17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_t0026 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_t0026  tRNA-Asn  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000145037  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2604  tRNA-Asn  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Asn-3  tRNA-Asn  96.36 
 
 
74 bp  93.7  5e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1997  tRNA-Asn  96.36 
 
 
74 bp  93.7  5e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1780  tRNA-Asn  96.36 
 
 
74 bp  93.7  5e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.319362  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0185  tRNA-Asn  96.36 
 
 
74 bp  93.7  5e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00655162  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  96.36 
 
 
74 bp  93.7  5e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0149702  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Asn-2  tRNA-Asn  100 
 
 
74 bp  85.7  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0708592  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1796  tRNA-Asn  91.8 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  6.3013000000000006e-24 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1802  tRNA-Asn  91.8 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000154266 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1563  tRNA-Asn  91.8 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0452  tRNA-Asn  91.8 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.133298 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0012  tRNA-Asn  91.53 
 
 
73 bp  69.9  0.00000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0014  tRNA-Asn  91.53 
 
 
73 bp  69.9  0.00000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000102189  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0193  tRNA-Asn  90.74 
 
 
73 bp  60  0.00000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0407  tRNA-Asn  87.04 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000764097  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0408  tRNA-Asn  87.04 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000233964  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>