13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2279 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2279  hypothetical protein  100 
 
 		 61 aa  125  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2721  hypothetical protein  53.85 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.242146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1659  hypothetical protein  54.17 
 
 		 206 aa  54.3  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0648  hypothetical protein  45.76 
 
 		 208 aa  52.4  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2120  hypothetical protein  44.07 
 
 		 208 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000120456  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2660  hypothetical protein  43.86 
 
 		 206 aa  50.4  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2914  hypothetical protein  45.9 
 
 		 206 aa  49.7  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0442485  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4126  hypothetical protein  44.26 
 
 		 206 aa  48.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000019692 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2073  hypothetical protein  46.15 
 
 		 211 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0007392  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0656  hypothetical protein  41.38 
 
 		 204 aa  44.3  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000158351  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0781  hypothetical protein  41.38 
 
 		 204 aa  44.3  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000208044  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0212  hypothetical protein  48.94 
 
 		 212 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.017642  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0652  hypothetical protein  39.06 
 
 		 216 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>