19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1687 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1687  cell surface protein  100 
 
 
251 aa  496  1e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00164867  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1688  cell surface protein  40.64 
 
 
252 aa  139  6e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.739055  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1689  cell surface protein  35.38 
 
 
263 aa  115  5e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4416  cell surface protein  35.43 
 
 
246 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.392254 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4415  cell surface protein  34.35 
 
 
246 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.396723 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1690  cell surface protein  32.13 
 
 
281 aa  96.3  5e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0700  hypothetical protein  34.39 
 
 
247 aa  94.4  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4889  cell surface protein  30.59 
 
 
241 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0351  cell surface protein  30.2 
 
 
241 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0768  hypothetical protein  34.86 
 
 
251 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0350  cell surface protein  31.91 
 
 
242 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4890  cell surface protein  31.64 
 
 
242 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2418  hypothetical protein  29.46 
 
 
1019 aa  89.4  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1490  hypothetical protein  29.5 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.812251  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0699  hypothetical protein  32.1 
 
 
241 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0767  hypothetical protein  31.67 
 
 
261 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1417  cell surface protein  30.88 
 
 
259 aa  79.7  0.00000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.271285  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C14  cell surface protein  30.12 
 
 
238 aa  45.8  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0154  cell surface protein  32.14 
 
 
157 aa  45.8  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>