More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0168 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0168  ribosomal protein S14  100 
 
 
85 aa  174  5e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000187537  hitchhiker  3.50786e-17 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1754  30S ribosomal protein S14  62.92 
 
 
89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00383016  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1360  30S ribosomal protein S14  64.04 
 
 
89 aa  114  6e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00133501  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1077  30S ribosomal protein S14  62.92 
 
 
89 aa  110  8.000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271481  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0905  30S ribosomal protein S14  58.43 
 
 
89 aa  100  9e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1424  30S ribosomal protein S14  58.43 
 
 
89 aa  99.4  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000838917  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1397  30S ribosomal protein S14  58.43 
 
 
89 aa  99.4  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000161259  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1030  SSU ribosomal protein S14P  59.55 
 
 
89 aa  97.4  5e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000126459  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05785  ribosomal protein S14  53.93 
 
 
89 aa  96.7  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0605  ribosomal protein S14  52.04 
 
 
98 aa  93.6  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0855  ribosomal protein S14  52.81 
 
 
89 aa  92  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1160  30S ribosomal protein S14  51.69 
 
 
89 aa  91.7  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000204573  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5491  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 
101 aa  91.3  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.363044  normal  0.0421593 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0285  ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  90.5  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.28128  normal  0.0141768 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12093  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 
101 aa  89  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000485433  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0384  30S ribosomal protein S14  48.31 
 
 
89 aa  88.2  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36480  SSU ribosomal protein S14P  43.56 
 
 
101 aa  87.4  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.833214 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1310  30S ribosomal protein S14  44.55 
 
 
101 aa  87  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1466  ribosomal protein S14  43.56 
 
 
101 aa  87  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170375  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3373  30S ribosomal protein S14  42.57 
 
 
101 aa  87  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.773446  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1925  30S ribosomal protein S14  48.31 
 
 
89 aa  86.3  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0161  ribosomal protein S14  43.56 
 
 
101 aa  85.5  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00400733 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0069  ribosomal protein S14  42 
 
 
100 aa  85.5  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.590343  normal  0.853303 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19170  30S ribosomal protein S14  42.16 
 
 
101 aa  85.1  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.205421  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2606  30S ribosomal protein S14  53.93 
 
 
89 aa  85.1  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531982  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3149  SSU ribosomal protein S14P  47.19 
 
 
89 aa  84.3  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.457334  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4356  ribosomal protein S14  47.19 
 
 
89 aa  84.3  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629115  normal  0.0416375 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3721  30S ribosomal protein S14  43.56 
 
 
101 aa  84  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5774  ribosomal protein S14  48.31 
 
 
89 aa  84  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0491474  normal  0.403708 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0615  ribosomal protein S14  48.31 
 
 
89 aa  84  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.969603 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0184  30S ribosomal protein S14  49.44 
 
 
89 aa  82.8  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.282468 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3919  30S ribosomal protein S14  43.56 
 
 
101 aa  82.8  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2051  30S ribosomal protein S14  48.31 
 
 
89 aa  82  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000573988  normal  0.404891 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2853  30S ribosomal protein S14  40.59 
 
 
101 aa  82.4  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544731  normal  0.525302 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3293  ribosomal protein S14  45.54 
 
 
101 aa  81.6  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2216  30S ribosomal protein S14  48.31 
 
 
89 aa  80.1  0.000000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000050188  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2283  30S ribosomal protein S14  46.07 
 
 
89 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000126284  hitchhiker  0.00301418 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1838  30S ribosomal protein S14  48.31 
 
 
89 aa  80.1  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.247662  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0194  30S ribosomal protein S14  47.19 
 
 
89 aa  78.6  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.482071  normal  0.975844 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1272  ribosomal protein S14  46.32 
 
 
95 aa  79  0.00000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3982  ribosomal protein S14  47.37 
 
 
95 aa  79.3  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1628  ribosomal protein S14  46.07 
 
 
89 aa  78.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2905  30S ribosomal protein S14  41.58 
 
 
101 aa  77.4  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.378522  normal  0.633116 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001729  SSU ribosomal protein S14p (S29e)  39.6 
 
 
101 aa  77  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000996787  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0557  ribosomal protein S14  44.94 
 
 
89 aa  77  0.00000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.67281  normal  0.167301 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0333  30S ribosomal protein S14  39.6 
 
 
101 aa  76.3  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000213488  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00743  30S ribosomal protein S14  39.6 
 
 
101 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0073  30S ribosomal protein S14  38.61 
 
 
101 aa  76.3  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000136211  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0302  30S ribosomal protein S14  47.19 
 
 
89 aa  75.1  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.394444  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00951  30S ribosomal protein S14  38.61 
 
 
101 aa  73.9  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288651  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03158  30S ribosomal protein S14  39.6 
 
 
101 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000309801  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0406  ribosomal protein S14  39.6 
 
 
101 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000311581  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3501  30S ribosomal protein S14  39.6 
 
 
101 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000690284  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3692  30S ribosomal protein S14  39.6 
 
 
101 aa  73.2  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000389079  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4630  30S ribosomal protein S14  39.6 
 
 
101 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000273788  normal  0.541186 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03109  hypothetical protein  39.6 
 
 
101 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000139286  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3790  30S ribosomal protein S14  39.6 
 
 
101 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683698  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0406  30S ribosomal protein S14  39.6 
 
 
101 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000372668  hitchhiker  0.0000137856 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3602  30S ribosomal protein S14  39.6 
 
 
101 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000121429  normal  0.0164764 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1921  30S ribosomal protein S14  39.6 
 
 
101 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2410  30S ribosomal protein S14  46.07 
 
 
89 aa  72.8  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00120885  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0170  30S ribosomal protein S14  36.63 
 
 
101 aa  72.4  0.000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0625334  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0308  ribosomal protein S14  41.58 
 
 
101 aa  72.4  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000208826  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0439  30S ribosomal protein S14  40.59 
 
 
101 aa  71.6  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000050629  hitchhiker  0.0000949985 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0502  30S ribosomal protein S14  42.57 
 
 
101 aa  71.6  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000100367  hitchhiker  0.00403438 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0497  30S ribosomal protein S14  42.57 
 
 
101 aa  71.6  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000674394  normal  0.0635916 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3696  30S ribosomal protein S14  38.61 
 
 
101 aa  70.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00964578  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1340  30S ribosomal protein S14  39.6 
 
 
101 aa  70.9  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843719  normal  0.149539 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3731  30S ribosomal protein S14  38.61 
 
 
101 aa  70.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0634763  normal  0.0239339 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3623  30S ribosomal protein S14  38.61 
 
 
101 aa  70.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00146543  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3511  ribosomal protein S14  41.18 
 
 
101 aa  70.9  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000387623  hitchhiker  0.0000000964765 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3794  30S ribosomal protein S14  38.61 
 
 
101 aa  70.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0963003  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3623  30S ribosomal protein S14  38.61 
 
 
101 aa  70.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000455836  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0296  30S ribosomal protein S14  50 
 
 
101 aa  70.9  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000386262  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3901  30S ribosomal protein S14  50 
 
 
101 aa  70.9  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000036501  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0596  30S ribosomal protein S14  50 
 
 
101 aa  70.9  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000010236  normal  0.493148 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0418  30S ribosomal protein S14  37.62 
 
 
101 aa  70.9  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000405009  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0209  30S ribosomal protein S14  36.63 
 
 
101 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434806  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4043  30S ribosomal protein S14  36.63 
 
 
101 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000318217  unclonable  0.00000000000274518 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4157  30S ribosomal protein S14  36.63 
 
 
101 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000237704  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2822  ribosomal protein S14  41 
 
 
100 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00224384 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3270  30S ribosomal protein S14  42 
 
 
100 aa  70.5  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0411187  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0213  30S ribosomal protein S14  36.63 
 
 
101 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000765112  unclonable  0.00000853869 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0212  30S ribosomal protein S14  35.64 
 
 
101 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000604107  hitchhiker  0.00000000141072 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0244  30S ribosomal protein S14  35.64 
 
 
101 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0226  30S ribosomal protein S14  37.62 
 
 
101 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000624437  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0212  30S ribosomal protein S14  35.64 
 
 
101 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000559885  unclonable  0.0000000000128265 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0207  30S ribosomal protein S14  35.64 
 
 
101 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000156094  hitchhiker  0.00711343 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3738  30S ribosomal protein S14  37.62 
 
 
101 aa  70.1  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000436001  decreased coverage  0.00101243 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0183  30S ribosomal protein S14  38.61 
 
 
101 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000146955  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2161  30S ribosomal protein S14  35.64 
 
 
101 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000755584  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0267  30S ribosomal protein S14  40.59 
 
 
101 aa  70.1  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0687464  normal  0.437866 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0161  30S ribosomal protein S14  36.63 
 
 
101 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000142165  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0197  30S ribosomal protein S14  35.64 
 
 
101 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337637  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2359  ribosomal protein S14  42.57 
 
 
101 aa  68.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3746  30S ribosomal protein S14  35.64 
 
 
101 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000320065  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2447  SSU ribosomal protein S14P  68.29 
 
 
61 aa  68.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.583376 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1262  30S ribosomal protein S14  51.85 
 
 
101 aa  69.3  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.536086  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0171  30S ribosomal protein S14  36.63 
 
 
101 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000191615  decreased coverage  0.0000502877 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4304  30S ribosomal protein S14  36.63 
 
 
101 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000890195  unclonable  0.0000000000539649 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>