More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3979 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3979  exodeoxyribonuclease III Xth  100 
 
 		 273 aa  552  1e-156  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.573727 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1195  exodeoxyribonuclease III Xth  56.52 
 
 		 277 aa  300  2e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000488572 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2985  exodeoxyribonuclease III Xth  55.93 
 
 		 269 aa  280  2e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1121  exodeoxyribonuclease III Xth  56.52 
 
 		 273 aa  279  3e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.442392  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04750  exodeoxyribonuclease III  56.2 
 
 		 308 aa  275  7e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.989341  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0757  exodeoxyribonuclease III Xth  52.13 
 
 		 279 aa  263  2e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.198669  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0698  exodeoxyribonuclease III Xth  49.81 
 
 		 287 aa  259  2e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.13034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27900  exodeoxyribonuclease III Xth  49.81 
 
 		 266 aa  251  1e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.408548  normal  0.79978 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05100  exodeoxyribonuclease III  49.44 
 
 		 265 aa  250  2e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2498  exodeoxyribonuclease III Xth  54.41 
 
 		 276 aa  246  2e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6475  exodeoxyribonuclease III Xth  49.45 
 
 		 264 aa  242  6e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5745  exodeoxyribonuclease III Xth  47.6 
 
 		 294 aa  238  5.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21350  exodeoxyribonuclease III Xth  48.9 
 
 		 273 aa  238  9e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1541  AP endonuclease  48.31 
 
 		 267 aa  234  9e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.241112  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0490  putative exodeoxyribonuclease III  44.56 
 
 		 288 aa  233  2.0000000000000002e-60  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.114528 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1556  exodeoxyribonuclease III Xth  49.09 
 
 		 270 aa  232  6e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0939703 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0258  exonuclease III  43.26 
 
 		 286 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.209471  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4873  exodeoxyribonuclease III Xth  46.93 
 
 		 274 aa  224  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0668549  normal  0.0519409 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3225  exodeoxyribonuclease III Xth  44.4 
 
 		 265 aa  219  3.9999999999999997e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  hitchhiker  0.00000209509 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1211  exodeoxyribonuclease III (xth)  46.04 
 
 		 263 aa  215  7e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.136043  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1228  exodeoxyribonuclease III Xth  46.04 
 
 		 263 aa  215  7e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.879131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1238  exodeoxyribonuclease III Xth  46.04 
 
 		 263 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.15014 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1767  exodeoxyribonuclease III Xth  44.56 
 
 		 278 aa  213  3.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2193  exodeoxyribonuclease III Xth  47.04 
 
 		 267 aa  208  6e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000941808  hitchhiker  0.000239022 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0948  exodeoxyribonuclease III Xth  43.53 
 
 		 272 aa  207  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.875165  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10160  exodeoxyribonuclease III  40.58 
 
 		 307 aa  199  3.9999999999999996e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3929  exodeoxyribonuclease III  36.06 
 
 		 263 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0321  exodeoxyribonuclease III  39.1 
 
 		 257 aa  176  3e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.323864  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4050  exodeoxyribonuclease III Xth  38.72 
 
 		 262 aa  176  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000121179 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0685  exodeoxyribonuclease III Xth  37.31 
 
 		 260 aa  175  7e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0109  exodeoxyribonuclease III Xth  38.43 
 
 		 261 aa  175  8e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0626468  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0254  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  38.29 
 
 		 259 aa  174  9.999999999999999e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0331  exodeoxyribonuclease III Xth  36.94 
 
 		 259 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0057  exodeoxyribonuclease III Xth  37.69 
 
 		 259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4393  exodeoxyribonucleaseiii xth  36.94 
 
 		 259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.599259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0123  AP endonuclease  38.06 
 
 		 259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0194  AP endonuclease  37.04 
 
 		 258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0227  exodeoxyribonuclease III Xth  34.53 
 
 		 267 aa  171  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0233  exodeoxyribonuclease III Xth  34.53 
 
 		 267 aa  171  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0277  exodeoxyribonuclease III Xth  37.77 
 
 		 267 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0273673  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0702  hypothetical protein  34.57 
 
 		 260 aa  171  1e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0684  hypothetical protein  34.57 
 
 		 260 aa  171  1e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  35.69 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2277  exodeoxyribonuclease III Xth  38.46 
 
 		 291 aa  171  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3102  exodeoxyribonuclease III Xth  36.53 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0042  exodeoxyribonuclease III Xth  36.19 
 
 		 261 aa  169  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.169682 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0036  exodeoxyribonuclease III Xth  36.19 
 
 		 261 aa  169  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0151  exodeoxyribonuclease III  36.19 
 
 		 256 aa  169  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2379  exodeoxyribonuclease III  36.9 
 
 		 256 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124522  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2780  exodeoxyribonuclease III  36.9 
 
 		 256 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0167  exodeoxyribonuclease III  36.9 
 
 		 256 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.580227  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0186  exodeoxyribonuclease III  36.9 
 
 		 256 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0371  exodeoxyribonuclease III  36.9 
 
 		 256 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0175  exodeoxyribonuclease III  36.9 
 
 		 256 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2299  exodeoxyribonuclease III  36.9 
 
 		 256 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.87728  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0070  exodeoxyribonuclease III Xth  38.24 
 
 		 257 aa  169  6e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0140  putative exodeoxyribonuclease III protein  35.69 
 
 		 261 aa  168  8e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3160  exodeoxyribonuclease III Xth  36.4 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0485064  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3043  exodeoxyribonuclease III Xth  36.4 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0224  exodeoxyribonuclease III  34.83 
 
 		 259 aa  166  4e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.465844  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6456  exodeoxyribonuclease III xth  35.42 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2008  exodeoxyribonuclease III Xth  34.57 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0039  exodeoxyribonuclease III Xth  35.66 
 
 		 256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0149  exodeoxyribonuclease III (xth)  36.57 
 
 		 258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0288  exodeoxyribonuclease III Xth  32.48 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923056 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1725  exodeoxyribonuclease III Xth  33.09 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.569641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2491  exodeoxyribonuclease III (xth)  35.06 
 
 		 257 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.510804  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3121  exodeoxyribonuclease III Xth  35.06 
 
 		 257 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0339  exodeoxyribonuclease III Xth  34.88 
 
 		 267 aa  159  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3105  exodeoxyribonuclease III Xth  35.06 
 
 		 257 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30930  exodeoxyribonuclease III Xth  36.57 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1619  exodeoxyribonuclease III Xth  35.74 
 
 		 266 aa  153  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.8373 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0403  exodeoxyribonuclease III  35.19 
 
 		 259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1784  exodeoxyribonuclease III  34.81 
 
 		 259 aa  150  3e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02934  exodeoxyribonuclease III  36.33 
 
 		 266 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.636028  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0089  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  36.4 
 
 		 263 aa  146  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0167  exodeoxyribonuclease III Xth  29.81 
 
 		 319 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.201775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0461  exodeoxyribonuclease III (xth)  38.49 
 
 		 267 aa  144  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.25576  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02870  catabolite repression control protein; Crc  35.19 
 
 		 259 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0295  exodeoxyribonuclease III Xth  34.17 
 
 		 266 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.049779 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0121  exodeoxyribonuclease III Xth  34.88 
 
 		 266 aa  142  5e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00155792  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6108  catabolite repression control protein  34.07 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0466604  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70390  catabolite repression control protein  34.07 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0138  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  34.52 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.287048  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0215  exodeoxyribonuclease III xth  34.44 
 
 		 259 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5545  exodeoxyribonuclease III xth  34.07 
 
 		 259 aa  137  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0079  exodeoxyribonuclease III, putative  34.07 
 
 		 259 aa  136  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0180  exodeoxyribonuclease III Xth  34.07 
 
 		 259 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.101584  hitchhiker  0.00000710685 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5292  exodeoxyribonuclease III Xth  33.7 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.328538 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5341  exodeoxyribonuclease III Xth  33.7 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11599  hitchhiker  0.00893933 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5200  exodeoxyribonuclease III Xth  33.7 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.293544  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1192  exodeoxyribonuclease III  32.94 
 
 		 250 aa  132  7.999999999999999e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0173462  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4384  exodeoxyribonuclease III Xth  31.95 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465503  normal  0.053083 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1377  exodeoxyribonuclease III  32.55 
 
 		 250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00689884  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0618  exodeoxyribonuclease III Xth  30.48 
 
 		 258 aa  129  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000157128 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0785  exodeoxyribonuclease III Xth  33.2 
 
 		 251 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4586  exodeoxyribonuclease III Xth  34.5 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000013952  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0823  exodeoxyribonuclease III  32.08 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4271  exodeoxyribonuclease III Xth  32.08 
 
 		 256 aa  125  6e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1734  exodeoxyribonuclease III  31.37 
 
 		 256 aa  125  7e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00350824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>