161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2204 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2204  hypothetical protein  100 
 
 
64 aa  129  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2661  hypothetical protein  73.33 
 
 
170 aa  75.5  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0335597  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2514  putative transposase  60 
 
 
125 aa  67.4  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2507  transposase  57.78 
 
 
125 aa  64.3  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0252  putative transposase  56.82 
 
 
139 aa  63.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2686  putative IS1648 transposase  48.84 
 
 
143 aa  54.7  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4818  ISPs1, transposase OrfA  57.78 
 
 
122 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886393  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4824  ISPs1, transposase OrfA  57.78 
 
 
122 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0214  Transposase and inactivated derivatives-like protein  52.17 
 
 
281 aa  53.9  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3213  Transposase and inactivated derivatives-like protein  52.17 
 
 
281 aa  53.9  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4088  Transposase and inactivated derivatives-like protein  50 
 
 
281 aa  52.4  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0292  putative transposase  48.89 
 
 
149 aa  52.8  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.4660800000000001e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1224  Transposase and inactivated derivatives-like protein  47.83 
 
 
281 aa  50.8  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3086  putative transposase  55.26 
 
 
126 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  50 
 
 
252 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6488  transposase  47.22 
 
 
103 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.659219  normal  0.853863 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4730  IS298, transposase OrfA  43.75 
 
 
129 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4670  hypothetical protein  51.52 
 
 
176 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46128  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0249  ISBm1, transposase orfA  50 
 
 
132 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00124682  hitchhiker  0.00649227 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2678  ISBm1, transposase orfA  50 
 
 
132 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272123  normal  0.0958121 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7669  transposase  47.22 
 
 
123 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.748537  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7093  transposase  47.22 
 
 
123 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.878817  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1157  transposase  47.22 
 
 
123 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  45.45 
 
 
260 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  45.45 
 
 
260 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  45.45 
 
 
260 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  45.45 
 
 
260 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4329  ISPs1, transposase OrfA  51.11 
 
 
122 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4160  putative transposase  58.33 
 
 
121 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1108  putative transposase  58.33 
 
 
121 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0005  putative transposase  47.83 
 
 
123 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1590  putative transposase  47.83 
 
 
123 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.587104  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2660  putative transposase  47.83 
 
 
123 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.521609  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2808  putative transposase  47.83 
 
 
123 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4348  putative transposase  47.83 
 
 
123 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6137  putative transposase  58.33 
 
 
121 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11060  transposase  40.43 
 
 
135 aa  47  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.869155 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1322  transposase  50 
 
 
124 aa  47  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1126  ISBm1, transposase orfA  46.51 
 
 
142 aa  47  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5873  Transposase and inactivated derivatives-like protein  55.56 
 
 
158 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000924968 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0214  transposase  50 
 
 
106 aa  46.2  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0309  ISBm1, transposase orfA  50 
 
 
121 aa  46.2  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801441  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0365  ISBm1, transposase orfA  50 
 
 
121 aa  46.2  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.631873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0842  ISBm1, transposase orfA  50 
 
 
121 aa  46.2  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387238 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1096  ISBm1, transposase orfA  50 
 
 
121 aa  46.2  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.274857 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1292  ISBm1, transposase orfA  50 
 
 
121 aa  46.2  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.699316  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1297  ISBm1, transposase orfA  50 
 
 
121 aa  46.2  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1358  ISBm1, transposase orfA  50 
 
 
121 aa  46.2  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299376  normal  0.593185 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1718  ISBm1, transposase orfA  50 
 
 
121 aa  46.2  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.000911297  normal  0.283895 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2224  ISBm1, transposase orfA  50 
 
 
121 aa  46.2  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1161  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2412  ISBm1, transposase orfA  50 
 
 
121 aa  46.2  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2821  ISBm1, transposase orfA  50 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2920  ISBm1, transposase orfA  50 
 
 
121 aa  46.2  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2922  ISBm1, transposase orfA  50 
 
 
121 aa  46.2  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4190  hypothetical protein  41.46 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4226  hypothetical protein  41.46 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0595  putative transposase  47.37 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444851  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3450  putative transposase  47.37 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4185  putative transposase  47.37 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.123129  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1322  Transposase and inactivated derivatives-like protein  45.95 
 
 
285 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0129  ISSod6 transposase  44.74 
 
 
92 aa  45.8  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5629  insertion sequence, putative  48.89 
 
 
244 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0007  transposase  50 
 
 
132 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.272336  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0181  transposase  50 
 
 
132 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.65132  normal  0.571083 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0972  transposase  50 
 
 
132 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.827485 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1283  transposase  50 
 
 
132 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.2132  normal  0.263939 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1289  transposase  50 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1397  ISBm1, transposase orfA  50 
 
 
121 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0173468  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1591  transposase  50 
 
 
132 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.602434 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2474  transposase  50 
 
 
132 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2499  transposase  50 
 
 
132 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.71476  normal  0.311216 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2823  transposase  50 
 
 
132 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2862  transposase  50 
 
 
132 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2925  transposase  50 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3014  transposase  50 
 
 
132 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3038  transposase  50 
 
 
132 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3115  transposase  50 
 
 
132 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0735642  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1962  hypothetical protein  48.72 
 
 
98 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.150746  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1222  transposase and inactivated derivative  47.37 
 
 
122 aa  45.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362267  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2704  transposase and inactivated derivative  47.37 
 
 
122 aa  45.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.905782  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  47.22 
 
 
254 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  47.22 
 
 
254 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  47.22 
 
 
254 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  47.22 
 
 
254 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  47.22 
 
 
254 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  47.22 
 
 
254 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  47.22 
 
 
254 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  47.22 
 
 
254 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  47.22 
 
 
254 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  47.22 
 
 
254 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  47.22 
 
 
254 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0077  transposase  41.46 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2346  ISPs1, transposase OrfA  43.24 
 
 
126 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4475  hypothetical protein  44.44 
 
 
259 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4008  putative IS1648 transposase  40.54 
 
 
138 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0533  ISBm1, transposase orfA  44.44 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0168543  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3276  transposase  45.95 
 
 
130 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1612  hypothetical protein  38.1 
 
 
253 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687153  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1002  hypothetical protein  38.1 
 
 
253 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0160346  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6331  hypothetical protein  38.1 
 
 
253 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>