225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_04980 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_04980  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  100 
 
 		 261 aa  518  1e-146  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.424876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  23.58 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  25.42 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  26.74 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  24.69 
 
 		 275 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  25.51 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5083  3-oxoadipate enol-lactonase  30.43 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  26.89 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  25.63 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  24.28 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2192  alpha/beta hydrolase fold protein  25.66 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000941808  hitchhiker  0.00021747 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2836  alpha/beta hydrolase fold protein  24.35 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.387629  normal  0.68472 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  27 
 
 		 393 aa  57.4  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  24.27 
 
 		 275 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  26.57 
 
 		 288 aa  57  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  22.54 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  22.27 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  21.31 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  26.26 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  22.54 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  24.8 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 		 288 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0753  alpha/beta fold family hydrolase  24.18 
 
 		 266 aa  54.7  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1778  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 		 366 aa  54.3  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0401666  normal  0.253947 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3415  alpha/beta hydrolase fold  25.76 
 
 		 256 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  21.32 
 
 		 262 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  31.67 
 
 		 312 aa  53.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1764  alpha/beta hydrolase fold  24.27 
 
 		 256 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  27.24 
 
 		 312 aa  52.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  27.01 
 
 		 288 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 312 aa  52.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 271 aa  52.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1023  alpha/beta family hydrolase  22.96 
 
 		 287 aa  52.4  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1773  alpha/beta hydrolase fold  27.33 
 
 		 243 aa  52.4  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000223645  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1287  alpha/beta hydrolase fold protein  28.04 
 
 		 255 aa  52  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00130508  normal  0.0205637 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1664  polyketide synthase, putative  35.35 
 
 		 2082 aa  51.6  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.685154  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4130  alpha/beta hydrolase fold protein  23.58 
 
 		 301 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0670  alpha/beta hydrolase fold  28.51 
 
 		 254 aa  52  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  24.02 
 
 		 308 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  25.42 
 
 		 237 aa  51.2  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.809032  normal  0.841425 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2349  alpha/beta hydrolase fold protein  26.17 
 
 		 288 aa  50.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  25.76 
 
 		 256 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  27.41 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  26.88 
 
 		 251 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  34.04 
 
 		 350 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  34.65 
 
 		 290 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7062  alpha/beta hydrolase fold  25.52 
 
 		 296 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  27.11 
 
 		 261 aa  50.1  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4501  alpha/beta hydrolase fold protein  26.52 
 
 		 285 aa  49.7  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.569639  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4611  alpha/beta hydrolase fold  25.22 
 
 		 259 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2252  alpha/beta fold family hydrolase  24.83 
 
 		 242 aa  49.7  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0246146  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4719  alpha/beta hydrolase fold protein  25.29 
 
 		 282 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1720  thioesterase, menaquinone synthesis protein  25.58 
 
 		 265 aa  49.7  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2417  alpha/beta fold family hydrolase  24.83 
 
 		 242 aa  49.7  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.286524  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3643  alpha/beta hydrolase fold  32.12 
 
 		 284 aa  49.3  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  24.92 
 
 		 299 aa  49.7  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2162  bioH protein  25 
 
 		 266 aa  49.3  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  23.11 
 
 		 263 aa  49.3  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1078  alpha/beta hydrolase fold  24.87 
 
 		 260 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.045467  normal  0.0264161 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35123  predicted protein  23.63 
 
 		 348 aa  48.9  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1629  3-oxoadipate enol-lactonase  23.83 
 
 		 260 aa  48.9  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2792  alpha/beta hydrolase fold protein  24.05 
 
 		 260 aa  48.9  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1487  alpha/beta hydrolase fold protein  25.1 
 
 		 267 aa  48.9  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.672056  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03173  hypothetical protein  33 
 
 		 272 aa  48.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.188182 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2211  alpha/beta fold family hydrolase  27.21 
 
 		 240 aa  48.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000336996  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  22.71 
 
 		 279 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  28.72 
 
 		 263 aa  48.5  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1381  alpha/beta hydrolase fold protein  33.98 
 
 		 277 aa  48.5  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5558  alpha/beta hydrolase fold protein  26.99 
 
 		 227 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  22.34 
 
 		 262 aa  48.1  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  22.81 
 
 		 279 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0317  carboxylesterase  25.34 
 
 		 292 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2435  hydrolase, alpha/beta fold family  24.16 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  20.51 
 
 		 253 aa  47.8  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4310  alpha/beta hydrolase fold protein  30.53 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.680972  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3924  bioH protein  23.41 
 
 		 255 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5471  alpha/beta hydrolase fold protein  25.32 
 
 		 255 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1586  alpha/beta hydrolase fold  26.29 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 285 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3143  alpha/beta hydrolase fold protein  28.74 
 
 		 265 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4117  bioH protein  24.21 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  25.82 
 
 		 270 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 285 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0312  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 285 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2171  alpha/beta hydrolase fold  20.45 
 
 		 312 aa  47.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  28.4 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  25.73 
 
 		 263 aa  47.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  23.63 
 
 		 264 aa  47.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2332  alpha/beta hydrolase fold  23.66 
 
 		 335 aa  47  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0279052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3055  Alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 281 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610584 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0178  alpha/beta fold family hydrolase  25.41 
 
 		 296 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  23.13 
 
 		 273 aa  47  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  32.5 
 
 		 291 aa  47  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  24.71 
 
 		 297 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1793  alpha/beta hydrolase fold protein  20.49 
 
 		 291 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000234271  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>