41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_08860 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_08860  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00968271  normal  0.0225487 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1397  tRNA-Arg  91.04 
 
 
73 bp  85.7  0.000000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0003  tRNA-Arg  91.67 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000176947  hitchhiker  0.0000474018 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0041  tRNA-Arg  87.84 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00651741  normal  0.289964 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0022  tRNA-Arg  87.5 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000193997 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0037  tRNA-Arg  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0043  tRNA-Arg  89.66 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0685094  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0007  tRNA-Arg  90.38 
 
 
73 bp  63.9  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13110  tRNA-Arg  87.93 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0488167  normal  0.646736 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0018  tRNA-Arg  86.96 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0013  tRNA-Arg  84.93 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.195236 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19600  tRNA-Arg  94.29 
 
 
76 bp  54  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0108959  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0713  tRNA-Arg  88.14 
 
 
77 bp  54  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t09  tRNA-Arg  88.14 
 
 
74 bp  54  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.146869  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0042  tRNA-Arg  94.29 
 
 
76 bp  54  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0060  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  52  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.530052  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02560  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  52  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.574761  hitchhiker  0.000017399 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0048  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.427603  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0037  tRNA-Arg  85.96 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.462586  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0017  tRNA-Arg  87.72 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.915469  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0029  tRNA-Arg  94.44 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0020  tRNA-Arg  94.44 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0945602  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0023  tRNA-Arg  89.58 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000416946  unclonable  9.7747e-19 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0010  tRNA-Arg  91.43 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000187587  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t39  tRNA-Arg  91.43 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107973  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0031  tRNA-Arg  89.74 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0023  tRNA-Arg  86.44 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0598975  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0033  tRNA-Arg  89.74 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000397698  normal  0.298215 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0020  tRNA-Arg  91.43 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000000806008  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0025  tRNA-Arg  90.7 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0009  tRNA-Arg  85.07 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09730  tRNA-Arg  96.3 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0036  tRNA-Arg  85.07 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  1.49468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0045  tRNA-Arg  91.43 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000300165  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0046  tRNA-Arg  91.43 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177541  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0034  tRNA-Arg  89.47 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.9068  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0017  tRNA-Arg  89.47 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0044  tRNA-Arg  89.47 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.959306  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0045  tRNA-Arg  88.1 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0259026  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0032  tRNA-Arg  93.33 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0032  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0441272 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>