More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_00330 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_00330  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  100 
 
 		 329 aa  648    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.6279 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0726  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.5 
 
 		 366 aa  254  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.642345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.62 
 
 		 339 aa  241  9e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.71 
 
 		 347 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.48 
 
 		 317 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00194851  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 360 aa  223  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0340631  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.03 
 
 		 342 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0031  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.22 
 
 		 340 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.22 
 
 		 340 aa  202  8e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0147442  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.04 
 
 		 340 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.15 
 
 		 354 aa  193  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.718494 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.39 
 
 		 351 aa  193  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.358421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0888  ketoacyl reductase  39.69 
 
 		 355 aa  191  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.56 
 
 		 344 aa  162  6e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.753226  normal  0.910238 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 		 323 aa  162  6e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.132666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0761  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 		 277 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1733  short chain dehydrogenase  33.68 
 
 		 286 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.61 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.81 
 
 		 279 aa  106  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319463  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl172  dehydrogenase  31.43 
 
 		 279 aa  106  7e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3107  acetoacetyl-CoA reductase  34.76 
 
 		 240 aa  106  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0353  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 		 262 aa  105  8e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.12 
 
 		 267 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.282255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1687  short chain dehydrogenase  38.42 
 
 		 279 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.69 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1778  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.54 
 
 		 243 aa  104  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.809428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4149  acetoacetyl-CoA reductase  35.14 
 
 		 241 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.738636 
 
 
-
 
NC_004310  BR1779  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, putative  34.78 
 
 		 263 aa  104  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0533  acetoacetyl-CoA reductase  35.68 
 
 		 241 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2506  short chain dehydrogenase  30.73 
 
 		 291 aa  103  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.3 
 
 		 261 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46420  short chain dehydrogenase  37.16 
 
 		 277 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000350021  hitchhiker  0.000971378 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2590  short chain dehydrogenase  30.21 
 
 		 291 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2507  short chain dehydrogenase  30.21 
 
 		 291 aa  103  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1682  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  35.29 
 
 		 260 aa  103  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2778  short chain dehydrogenase  30.21 
 
 		 281 aa  102  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2783  short chain dehydrogenase  30.21 
 
 		 291 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0502462 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 		 291 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 		 291 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 		 291 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403602  normal  0.010149 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2586  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.73 
 
 		 348 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1122  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.7 
 
 		 263 aa  102  9e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.73 
 
 		 348 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.72 
 
 		 238 aa  101  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.73 
 
 		 348 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4855  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.22 
 
 		 274 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0508  acetoacetyl-CoA reductase  35.68 
 
 		 241 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0305  acetoacetyl-CoA reductase  35.68 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.108778  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  28.32 
 
 		 295 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2806  short chain dehydrogenase  30.77 
 
 		 291 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.928497  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.55 
 
 		 278 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.314719  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1337  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.15 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.541378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.87 
 
 		 281 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243534  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0273  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.68 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3821  acetoacetyl-CoA reductase  33.51 
 
 		 241 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4092  acetoacetyl-CoA reductase  32.62 
 
 		 240 aa  100  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1171  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2186  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.07 
 
 		 241 aa  100  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2750  acetoacetyl-CoA reductase  37.21 
 
 		 246 aa  100  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.826289  normal  0.454733 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3689  acetoacetyl-CoA reductase  34.41 
 
 		 241 aa  100  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2393  short chain dehydrogenase  33.69 
 
 		 344 aa  100  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.59 
 
 		 264 aa  100  3e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.57 
 
 		 272 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.07 
 
 		 276 aa  100  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2827  short chain dehydrogenase  29.17 
 
 		 291 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.62 
 
 		 293 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.97 
 
 		 267 aa  100  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.676071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0244  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 		 291 aa  100  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.864634 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2059  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  31.55 
 
 		 247 aa  100  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0884699 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl173  dehydrogenase  29.69 
 
 		 278 aa  99.8  6e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3123  acetoacetyl-CoA reductase  34.05 
 
 		 246 aa  99.8  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 		 293 aa  99.8  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.935944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12520  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  32.61 
 
 		 263 aa  99.8  7e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.45 
 
 		 289 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312268  normal  0.0519409 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7613  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.51 
 
 		 241 aa  99  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0792782 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2916  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 		 272 aa  99  9e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.971691  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11068  oxidoreductase  35.45 
 
 		 301 aa  99  9e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.205536 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 		 252 aa  99.4  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0943  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.05 
 
 		 293 aa  99  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 282 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 		 293 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.993386  normal  0.426918 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 		 271 aa  98.6  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0505  acetoacetyl-CoA reductase  36.22 
 
 		 241 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0483754 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1247  acetoacetyl-CoA reductase  34.76 
 
 		 241 aa  99  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 		 277 aa  98.6  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.875416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1946  acetoacetyl-CoA reductase  36.56 
 
 		 242 aa  98.6  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2541  short chain dehydrogenase  29.59 
 
 		 291 aa  97.8  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000142979  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3122  acetoacetyl-CoA reductase  34.38 
 
 		 246 aa  98.2  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.868541  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.05 
 
 		 249 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.311099  normal  0.357873 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 		 268 aa  97.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.122827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.98 
 
 		 261 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.05 
 
 		 251 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2486  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  32.8 
 
 		 248 aa  98.2  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.38654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6443  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.05 
 
 		 259 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0150364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0426  acetoacetyl-CoA reductase  33.69 
 
 		 241 aa  97.4  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0843  short chain dehydrogenase  33.88 
 
 		 275 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2997  acetoacetyl-CoA reductase  32.43 
 
 		 241 aa  97.4  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.685049 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2582  short chain dehydrogenase  29.17 
 
 		 291 aa  97.4  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0166341  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 282 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.57 
 
 		 249 aa  97.4  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.617745 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>