More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_D18 on replicon NC_008506
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008506  LACR_D18  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  100 
 
 
294 aa  590  1e-167  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.618821  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2027  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  91.16 
 
 
294 aa  526  1e-148  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000474234  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0552  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.46 
 
 
301 aa  288  6e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0624  oligopeptide ABC transporter permease  49.14 
 
 
301 aa  285  9e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.728554  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0657  oligopeptide ABC transporter permease protein  49.14 
 
 
301 aa  285  9e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0725  oligopeptide ABC transporter, permease protein  50.36 
 
 
301 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0941  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.62 
 
 
308 aa  284  1.0000000000000001e-75  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0714  oligopeptide ABC transporter, permease protein  50.36 
 
 
301 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000150204 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0567  oligopeptide ABC transporter, permease  50.36 
 
 
301 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0786  oligopeptide ABC transporter, permease protein  50.36 
 
 
301 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0568  oligopeptide ABC transporter, permease  49.48 
 
 
301 aa  279  4e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0571  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.09 
 
 
301 aa  278  9e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1272  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.52 
 
 
300 aa  277  2e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0777  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  45.08 
 
 
304 aa  266  2e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238317  hitchhiker  0.000000000000588026 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1616  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  48.8 
 
 
315 aa  249  5e-65  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.014933  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.96 
 
 
293 aa  175  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.96 
 
 
293 aa  175  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0854715  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.43 
 
 
300 aa  171  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5078  oligopeptide ABC transporter, permease protein  31.19 
 
 
306 aa  160  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0247  oligopeptide ABC transporter, permease protein  31.19 
 
 
306 aa  159  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0546254  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0207  oligopeptide ABC transporter, permease  31.23 
 
 
307 aa  158  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0250  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.22 
 
 
307 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0243  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.22 
 
 
307 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0210  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.19 
 
 
307 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.99 
 
 
345 aa  156  3e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.327353 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0211  oligopeptide ABC transporter, permease  33.22 
 
 
307 aa  156  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2553  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  32.86 
 
 
304 aa  156  4e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2256  oligopeptide ABC transporter, permease component  32.86 
 
 
304 aa  156  4e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0220  oligopeptide ABC transporter permease  32.86 
 
 
307 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1867  ABC-type transport system protein  33.33 
 
 
288 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0233  oligopeptide ABC transporter permease protein  32.86 
 
 
307 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0221  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.82 
 
 
307 aa  154  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.3 
 
 
305 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.238767  normal  0.85069 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.84 
 
 
306 aa  151  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.640764 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0268  oligopeptide ABC transporter, permease protein  30.36 
 
 
307 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3674  oligopeptide ABC transporter, permease  34.19 
 
 
279 aa  150  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0467802 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.36 
 
 
293 aa  150  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000296229  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0450  putative peptide transport system permease protein  33.47 
 
 
342 aa  149  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.540872  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.27 
 
 
299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.72 
 
 
312 aa  146  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3719  ABC transporter, permease protein  34.93 
 
 
339 aa  146  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2836  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.96 
 
 
305 aa  145  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.824973 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.33 
 
 
299 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499686  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1766  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.47 
 
 
468 aa  144  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0164204  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1914  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.44 
 
 
341 aa  143  4e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.97 
 
 
287 aa  142  5e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000642732  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1040  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  33.47 
 
 
360 aa  142  6e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.522587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3511  oligopeptide ABC transporter (permease)  31.51 
 
 
317 aa  142  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0407  peptide ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
302 aa  142  8e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404999  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2594  oligopeptide ABC transporter, permease protein  36.96 
 
 
285 aa  142  9e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1756  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.06 
 
 
339 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.974792  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2594  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.94 
 
 
364 aa  141  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.853093  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
292 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19890  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  30.96 
 
 
289 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00186711  hitchhiker  0.000357505 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1435  peptide ABC transporter, permease protein  33.47 
 
 
282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.32 
 
 
341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2179  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.62 
 
 
339 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0350  peptide ABC transporter, permease protein  32.96 
 
 
302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.07 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1395  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  32.46 
 
 
288 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.064701  decreased coverage  0.00784209 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.71 
 
 
280 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.5 
 
 
339 aa  140  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.391891  normal  0.494478 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1236  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.05 
 
 
284 aa  140  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143707  normal  0.209567 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.06 
 
 
355 aa  140  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.16 
 
 
352 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2991  ABC transporter, inner membrane subunit  35.56 
 
 
371 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.400376  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.37 
 
 
340 aa  139  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3488  ABC transporter permease  33.62 
 
 
339 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2635  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.23 
 
 
402 aa  139  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291012  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2434  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
341 aa  139  4.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.254964  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1661  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.29 
 
 
360 aa  139  7.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.390668  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0870  inner membrane ABC transporter permease protein  33.92 
 
 
350 aa  139  7.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0388  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37 
 
 
516 aa  138  8.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001972  peptide ABC transporter permease component  33.68 
 
 
318 aa  138  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0141  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.43 
 
 
340 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.31 
 
 
338 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.207956  normal  0.0893102 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00495  ABC transporter permease component  34.02 
 
 
318 aa  138  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14280  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  34.89 
 
 
384 aa  138  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3474  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.19 
 
 
339 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0265  peptide ABC transporter, permease protein  34.78 
 
 
340 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29670  oligopeptide ABC transporter, inner membrane permease component  34.06 
 
 
339 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.175174  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.49 
 
 
299 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00209608  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0445  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems permease components-like  34.04 
 
 
351 aa  137  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.881548 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
360 aa  137  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.318387 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0533  putative peptide ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
352 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.75 
 
 
285 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3721  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.19 
 
 
339 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0100075  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.17 
 
 
338 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.588889 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4149  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.19 
 
 
339 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0570261  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2715  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.94 
 
 
338 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.161854  normal  0.0734205 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1948  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.75 
 
 
368 aa  136  4e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0329294  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31 
 
 
319 aa  136  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.532842  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41150  putative permease of ABC transporter  33.19 
 
 
339 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1716  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.19 
 
 
339 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.937938  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.31 
 
 
371 aa  136  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
658 aa  136  4e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0118989  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3342  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.12 
 
 
266 aa  136  5e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.183715  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2338  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.96 
 
 
341 aa  136  5e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
376 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
312 aa  135  6.0000000000000005e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>