30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0543 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0543  Holliday junction-specific endonuclease  100 
 
 		 213 aa  440  1e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0278  Holliday junction-specific endonuclease  62.68 
 
 		 198 aa  263  2e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.116172  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0299  Holliday junction-specific endonuclease  69.64 
 
 		 199 aa  253  1.0000000000000001e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0429968  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0512  Holliday junction-specific endonuclease  59.06 
 
 		 200 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0650  Holliday junction-specific endonuclease  51.9 
 
 		 204 aa  209  2e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.161694  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2106  Holliday junction-specific endonuclease  58.48 
 
 		 201 aa  205  4e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1019  Holliday junction-specific endonuclease  50.94 
 
 		 209 aa  202  4e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1508  Holliday junction-specific endonuclease  48.82 
 
 		 208 aa  199  3e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.833537  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1537  Holliday junction-specific endonuclease  48.82 
 
 		 208 aa  199  3e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.873676  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0921  Holliday junction-specific endonuclease  50 
 
 		 204 aa  197  7.999999999999999e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.673716  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1024  Holliday junction-specific endonuclease  46.92 
 
 		 212 aa  196  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1273  Holliday junction-specific endonuclease  49.52 
 
 		 200 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.381336  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3738  Holliday junction-specific endonuclease  46.67 
 
 		 200 aa  194  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.110868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1606  Holliday junction-specific endonuclease  47.12 
 
 		 200 aa  193  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1094  Holliday junction-specific endonuclease  48.37 
 
 		 197 aa  192  3e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1475  Holliday junction-specific endonuclease  47.14 
 
 		 200 aa  192  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1573  Holliday junction-specific endonuclease  47.62 
 
 		 200 aa  179  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1459  Holliday junction-specific endonuclease  47.62 
 
 		 200 aa  179  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1432  Holliday junction-specific endonuclease  47.62 
 
 		 200 aa  179  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1644  Holliday junction-specific endonuclease  47.62 
 
 		 200 aa  179  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0035211 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1431  Holliday junction-specific endonuclease  47.62 
 
 		 200 aa  179  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1717  Holliday junction-specific endonuclease  47.14 
 
 		 200 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.291889  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1679  Holliday junction-specific endonuclease  47.14 
 
 		 200 aa  177  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5526  recombination protein U  32.94 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.781388  normal  0.0647884 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0105  recombination protein U  34.29 
 
 		 176 aa  102  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5825  recombination protein U (penicillin-binding protein-related factor A)  32.94 
 
 		 209 aa  102  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2788  recombination protein U  38.46 
 
 		 178 aa  97.8  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf307  Holliday junction-specific endonuclease  40.54 
 
 		 171 aa  81.6  0.000000000000008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0337556  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0573  recombination protein U, putative  31.33 
 
 		 169 aa  81.3  0.00000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.00536427  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl203  recombination protein U  30.72 
 
 		 166 aa  80.5  0.00000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.710944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>