10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_t0423 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_t0423  tRNA-Gln  100 
 
 
72 bp  143  6e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0101521  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1622  tRNA-Gln  86.3 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000113054  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0236  tRNA-Gln  100 
 
 
75 bp  54  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0012758  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1924  tRNA-Gln  100 
 
 
75 bp  54  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00590264  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAArgVIMSS1309268  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.292305 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0012  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0409907  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0031  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.464558  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAArgVIMSS1309209  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0052  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.165142  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0052  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280732  normal  0.142339 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>