299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_t0045 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_t0045  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00000955688  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  94.55 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0021  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0132  tRNA-Lys  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0291  tRNA-Lys  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna43  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0023  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.051511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0022  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0195324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1934  tRNA-Lys  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.810073  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0060  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0060  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.845098  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0081  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.158777 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0068  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.437414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0067  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0066  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0078  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000025771 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0075  tRNA-Lys  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0019  tRNA-Lys  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0042  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0004  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.21987  normal  0.244967 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0047  tRNA-Lys  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.157742  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0035  tRNA-Lys  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0033  tRNA-Lys  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.146569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0029  tRNA-Lys  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000384489  normal  0.924155 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0022  tRNA-Lys  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00514969  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0107  tRNA-Lys  87.93 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000354885  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt33  tRNA-Lys  97.06 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt33  tRNA-Lys  97.06 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0046  tRNA-Lys  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0108  tRNA-Lys  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000399155  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0052  tRNA-Lys  96.97 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0175495  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0071  tRNA-Lys  96.97 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4239  tRNA-Lys  96.97 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00412423  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2046  tRNA-Lys  96.97 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000370287  hitchhiker  0.00336958 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0045  tRNA-Lys  96.97 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.315592  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0043  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000129549  unclonable  0.000000000302545 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0023  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0024  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0040  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0042  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000326877  unclonable  0.000000000331306 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0024  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0025  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0025  tRNA-Lys  86.67 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0001  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0011  tRNA-Asn  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00131891  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0011  tRNA-Lys  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0014  tRNA-Lys  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0070  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00525701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0009  tRNA-Lys  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.420581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0020  tRNA-Lys  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0058  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS02241  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000057797  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  87.27 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  87.27 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.027196  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  87.27 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA35  tRNA-Lys  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.056149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0012  tRNA-Lys  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Phe-2  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.137166  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0003  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14030  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.36075e-34  hitchhiker  0.0017768 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0354  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.570155  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0082  tRNA-Phe  100 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0011  tRNA-Lys  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.983753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0136  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.740325  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0044  tRNA-Lys  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.300921 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0039  tRNA-Lys  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0040  tRNA-Lys  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0045  tRNA-Lys  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0394104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0018  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0030  tRNA-Lys  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00181999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0021  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.824976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0012  tRNA-Lys  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0027  tRNA-Lys  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00574952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0049  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000790035  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0059  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.383057  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0037  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205438  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0075  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154844  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0006  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0062  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0025  tRNA-Lys  87.27 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0132598  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0174  tRNA-Lys  87.27 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0415  tRNA-Lys  87.27 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0379576  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0072  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0389238  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0719  tRNA-Lys  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0034  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.285979  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0038  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0056  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0075  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283393  normal  0.209265 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0053  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.744233  normal  0.828825 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0823  tRNA-Lys  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2797  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0027  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2283  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00760405  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0075  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.106452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0159  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.369913  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2361  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.979776  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0169  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.601595  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0034  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.603769 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0002  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0027  tRNA-Lys  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.685888 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>