19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1688 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1688  cell surface protein  100 
 
 
252 aa  510  1e-144  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.739055  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1687  cell surface protein  40.64 
 
 
251 aa  139  6e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00164867  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1689  cell surface protein  38.75 
 
 
263 aa  128  7.000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4415  cell surface protein  37.78 
 
 
246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.396723 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4416  cell surface protein  39.11 
 
 
246 aa  124  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.392254 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0351  cell surface protein  36.94 
 
 
241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4889  cell surface protein  36.94 
 
 
241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0768  hypothetical protein  34.82 
 
 
251 aa  115  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0700  hypothetical protein  34.67 
 
 
247 aa  112  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2418  hypothetical protein  36.65 
 
 
1019 aa  111  9e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0699  hypothetical protein  33.77 
 
 
241 aa  103  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0350  cell surface protein  36.09 
 
 
242 aa  101  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0767  hypothetical protein  39.01 
 
 
261 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1417  cell surface protein  34.25 
 
 
259 aa  97.8  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.271285  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1690  cell surface protein  30.04 
 
 
281 aa  97.1  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4890  cell surface protein  35.22 
 
 
242 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1490  hypothetical protein  28.25 
 
 
270 aa  65.5  0.0000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.812251  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C14  cell surface protein  28.19 
 
 
238 aa  49.7  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0154  cell surface protein  31.55 
 
 
157 aa  48.1  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>