTP-binding protein EngA  50.21 
 
 		 493 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1233  GTP-binding protein EngA  49.57 
 
 		 488 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4321  GTP-binding protein EngA  50 
 
 		 487 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000597657 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1485  GTP-binding protein EngA  49.55 
 
 		 462 aa  449  1e-125  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02977  GTP-binding protein EngA  47.71 
 
 		 481 aa  451  1e-125  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2648  GTP-binding protein EngA  49.78 
 
 		 488 aa  450  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2733  GTP-binding protein EngA  47.67 
 
 		 494 aa  450  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.406323  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1297  GTP-binding protein EngA  47.48 
 
 		 495 aa  449  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1190  GTP-binding protein EngA  47.48 
 
 		 495 aa  449  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000499446  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0596  GTP-binding protein EngA  50.78 
 
 		 467 aa  451  1e-125  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115321  hitchhiker  0.00000000000000451977 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0414  GTP-binding protein EngA  47.48 
 
 		 495 aa  449  1e-125  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0317617  hitchhiker  0.000999032 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0733  GTP-binding protein EngA  47.57 
 
 		 500 aa  449  1e-125  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02403  GTP-binding protein EngA  47.65 
 
 		 490 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000560332  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1157  small GTP-binding protein  47.65 
 
 		 490 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000141762  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2886  GTP-binding protein EngA  47.65 
 
 		 490 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000684219  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1122  GTP-binding protein EngA  47.16 
 
 		 497 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.827994  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3735  GTP-binding protein EngA  47.65 
 
 		 490 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0134821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02365  hypothetical protein  47.65 
 
 		 490 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00134909  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3005  GTP-binding protein EngA  47.86 
 
 		 490 aa  446  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.198767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2795  GTP-binding protein EngA  47.65 
 
 		 490 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000215643  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2663  GTP-binding protein EngA  47.65 
 
 		 490 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.194974 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1260  GTP-binding protein EngA  48.6 
 
 		 491 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00475437  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1759  GTP-binding protein EngA  50.22 
 
 		 473 aa  447  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739039 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0292  GTP-binding protein EngA  48.41 
 
 		 494 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2662  GTP-binding protein EngA  47.65 
 
 		 490 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000307508  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1166  GTP-binding protein EngA  47.65 
 
 		 490 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000585661  normal  0.0127623 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01071  GTP-binding protein EngA  47.79 
 
 		 498 aa  448  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0857  GTP-binding protein EngA  49.02 
 
 		 487 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2203  ribosome-associated GTPase EngA  51.11 
 
 		 567 aa  442  1e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4597  GTP-binding protein EngA  49.24 
 
 		 490 aa  442  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0900  GTP-binding protein EngA  49.57 
 
 		 487 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000256408 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1120  GTP-binding protein EngA  49.57 
 
 		 488 aa  442  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1438  GTP-binding protein EngA  49.02 
 
 		 489 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1937  GTP-binding protein EngA  48.08 
 
 		 449 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3001  GTP-binding protein EngA  48.92 
 
 		 488 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3605  GTP-binding protein EngA  47.17 
 
 		 494 aa  441  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2986  GTP-binding protein EngA  48.92 
 
 		 488 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.306969  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3122  GTP-binding protein EngA  48.26 
 
 		 482 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3144  GTP-binding protein EngA  48.92 
 
 		 488 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0749903 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1325  GTP-binding protein EngA  45.66 
 
 		 511 aa  440  9.999999999999999e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.359502  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1309  GTP-binding protein EngA  48.18 
 
 		 490 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00502538  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1609  GTP-binding protein EngA  48.08 
 
 		 449 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0528486 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>