16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2129 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_2129  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  513  1.0000000000000001e-145  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0612  gp49  54.6 
 
 
235 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0180237  hitchhiker  0.00151942 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2527  Rad52/22 double-strand break repair protein  55.37 
 
 
170 aa  142  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00242809  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0052  putative prophage protein  37.09 
 
 
282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.012266 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1314  Rad52/22 double-strand break repair protein  47.54 
 
 
179 aa  106  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.321327  normal  0.202591 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0517  Rad52/22 double-strand break repair protein  44.78 
 
 
167 aa  105  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.743906  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0086  prophage protein  42.98 
 
 
118 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0080  prophage protein  42.98 
 
 
118 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.568604  normal 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3545  RAD52/22 double-strand break repair protein  39.17 
 
 
170 aa  80.5  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000561994  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0565  RAD52/22 double-strand break repair protein  36 
 
 
169 aa  79.7  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.103803 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0576  hypothetical protein  36 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00845502  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0322  hypothetical protein  34.5 
 
 
242 aa  69.7  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0977  Rad52/22 double-strand break repair protein  31.87 
 
 
201 aa  67.4  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.00000000168807  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2611  Rad52/22 double-strand break repair protein  35.96 
 
 
238 aa  66.2  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0535  hypothetical protein  29.81 
 
 
151 aa  48.9  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0116997  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1173  hypothetical protein  27.19 
 
 
211 aa  46.6  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000729431  normal  0.496656 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>