More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1169 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1169  transketolase  100 
 
 
640 aa  1301    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.195644  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1547  transketolase  45.33 
 
 
659 aa  550  1e-155  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.45317  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  45.11 
 
 
666 aa  545  1e-154  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3765  transketolase  45.18 
 
 
659 aa  547  1e-154  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3699  transketolase  45.13 
 
 
680 aa  543  1e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000172901 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3742  transketolase  44.98 
 
 
666 aa  542  1e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000620958  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  44.98 
 
 
666 aa  543  1e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  45.36 
 
 
666 aa  543  1e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  44.98 
 
 
666 aa  542  1e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1241  transketolase  45.5 
 
 
668 aa  545  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000546415  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  44.98 
 
 
666 aa  543  1e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2336  transketolase  45.13 
 
 
666 aa  544  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000657537  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1524  transketolase  44.96 
 
 
680 aa  542  1e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000346626  normal  0.0243149 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2122  transketolase  45.11 
 
 
668 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3790  transketolase  44.96 
 
 
666 aa  537  1e-151  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258353  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3369  transketolase  45.36 
 
 
666 aa  538  1e-151  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00015872  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1734  transketolase  46.01 
 
 
658 aa  535  1e-151  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.901909  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0278  transketolase  46.56 
 
 
661 aa  531  1e-149  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0349  transketolase  44.9 
 
 
658 aa  525  1e-147  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1616  transketolase  43.95 
 
 
662 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0712144  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3388  transketolase  43.93 
 
 
664 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170816  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3411  transketolase  43.68 
 
 
664 aa  502  1e-141  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.856564  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3165  transketolase  43.98 
 
 
664 aa  503  1e-141  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3082  transketolase  44.16 
 
 
664 aa  502  1e-141  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3413  transketolase  43.68 
 
 
664 aa  502  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0610  transketolase  42.6 
 
 
656 aa  503  1e-141  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0812266  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1844  transketolase  44.31 
 
 
664 aa  503  1e-141  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.862582 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3401  transketolase  43.79 
 
 
664 aa  502  1e-140  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1403  transketolase  42.34 
 
 
662 aa  499  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.194488  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1430  transketolase  42.34 
 
 
662 aa  499  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0912  transketolase  41.24 
 
 
662 aa  497  1e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.240506  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0416  transketolase  44.04 
 
 
678 aa  496  1e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.985586  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2748  transketolase  42.04 
 
 
690 aa  496  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.495668 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1828  transketolase  41.68 
 
 
653 aa  495  1e-139  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.208586  normal  0.379943 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0946  transketolase  42.08 
 
 
665 aa  498  1e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0562  transketolase  41.93 
 
 
690 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.32365 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4614  transketolase  44.27 
 
 
674 aa  494  9.999999999999999e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2594  transketolase  43.31 
 
 
681 aa  493  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0638  transketolase  41.93 
 
 
690 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0364868  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3181  transketolase  43.05 
 
 
674 aa  491  1e-137  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0139  transketolase  41.98 
 
 
668 aa  491  1e-137  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3467  transketolase  42.07 
 
 
690 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3722  transketolase  41.93 
 
 
690 aa  489  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3432  transketolase  43.05 
 
 
674 aa  491  1e-137  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3468  transketolase  42.07 
 
 
690 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0605  transketolase  41.93 
 
 
690 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0697832  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1904  transketolase  41.49 
 
 
668 aa  490  1e-137  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0155  transketolase  41.93 
 
 
690 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1379  transketolase  42.54 
 
 
711 aa  489  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356531  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0538  transketolase  41.49 
 
 
690 aa  491  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.242033  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2903  transketolase  41.78 
 
 
711 aa  488  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000161618 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2469  transketolase  41.93 
 
 
690 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3431  transketolase  42.07 
 
 
696 aa  488  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3317  transketolase  41.93 
 
 
675 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1249  transketolase  41.93 
 
 
690 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.47821  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  41.72 
 
 
666 aa  486  1e-136  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0389  transketolase  41.93 
 
 
690 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0520  transketolase  42.07 
 
 
663 aa  486  1e-136  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1883  transketolase  43.16 
 
 
672 aa  484  1e-135  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.768149  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  41.92 
 
 
666 aa  482  1e-135  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  41.92 
 
 
666 aa  482  1e-135  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_584  transketolase  41.72 
 
 
666 aa  484  1e-135  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl349  transketolase  42.68 
 
 
655 aa  483  1e-135  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  3.9216400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0154  transketolase  41.57 
 
 
668 aa  484  1e-135  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2283  transketolase  42.81 
 
 
667 aa  483  1e-135  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0932399  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0850  transketolase  41.45 
 
 
664 aa  481  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889577  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2102  transketolase  40.77 
 
 
668 aa  480  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000131444  normal  0.204144 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1015  transketolase  41.64 
 
 
661 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0847  transketolase  41.45 
 
 
664 aa  481  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1968  transketolase  42.7 
 
 
655 aa  480  1e-134  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00341468  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0552  transketolase  41.64 
 
 
664 aa  481  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0487  transketolase  42.42 
 
 
667 aa  479  1e-134  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0565  transketolase  41.55 
 
 
662 aa  479  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3352  transketolase  41.45 
 
 
664 aa  481  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3415  transketolase  41.1 
 
 
662 aa  480  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2599  transketolase  41.68 
 
 
672 aa  476  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000286494 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4499  transketolase  42.25 
 
 
688 aa  478  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0651  transketolase  41.49 
 
 
723 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6013  Tkt1  40.44 
 
 
723 aa  476  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0469942  normal  0.474282 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0472  transketolase  41.45 
 
 
667 aa  476  1e-133  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0841196  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4349  transketolase  40.4 
 
 
693 aa  476  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03160  transketolase 1 (TK 1)  41.68 
 
 
663 aa  476  1e-133  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3330  transketolase  41.72 
 
 
666 aa  477  1e-133  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0024244  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  41.64 
 
 
665 aa  478  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1127  transketolase  39.97 
 
 
692 aa  473  1e-132  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0296008 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3703  transketolase  40.99 
 
 
664 aa  473  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94599  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3040  transketolase  40.76 
 
 
670 aa  474  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0242601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3046  transketolase  40.76 
 
 
670 aa  474  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.590988  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0385  transketolase  40.88 
 
 
665 aa  475  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0159  transketolase  41.33 
 
 
661 aa  475  1e-132  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3391  transketolase  41.25 
 
 
699 aa  474  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0869549  hitchhiker  0.000451317 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5267  transketolase  42.51 
 
 
681 aa  473  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0309  transketolase  40.54 
 
 
684 aa  472  1e-132  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000137507 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2148  transketolase  42.33 
 
 
671 aa  472  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0224  transketolase  39.91 
 
 
673 aa  473  1e-132  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03567  transketolase  42.42 
 
 
675 aa  475  1e-132  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2601  transketolase  41.81 
 
 
655 aa  474  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1195  transketolase  42.26 
 
 
690 aa  475  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  41.45 
 
 
662 aa  473  1e-132  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0647  transketolase  41.92 
 
 
680 aa  473  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000464673  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>