29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_D10 on replicon NC_008506
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008506  LACR_D10    100 
 
 
330 bp  654    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.694181  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0115  transposase  100 
 
 
846 bp  541  9.999999999999999e-153  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00142442  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0708  transposase  100 
 
 
855 bp  541  9.999999999999999e-153  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.042465  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1591  transposase  100 
 
 
855 bp  541  9.999999999999999e-153  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.401924  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1365  transposase  100 
 
 
855 bp  541  9.999999999999999e-153  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1292  transposase  100 
 
 
855 bp  541  9.999999999999999e-153  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.572072  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0121  transposase  99.63 
 
 
855 bp  533  1e-149  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1928  transposase  99.63 
 
 
855 bp  533  1e-149  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.406161  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0684  transposase  99.63 
 
 
855 bp  533  1e-149  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1871  transposase  99.63 
 
 
855 bp  533  1e-149  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0349694  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1635  transposase  99.63 
 
 
855 bp  533  1e-149  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1504  transposase  99.63 
 
 
855 bp  533  1e-149  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0105855  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1214  transposase  99.27 
 
 
855 bp  525  1e-147  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.933809  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1993  transposase  99.27 
 
 
855 bp  525  1e-147  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1966  transposase  99.27 
 
 
855 bp  525  1e-147  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1797  transposase  99.27 
 
 
855 bp  525  1e-147  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1167  transposase  99.27 
 
 
855 bp  525  1e-147  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.213316  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0906  transposase  99.27 
 
 
855 bp  525  1e-147  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0597  transposase  99.27 
 
 
855 bp  525  1e-147  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0038  transposase  99.27 
 
 
855 bp  525  1e-147  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0681  transposase  98.9 
 
 
855 bp  517  1.0000000000000001e-145  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.606011  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1076    100 
 
 
1102 bp  505  1e-141  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0415061  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0993  transposase  99.61 
 
 
840 bp  504  1e-141  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.078636  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0963  transposase  99.61 
 
 
840 bp  504  1e-141  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0107524  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2299  transposase  99.61 
 
 
756 bp  505  1e-141  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.224442  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2330  transposase  99.23 
 
 
756 bp  498  1e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1357  transposase  100 
 
 
723 bp  276  4.0000000000000004e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1677  transposase  83.49 
 
 
855 bp  143  3.9999999999999997e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C59  transposase  82.11 
 
 
705 bp  54  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>