More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_C06 on replicon NC_008505
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008505  LACR_C06  aminodeoxychorismate synthase, glutamine amidotransferase subunit  100 
 
 
193 aa  400  1e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0768  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  48.7 
 
 
195 aa  186  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.474408  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1475  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  48.97 
 
 
196 aa  186  2e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00621509  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0201  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  49.48 
 
 
200 aa  186  3e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0460  anthranilate synthase component II  46.35 
 
 
200 aa  184  8e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2224  anthranilate synthase component II  48.44 
 
 
189 aa  184  9e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.626919 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3024  anthranilate synthase component II  47.42 
 
 
205 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00296432  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0462  anthranilate synthase component II  47.4 
 
 
199 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.431343 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0438  anthranilate synthase component II  47.4 
 
 
199 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0161  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  47.67 
 
 
188 aa  183  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.708014  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0505  anthranilate synthase component II  47.4 
 
 
199 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.624854 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3497  anthranilate synthase component II  45.83 
 
 
200 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.317495  hitchhiker  0.000454644 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2572  anthranilate synthase component II  47.4 
 
 
199 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0533  anthranilate synthase component II  47.4 
 
 
199 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0147  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  47.92 
 
 
188 aa  182  4.0000000000000006e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3620  anthranilate synthase component II  46.88 
 
 
196 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0575  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  47.42 
 
 
195 aa  181  6e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0267305  normal  0.552155 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2882  anthranilate synthase component II  46.88 
 
 
189 aa  181  7e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.521517 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2699  anthranilate synthase component II  45.83 
 
 
195 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3652  anthranilate synthase component II  45.08 
 
 
194 aa  181  8.000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1028  anthranilate synthase component II  48.17 
 
 
195 aa  180  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0532  anthranilate synthase component II  46.88 
 
 
196 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3576  anthranilate synthase component II  46.88 
 
 
196 aa  180  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.455371  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0941  anthranilate synthase component II  46.88 
 
 
196 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2861  anthranilate synthase component II  47.4 
 
 
195 aa  180  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3179  anthranilate synthase component II  46.63 
 
 
189 aa  180  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3584  anthranilate synthase component II  46.88 
 
 
196 aa  180  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1911  anthranilate synthase component II  46.88 
 
 
196 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0645  anthranilate synthase component II  46.88 
 
 
196 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1093  anthranilate synthase component II  45.03 
 
 
196 aa  179  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0614431  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3837  para-aminobenzoate synthase component II  50 
 
 
187 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2910  anthranilate synthase component II  46.88 
 
 
196 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1271  anthranilate synthase component II  45.03 
 
 
196 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.8553  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3666  para-aminobenzoate synthase component II  50 
 
 
187 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.344721  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3666  para-aminobenzoate synthase component II  50 
 
 
187 aa  178  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.11794  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3774  para-aminobenzoate synthase component II  50 
 
 
187 aa  178  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.587624 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2468  anthranilate synthase component II  47.67 
 
 
188 aa  177  5.999999999999999e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2759  anthranilate synthase component II  45.83 
 
 
189 aa  177  7e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.397265  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3557  anthranilate synthase component II  46.88 
 
 
196 aa  177  8e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312746  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2585  anthranilate synthase component II  47.21 
 
 
195 aa  176  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3605  anthranilate synthase component II  45.64 
 
 
208 aa  176  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.240756  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3196  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase or para-aminobenzoate synthase  47.94 
 
 
190 aa  176  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2749  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  48.98 
 
 
197 aa  176  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.466062  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3477  anthranilate synthase component II  46.88 
 
 
190 aa  176  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.760643  normal  0.196565 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2496  anthranilate synthase component II  46.39 
 
 
189 aa  176  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0301629  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3740  para-aminobenzoate synthase component II  49.48 
 
 
187 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.780045  decreased coverage  0.00646888 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3302  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  46.63 
 
 
189 aa  176  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3015  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component II  47.69 
 
 
216 aa  176  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00067902  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2081  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  47.21 
 
 
197 aa  175  3e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2564  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase or para-aminobenzoate synthase  45.31 
 
 
189 aa  175  3e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3124  anthranilate synthase component II  44.79 
 
 
189 aa  175  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.680889 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0065  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  46.88 
 
 
195 aa  175  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1121  anthranilate synthase, component II  46.11 
 
 
187 aa  174  5e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0241501  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4670  para-aminobenzoate synthase component II  48.69 
 
 
187 aa  174  7e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.234421 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0806  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase or para-aminobenzoate synthase  46.15 
 
 
197 aa  174  7e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000445998  hitchhiker  0.00746416 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1190  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  46.11 
 
 
197 aa  174  8e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00563763  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1233  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  44.85 
 
 
544 aa  174  9e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0375955  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03211  para-aminobenzoate synthase component II  48.69 
 
 
187 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.242193  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0352  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  48.69 
 
 
187 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.365633  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1482  anthranilate synthase component II  48.44 
 
 
196 aa  173  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2382  anthranilate synthase component II  46.39 
 
 
190 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.655324  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3830  para-aminobenzoate synthase component II  48.69 
 
 
187 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03163  hypothetical protein  48.69 
 
 
187 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.363246  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0613  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component II  45.88 
 
 
191 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1272  anthranilate synthase component II  48.44 
 
 
196 aa  173  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1341  anthranilate synthase, component II  46.11 
 
 
204 aa  173  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.211873  normal  0.788179 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4455  anthranilate synthase component II  45.36 
 
 
190 aa  173  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3423  aminodeoxychorismate synthase, glutamine amidotransferase subunit  45.88 
 
 
196 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.585956  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0101  anthranilate synthase component II  45.13 
 
 
201 aa  173  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.134219  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3557  para-aminobenzoate synthase component II  48.69 
 
 
187 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2845  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  46.35 
 
 
190 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.101069  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3642  para-aminobenzoate synthase component II  48.69 
 
 
187 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000573837 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3244  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase component II  46.35 
 
 
190 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.349554  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0352  para-aminobenzoate synthase component II  48.69 
 
 
187 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0078  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  45.83 
 
 
195 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000982059 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3758  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  46.39 
 
 
194 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000630445  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0567  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  46.39 
 
 
194 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000013405  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3884  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  46.39 
 
 
194 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.012296  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2155  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  46.6 
 
 
188 aa  172  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64084  hitchhiker  0.0020762 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0607  aminodeoxychorismate synthase, glutamine amidotransferase subunit  45.36 
 
 
203 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00205694  normal  0.186857 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0606  aminodeoxychorismate synthase, glutamine amidotransferase subunit  45.36 
 
 
191 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.37409  hitchhiker  0.00400563 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3736  para-aminobenzoate synthase component II  47.67 
 
 
187 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4275  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  43.75 
 
 
209 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.734934  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08340  anthranilate synthase component II  48.73 
 
 
201 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000176766 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0358  anthranilate synthase component II  44.79 
 
 
190 aa  171  3.9999999999999995e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0583  anthranilate synthase component II  42.78 
 
 
190 aa  171  5e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2196  para-aminobenzoate synthase component II  49.75 
 
 
193 aa  171  5.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3906  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  43.75 
 
 
209 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0615003  normal  0.168302 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1211  anthranilate synthase component II  44.33 
 
 
190 aa  171  7.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.903358  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3705  para-aminobenzoate synthase component II  47.45 
 
 
191 aa  170  9e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0069  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  45.83 
 
 
195 aa  170  9e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0065  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  45.83 
 
 
195 aa  170  9e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0069  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  45.83 
 
 
195 aa  170  9e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0244  para-aminobenzoate synthase component II  47.45 
 
 
191 aa  170  9e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0673282  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3948  para-aminobenzoate synthase component II  47.45 
 
 
191 aa  170  9e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4378  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  43.75 
 
 
209 aa  170  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.868162  normal  0.946772 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0790  anthranilate synthase component II  48.22 
 
 
201 aa  170  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2321  anthranilate synthase, component II  46.23 
 
 
195 aa  170  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0251502  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3701  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  45.88 
 
 
194 aa  170  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000872657  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3518  anthranilate synthase component II  44.44 
 
 
192 aa  169  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.934173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>