More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2216 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_2216  peptidase M16 domain-containing protein  100 
 
 
431 aa  877    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.437046 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3015  peptidase M16 domain-containing protein  47.06 
 
 
444 aa  323  3e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.144347  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3753  peptidase M16 domain-containing protein  43.22 
 
 
455 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.703348  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0269  peptidase M16 domain protein  33.92 
 
 
431 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3449  processing peptidase  35.09 
 
 
431 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.847529  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0175  M16 family peptidase  33.33 
 
 
423 aa  200  3.9999999999999996e-50  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0721  peptidase M16 domain-containing protein  32.21 
 
 
421 aa  200  5e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.257658 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0621  processing peptidase  33.73 
 
 
419 aa  199  6e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0481  processing peptidase  33.73 
 
 
419 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.130826  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2340  processing peptidase  33.92 
 
 
431 aa  197  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.348853  normal  0.675898 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4314  peptidase M16 domain-containing protein  32.69 
 
 
421 aa  197  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.518498  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3253  processing peptidase  34.74 
 
 
431 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00529384 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3577  processing peptidase  34.99 
 
 
431 aa  196  6e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1832  M16 family peptidase  33.49 
 
 
419 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2329  peptidase  33.75 
 
 
420 aa  195  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.124129  normal  0.969107 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1252  peptidase M16 domain protein  33.17 
 
 
421 aa  195  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3148  processing peptidase  34.36 
 
 
419 aa  190  5e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.873383  normal  0.591857 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2056  peptidase M16 domain protein  31.79 
 
 
413 aa  189  7e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1163  processing peptidase  29.93 
 
 
413 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0385172  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2457  peptidase M16 domain-containing protein  29.5 
 
 
412 aa  186  8e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0190406  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0775  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  26.13 
 
 
421 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1637  processing peptidase  25.98 
 
 
418 aa  184  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1074  peptidase family M16  30.17 
 
 
434 aa  183  4.0000000000000006e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0235  M16 family peptidase  26.49 
 
 
421 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0419  peptidase M16-like protein  28.92 
 
 
419 aa  182  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1589  processing peptidase  32.77 
 
 
431 aa  180  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0398438 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3953  peptidase M16 domain protein  32.07 
 
 
459 aa  179  5.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.870658  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1147  processing peptidase  32.02 
 
 
426 aa  180  5.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3564  zinc protease  28.88 
 
 
413 aa  179  7e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3546  zinc protease  28.64 
 
 
413 aa  179  9e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1907  peptidase M16 domain-containing protein  29.88 
 
 
419 aa  179  9e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0978353  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3852  zinc protease, insulinase family  28.64 
 
 
413 aa  179  9e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000305728  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3816  zinc protease, insulinase family  28.64 
 
 
413 aa  179  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.238e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3843  zinc protease  28.64 
 
 
413 aa  179  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3656  zinc protease  28.64 
 
 
413 aa  179  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.200109  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3627  peptidase M16 domain-containing protein  28.64 
 
 
413 aa  179  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257155  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1592  peptidase M16-like  31.3 
 
 
418 aa  179  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0267121  normal  0.0196738 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3903  zinc protease, insulinase family  28.64 
 
 
413 aa  179  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.141801  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3942  zinc protease  28.64 
 
 
413 aa  179  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3234  processing peptidase  31.93 
 
 
421 aa  178  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1594  M16 family peptidase  30 
 
 
418 aa  177  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.326709  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0759  peptidase M16-like  31.74 
 
 
430 aa  176  5e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0678  peptidase M16 domain-containing protein  32.77 
 
 
424 aa  176  9e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.614007  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3525  peptidase M16 domain-containing protein  30.7 
 
 
421 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.855558  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2222  peptidase M16 domain protein  31.35 
 
 
451 aa  175  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000128075  normal  0.24695 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0535  processing peptidase  32.32 
 
 
434 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1414  processing peptidase  29.65 
 
 
410 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.272241  normal  0.186097 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1190  peptidase M16 domain-containing protein  32.76 
 
 
477 aa  172  9e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0547363  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1839  processing peptidase  30.58 
 
 
432 aa  172  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.814022  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1947  peptidase M16 domain-containing protein  30.79 
 
 
422 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000141516  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1706  peptidase M16 domain protein  26.11 
 
 
411 aa  170  4e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.425033  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5111  peptidase M16 domain-containing protein  30.62 
 
 
438 aa  170  5e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591794  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1568  peptidase M16-like  28.01 
 
 
425 aa  170  5e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000011969  decreased coverage  0.00224891 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1341  zinc protease, insulinase family  28.5 
 
 
399 aa  169  7e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.411991 
 
 
-
 
NC_004310  BR0483  processing protease  32.15 
 
 
430 aa  169  7e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.678653  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0488  zinc protease  32.15 
 
 
430 aa  169  9e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0964093  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0309  processing peptidase  30.35 
 
 
421 aa  167  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0115276 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1444  processing peptidase  30.07 
 
 
421 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.422023  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1562  Zn-dependent peptidase  29.29 
 
 
419 aa  167  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000390885  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0737  M16 family peptidase putative  28.12 
 
 
423 aa  166  1.0000000000000001e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.927788  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0411  M16 family peptidase  29.66 
 
 
422 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.887609  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2477  peptidase M16 domain protein  31.86 
 
 
445 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.424609  normal  0.386088 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1419  processing peptidase  23.82 
 
 
424 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0598  processing peptidase  31.68 
 
 
430 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.638398  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4497  peptidase M16 domain-containing protein  31.02 
 
 
422 aa  165  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.439835  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0908  peptidase M16 domain protein  29.56 
 
 
429 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1786  processing peptidase  30.59 
 
 
421 aa  164  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.41523  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1453  peptidase M16 domain protein  26.36 
 
 
417 aa  164  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.093065 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0823  peptidase M16-like  30.53 
 
 
429 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.215652 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1315  peptidase M16 domain protein  31.88 
 
 
418 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.298965  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1309  peptidase M16 domain protein  30.85 
 
 
418 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00910612  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1653  peptidase M16 domain protein  30.75 
 
 
418 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3177  peptidase M16 domain protein  27.82 
 
 
422 aa  163  6e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.56337  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0263  peptidase M16-like  29.98 
 
 
429 aa  163  7e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.736782  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1382  peptidase M16 domain-containing protein  28.81 
 
 
466 aa  162  8.000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.975318  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2188  peptidase M16 domain protein  28.05 
 
 
424 aa  161  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.344972  normal  0.666529 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4577  peptidase M16-like  29.56 
 
 
429 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2975  peptidase M16 domain protein  30.08 
 
 
418 aa  161  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000177641 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0037  processing peptidase  29.19 
 
 
424 aa  160  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0936  peptidase M16 domain-containing protein  30.39 
 
 
420 aa  160  4e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.891405  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3554  processing peptidase  32.1 
 
 
467 aa  159  7e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.106365  normal  0.417448 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4796  peptidase M16-like  30.26 
 
 
429 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2117  processing peptidase  28.3 
 
 
429 aa  158  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.971397  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0634  peptidase M16 domain protein  30.08 
 
 
432 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0596745 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1059  peptidase M16-like  29.8 
 
 
421 aa  157  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0076042  hitchhiker  0.00221195 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1507  peptidase M16 domain-containing protein  31.1 
 
 
451 aa  157  3e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.583967  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0691  peptidase M16 domain protein  30.08 
 
 
432 aa  157  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2732  peptidase M16 domain protein  28.57 
 
 
408 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.152899  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3667  peptidase M16 domain protein  27.76 
 
 
424 aa  156  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0840  putative zinc protease  29.82 
 
 
429 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.754247 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1312  peptidase M16 domain protein  28.71 
 
 
840 aa  154  2e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4022  peptidase M16 domain-containing protein  29.58 
 
 
424 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0571342 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2351  peptidase M16 domain-containing protein  29.9 
 
 
451 aa  153  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472755 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1069  peptidase M16 domain-containing protein  28.85 
 
 
435 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.421262  hitchhiker  0.00357472 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0230  peptidase M16  29.92 
 
 
429 aa  153  7e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1511  peptidase M16 domain protein  29.29 
 
 
424 aa  152  8e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.402742 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0603  peptidase M16 domain protein  32.52 
 
 
473 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14700  predicted Zn-dependent peptidase  29.66 
 
 
453 aa  152  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.2427  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0611  peptidase M16 domain protein  32.52 
 
 
473 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1340  peptidase M16 domain-containing protein  27.83 
 
 
462 aa  151  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000321073 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>