More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_14650 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3577  glutamate dehydrogenase  71.24 
 
 		 445 aa  634    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4441  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  72.17 
 
 		 449 aa  641    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.542579  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2359  glutamate dehydrogenase  69.39 
 
 		 444 aa  640    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.394461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14650  glutamate dehydrogenase  100 
 
 		 451 aa  920    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.972486  normal  0.287682 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5321  glutamate dehydrogenase  70.2 
 
 		 449 aa  636    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0761219 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0418  glutamate dehydrogenase  68.43 
 
 		 449 aa  634    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549997  normal  0.391683 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4646  glutamate dehydrogenase  68.31 
 
 		 448 aa  631  1e-180  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4267  glutamate dehydrogenase  68.31 
 
 		 448 aa  631  1e-180  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.292709  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3505  glutamate dehydrogenase  70.34 
 
 		 445 aa  632  1e-180  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4353  glutamate dehydrogenase  68.31 
 
 		 448 aa  631  1e-180  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal  0.0129009 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34200  glutamate dehydrogenase (NADP)  69.46 
 
 		 446 aa  629  1e-179  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.255605 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2123  glutamate dehydrogenase  68.09 
 
 		 449 aa  628  1e-179  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286272 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0396  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  68.9 
 
 		 447 aa  629  1e-179  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1658  glutamate dehydrogenase  67.42 
 
 		 458 aa  624  1e-178  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1929  glutamate dehydrogenase  67.71 
 
 		 449 aa  622  1e-177  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4804  glutamate dehydrogenase  68.83 
 
 		 449 aa  621  1e-177  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5524  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  67.94 
 
 		 447 aa  619  1e-176  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148438  normal  0.115697 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2296  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  66.97 
 
 		 445 aa  619  1e-176  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0060  glutamate dehydrogenase  66.07 
 
 		 449 aa  619  1e-176  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.742683  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4667  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  68.61 
 
 		 449 aa  620  1e-176  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1371  glutamate dehydrogenase  67.19 
 
 		 452 aa  615  1e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.209216  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32600  glutamate dehydrogenase  66.82 
 
 		 447 aa  615  1e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.163596  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2911  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  67.42 
 
 		 445 aa  612  9.999999999999999e-175  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.755434 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2125  glutamate dehydrogenase  66.37 
 
 		 447 aa  614  9.999999999999999e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0411981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0302  glutamate dehydrogenase  65.84 
 
 		 449 aa  608  1e-173  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0346  glutamate dehydrogenase  69 
 
 		 445 aa  605  9.999999999999999e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2782  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  63.68 
 
 		 446 aa  604  9.999999999999999e-173  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000238369  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0996  glutamate dehydrogenase  65.71 
 
 		 451 aa  606  9.999999999999999e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.150602  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3872  glutamate dehydrogenase  66.67 
 
 		 453 aa  607  9.999999999999999e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.582275 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2800  glutamate dehydrogenase  65.38 
 
 		 449 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00630068  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3019  glutamate dehydrogenase  64.43 
 
 		 449 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3219  glutamate dehydrogenase  64.21 
 
 		 449 aa  601  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0175  glutamate dehydrogenase  64.48 
 
 		 449 aa  599  1e-170  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000304056 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0864  glutamate dehydrogenase  64.72 
 
 		 448 aa  598  1e-170  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.342064  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3118  glutamate dehydrogenase  63.98 
 
 		 449 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.690861  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30790  glutamate dehydrogenase  66.82 
 
 		 447 aa  598  1e-170  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2044  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  69.21 
 
 		 456 aa  598  1e-170  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.859407  normal  0.109712 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0193  glutamate dehydrogenase  64.48 
 
 		 449 aa  599  1e-170  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0573  glutamate dehydrogenase  64.04 
 
 		 448 aa  591  1e-168  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3000  glutamate dehydrogenase  64.93 
 
 		 448 aa  594  1e-168  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.741284  normal  0.619757 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1305  glutamate dehydrogenase  63.03 
 
 		 450 aa  587  1e-166  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1186  glutamate dehydrogenase  62.58 
 
 		 450 aa  585  1e-166  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1813  glutamate dehydrogenase  61.45 
 
 		 454 aa  586  1e-166  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.181539  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4852  glutamate dehydrogenase  64.93 
 
 		 444 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3497  glutamate dehydrogenase  61.76 
 
 		 451 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04440  glutamate dehydrogenase  65.02 
 
 		 446 aa  569  1e-161  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1770  glutamate dehydrogenase  59.32 
 
 		 448 aa  553  1e-156  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1499  glutamate dehydrogenase  59.32 
 
 		 448 aa  553  1e-156  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.981406  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0374  glutamate dehydrogenase  61.31 
 
 		 444 aa  551  1e-156  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000129016  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1556  glutamate dehydrogenase  59.37 
 
 		 445 aa  546  1e-154  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.240563  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2430  glutamate dehydrogenase  60.77 
 
 		 445 aa  548  1e-154  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0818  glutamate dehydrogenase  57.81 
 
 		 447 aa  531  1e-150  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.274961 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0271  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  59.28 
 
 		 445 aa  533  1e-150  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1771  glutamate dehydrogenase  59.86 
 
 		 445 aa  531  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.89155  normal  0.439156 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60710  glutamate dehydrogenase  60.27 
 
 		 445 aa  528  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2214  glutamate dehydrogenase  58.72 
 
 		 438 aa  528  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.171409  normal  0.223248 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1335  glutamate dehydrogenase  59.14 
 
 		 449 aa  525  1e-148  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.26176  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1801  glutamate dehydrogenase  58.54 
 
 		 443 aa  525  1e-148  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.250235  normal  0.676275 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0467  glutamate dehydrogenase  58.56 
 
 		 450 aa  526  1e-148  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000753679  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5228  glutamate dehydrogenase  60.27 
 
 		 445 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0942  glutamate dehydrogenase  56.61 
 
 		 466 aa  525  1e-147  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.156047 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1427  glutamate dehydrogenase  58.41 
 
 		 448 aa  519  1e-146  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4874  glutamate dehydrogenase  59.4 
 
 		 445 aa  519  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.443754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1647  glutamate dehydrogenase  56.35 
 
 		 451 aa  519  1e-146  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07080  glutamate dehydrogenase  57.99 
 
 		 443 aa  521  1e-146  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.813 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0675  glutamate dehydrogenase  58.03 
 
 		 449 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4509  glutamate dehydrogenase  57.76 
 
 		 446 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10490  glutamate dehydrogenase  58.07 
 
 		 451 aa  517  1.0000000000000001e-145  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000302045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0707  glutamate dehydrogenase  58.03 
 
 		 446 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.469869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0706  glutamate dehydrogenase  58.03 
 
 		 446 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0916886 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02515  glutamate dehydrogenase  55.96 
 
 		 447 aa  509  1e-143  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0610  glutamate dehydrogenase  58.66 
 
 		 443 aa  511  1e-143  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0929396 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4483  glutamate dehydrogenase  58.47 
 
 		 447 aa  509  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0286  glutamate dehydrogenase  56.92 
 
 		 450 aa  509  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000707094  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1895  glutamate dehydrogenase  56.19 
 
 		 450 aa  511  1e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1510  glutamate dehydrogenase  55.11 
 
 		 450 aa  506  9.999999999999999e-143  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.299473  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0826  glutamate dehydrogenase  57.14 
 
 		 444 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0743965  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000352  NADP-specific glutamate dehydrogenase  56.32 
 
 		 450 aa  504  1e-141  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4200  glutamate dehydrogenase  57.56 
 
 		 447 aa  504  1e-141  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0977  glutamate dehydrogenase  56.28 
 
 		 447 aa  503  1e-141  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0965022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2481  glutamate dehydrogenase  58.72 
 
 		 447 aa  502  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.231621  normal  0.944687 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1984  glutamate dehydrogenase  58.72 
 
 		 447 aa  502  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000158842  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01730  glutamate dehydrogenase  58.26 
 
 		 447 aa  501  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00719623  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1881  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  58.26 
 
 		 447 aa  501  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.53168  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2014  glutamate dehydrogenase  58.49 
 
 		 447 aa  500  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1871  glutamate dehydrogenase  58.26 
 
 		 447 aa  501  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.598381  hitchhiker  0.000134113 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1429  glutamate dehydrogenase  58.49 
 
 		 447 aa  501  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00746713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0892  glutamate dehydrogenase  55.83 
 
 		 447 aa  499  1e-140  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01718  hypothetical protein  58.26 
 
 		 447 aa  501  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00971306  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1876  glutamate dehydrogenase  58.49 
 
 		 447 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0272489  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1426  glutamate dehydrogenase  58.49 
 
 		 447 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.91122 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0452  glutamate dehydrogenase  57.4 
 
 		 447 aa  498  1e-140  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0527  glutamate dehydrogenase  57.47 
 
 		 447 aa  498  1e-140  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000736482  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1845  glutamate dehydrogenase  58.26 
 
 		 447 aa  501  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0654574  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2047  glutamate dehydrogenase  58.49 
 
 		 447 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1393  glutamate dehydrogenase  58.49 
 
 		 447 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221099  normal  0.113397 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1286  glutamate dehydrogenase  57.37 
 
 		 447 aa  498  1e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000501948  hitchhiker  0.000436028 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5140  glutamate dehydrogenase  57.08 
 
 		 447 aa  495  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.299774  normal  0.273528 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2051  glutamate dehydrogenase  55.8 
 
 		 451 aa  498  1e-139  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.553496 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1410  glutamate dehydrogenase  58.26 
 
 		 447 aa  498  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.666126  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>