157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3308 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3308  stress protein  100 
 
 
192 aa  389  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.195262  normal  0.460573 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3190  stress protein  64.43 
 
 
192 aa  241  3.9999999999999997e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.029979  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33940  uncharacterized stress response protein, TerZ- and CABP1  63.21 
 
 
191 aa  241  3.9999999999999997e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.307138  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4657  stress protein  53.85 
 
 
193 aa  215  4e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.325263  normal  0.761079 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0079  stress protein  51.94 
 
 
205 aa  214  5e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.244583  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0824  stress protein  58.85 
 
 
189 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0767  stress protein  52.94 
 
 
202 aa  209  2e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.393122 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1008  stress protein  53.81 
 
 
195 aa  209  3e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0761  tellurium resitance protein TerZ  51.72 
 
 
202 aa  207  7e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00228615  normal  0.0996912 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0274  stress protein  53.44 
 
 
197 aa  203  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.894091 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3019  stress protein  55.8 
 
 
193 aa  203  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000174697  hitchhiker  0.000454743 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0635  stress response protein  53.3 
 
 
193 aa  194  5.000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0940  tellurium resistance protein TerZ  49.74 
 
 
197 aa  187  8e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.809418  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0893  stress protein  50.26 
 
 
194 aa  185  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0808  stress protein  50.26 
 
 
197 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.343161  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4765  stress protein  53.22 
 
 
411 aa  174  5e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.428894  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0900  stress protein  50 
 
 
479 aa  172  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.204273 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3818  stress protein  50 
 
 
493 aa  169  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.139495  normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1350  tellurium resistance protein TerZ  44.33 
 
 
193 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00284326  normal  0.578041 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3694  stress protein  46.77 
 
 
193 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00340813  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33930  uncharacterized stress response protein, TerZ- and CABP1  43.16 
 
 
528 aa  159  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.333866  normal  0.940831 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3789  tellurium resistance protein  44.95 
 
 
197 aa  156  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000192463  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0662  tellurium resistance protein  44.95 
 
 
208 aa  156  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000181473  normal  0.379658 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3877  stress protein  44.95 
 
 
197 aa  156  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000165459  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2121  stress protein  42.5 
 
 
199 aa  145  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0366485  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2077  stress protein  42.5 
 
 
199 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3014  stress protein  48.07 
 
 
191 aa  143  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285537  decreased coverage  0.0000397656 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3799  stress protein  46.96 
 
 
191 aa  142  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.331273  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3193  stress protein  46.96 
 
 
191 aa  141  7e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0230614  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4751  stress protein  44.75 
 
 
222 aa  140  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4495  stress protein  43.55 
 
 
190 aa  136  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3192  stress protein  45.3 
 
 
192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0229432  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0812  stress protein  43.55 
 
 
191 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0927338  normal  0.415217 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2078  stress protein  43.09 
 
 
192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3785  tellurium resistance protein  43.55 
 
 
192 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0102756  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0666  tellurium resistance protein  43.55 
 
 
192 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00208904  normal  0.398631 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3873  stress protein  43.55 
 
 
192 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3677  stress protein  41.44 
 
 
191 aa  131  6e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2122  stress protein  43.09 
 
 
192 aa  131  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0739458  normal  0.468561 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0270  stress protein  42.54 
 
 
191 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.384965 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33960  uncharacterized stress response protein, TerZ- and CABP1  43.65 
 
 
191 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0635194  normal  0.586305 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1054  stress protein  40.88 
 
 
191 aa  129  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3021  stress protein  43.09 
 
 
192 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00454465  hitchhiker  0.000498686 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3311  stress protein  40.88 
 
 
191 aa  128  6e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.136356 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5053  stress protein  40.1 
 
 
200 aa  127  7.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.384692  normal  0.439248 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0386  stress protein  41.4 
 
 
192 aa  127  8.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.761151  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2120  stress protein  40.43 
 
 
192 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0143774  normal  0.660926 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2076  stress protein  40.43 
 
 
192 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2993  stress protein  43.65 
 
 
191 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125337  normal  0.482058 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0384  stress protein  39.9 
 
 
198 aa  125  5e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0894  stress protein  44.51 
 
 
192 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0514  tellurium resistance protein  39.46 
 
 
194 aa  124  9e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0633  stress response protein  40.32 
 
 
192 aa  124  1e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2575  stress protein, tellurium resistance protein  40.88 
 
 
191 aa  123  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0599236  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0385  stress protein  39.46 
 
 
194 aa  124  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1266  stress protein, tellurium resistance protein  40.86 
 
 
192 aa  122  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169653  normal  0.976028 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0575  stress protein  42.31 
 
 
191 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.967335 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3020  stress protein  43.96 
 
 
191 aa  123  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000240032  hitchhiker  0.000509226 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4435  stress protein  43.09 
 
 
192 aa  122  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263742  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0514  tellurium resistance protein  38.92 
 
 
194 aa  122  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000566195  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0465  tellurium resistance protein  38.38 
 
 
194 aa  122  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0374  TerD family tellurium resistance protein  38.92 
 
 
196 aa  122  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0190883  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0771  stress protein  39.78 
 
 
191 aa  122  4e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0386  tellurium resistance protein  38.38 
 
 
196 aa  121  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00658457  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0377  TerD family tellurium resistance protein  38.38 
 
 
196 aa  121  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0373  TerD family tellurium resistance protein  39.7 
 
 
198 aa  121  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0765  tellurium resistance protein  39.78 
 
 
191 aa  122  5e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.105936 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4859  tellurium resistance protein  38.38 
 
 
194 aa  122  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.311448  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0385  tellurium resistance protein  39.2 
 
 
198 aa  121  7e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0376  TerD family tellurium resistance protein  39.2 
 
 
198 aa  121  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0399  tellurium resistance protein  39.2 
 
 
198 aa  121  7e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.770902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0400  tellurium resistance protein  38.38 
 
 
194 aa  121  7e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.909133  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0444  tellurium resistance protein  38.38 
 
 
194 aa  121  7e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0576  stress protein  37.37 
 
 
200 aa  121  7e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0464  putative tellurium resistance protein  39.2 
 
 
198 aa  121  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000175356  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4860  putative tellurium resistance protein  39.2 
 
 
198 aa  121  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.453305  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0336  stress protein  41.99 
 
 
190 aa  121  7e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0443  putative tellurium resistance protein  39.2 
 
 
198 aa  121  7e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0375  TerD family tellurium resistance protein  40.32 
 
 
192 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000676641  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0380  stress protein  38.38 
 
 
194 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0513  putative tellurium resistance protein  38.69 
 
 
198 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0111767  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0515  tellurium resistance protein  40.32 
 
 
192 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204863  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0515  tellurium resistance protein  39.78 
 
 
192 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.742736  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3698  stress protein  39.78 
 
 
192 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.335796  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0466  tellurium resistance protein  39.78 
 
 
192 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000974817  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0379  stress protein  38.69 
 
 
198 aa  119  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0378  TerD family tellurium resistance protein  39.78 
 
 
192 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0937193  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1002  stress protein  39.78 
 
 
192 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.113516  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0445  tellurium resistance protein  39.78 
 
 
192 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4858  tellurium resistance protein  39.78 
 
 
192 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00851793  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1354  tellurium resistance protein TerD  39.78 
 
 
192 aa  118  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0010671  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0944  tellurium resistance protein TerD  40.32 
 
 
191 aa  117  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0513  tellurium resistance protein, putative  36.04 
 
 
198 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0813  stress protein  41.76 
 
 
192 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.492413  normal  0.641947 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6572  stress protein  39.46 
 
 
194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3686  stress protein  37.68 
 
 
214 aa  115  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.333292  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0507  tellurium resistance protein  36.59 
 
 
213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1087  tellurium resistance protein  36.59 
 
 
213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0381  stress protein  38.71 
 
 
192 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0569  stress protein  36.59 
 
 
213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>