39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0209 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0209  hypothetical protein  100 
 
 
79 aa  164  5e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000139685  normal  0.0119119 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1548  hypothetical protein  57.89 
 
 
84 aa  97.8  5e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0132  hypothetical protein  52.56 
 
 
87 aa  97.4  6e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.12929  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0528  hypothetical protein  51.28 
 
 
87 aa  97.1  8e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0456568  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0515  hypothetical protein  51.28 
 
 
87 aa  97.1  8e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000247738  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0214  hypothetical protein  55.13 
 
 
80 aa  94.4  5e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.615311  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1612  hypothetical protein  53.75 
 
 
81 aa  94  6e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0037  protein of unknown function DUF1021  51.32 
 
 
85 aa  85.5  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0052  veg protein  50 
 
 
86 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0039  veg protein  50 
 
 
86 aa  80.1  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0039  protein of unknown function DUF1021  50 
 
 
85 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0144278  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0038  hypothetical protein  50 
 
 
103 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0048  veg protein  50 
 
 
86 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5268  veg protein  50 
 
 
86 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.868803  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0048  veg protein  50 
 
 
86 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.503705  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0038  hypothetical protein  50 
 
 
87 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0039  veg protein  50 
 
 
86 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0041  veg protein  50 
 
 
86 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0042  veg protein  50 
 
 
86 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0041  veg protein  50 
 
 
86 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0170  protein of unknown function DUF1021  49.3 
 
 
91 aa  70.9  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105171  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0020  protein of unknown function DUF1021  45.71 
 
 
88 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2401  hypothetical protein  40.79 
 
 
88 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.273851  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0597  hypothetical protein  45.83 
 
 
89 aa  61.6  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0057  hypothetical protein  40 
 
 
91 aa  61.6  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000870517 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2190  hypothetical protein  38.36 
 
 
78 aa  58.9  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.427413  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2480  hypothetical protein  38.36 
 
 
78 aa  58.9  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21690  hypothetical protein  42.65 
 
 
86 aa  55.5  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.484922  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0055  hypothetical protein  36.99 
 
 
92 aa  52.8  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000091606  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0048  protein of unknown function DUF1021  34.21 
 
 
88 aa  52  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2403  protein of unknown function DUF1021  33.33 
 
 
90 aa  49.3  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04930  hypothetical protein  33.8 
 
 
111 aa  49.3  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3814  hypothetical protein  29.73 
 
 
80 aa  47.4  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000228134  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07490  hypothetical protein  35.82 
 
 
112 aa  45.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.635673  normal  0.494829 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0403  protein of unknown function DUF1021  29.85 
 
 
78 aa  45.1  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0277649  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2656  hypothetical protein  32.35 
 
 
114 aa  44.7  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.214859 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0791  hypothetical protein  29.17 
 
 
85 aa  44.3  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00610853  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0168  protein of unknown function DUF1021  34.43 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.114258  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1974  hypothetical protein  34.29 
 
 
100 aa  40.4  0.009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0344944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>