16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0031 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0031  hypothetical protein  100 
 
 		 473 aa  916    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.61903 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  28.86 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  53.42 
 
 		 840 aa  59.3  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44995  predicted protein  53.12 
 
 		 1217 aa  57.8  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00833272  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38966  predicted protein  52.86 
 
 		 555 aa  54.7  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00578111  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  39.68 
 
 		 1281 aa  51.6  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3351  peptidase M23B  44.74 
 
 		 687 aa  50.4  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0955739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4840  hypothetical protein  56.92 
 
 		 908 aa  48.9  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191443  hitchhiker  0.00180703 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  32.19 
 
 		 1888 aa  47.8  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48492  predicted protein  31.86 
 
 		 488 aa  46.6  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.439098  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  39.08 
 
 		 551 aa  46.6  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06210  Pol II transcription elongation factor, putative  48.61 
 
 		 1152 aa  45.1  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3050  fibronectin, type III  30.65 
 
 		 667 aa  44.7  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000157497  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  33.94 
 
 		 444 aa  44.7  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1781  SH3 type 3 domain protein  39.19 
 
 		 489 aa  43.5  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  32.52 
 
 		 458 aa  43.1  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>