More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1496 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1496  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
224 aa  441  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2221  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.1 
 
 
222 aa  192  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.281882  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2803  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.09 
 
 
216 aa  186  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2523  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.09 
 
 
216 aa  181  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000070944 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3521  amino acid ABC transporter permease  53.09 
 
 
189 aa  180  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0521838  normal  0.219342 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1223  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.64 
 
 
235 aa  177  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.217708 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1123  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  51.96 
 
 
223 aa  177  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.383699  normal  0.213543 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1592  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.54 
 
 
224 aa  176  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1429  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.4 
 
 
235 aa  175  6e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3288  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.26 
 
 
228 aa  174  8e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00269356  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1393  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.97 
 
 
235 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0376484 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2445  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.64 
 
 
224 aa  170  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.242091  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27720  amino acid ABC transporter membrane protein  46.58 
 
 
215 aa  170  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.63353  normal  0.398775 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15440  amino acid ABC transporter, permease protein, 3-TM region, His/Glu/Gln/Arg/opine family  48.79 
 
 
226 aa  169  2e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00886274  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22720  amino acid ABC transporter membrane protein  50.25 
 
 
224 aa  169  3e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36860  amino acid ABC transporter membrane protein  51.96 
 
 
216 aa  169  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.989507 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3970  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.75 
 
 
226 aa  166  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2154  amino acid ABC transporter permease  48.69 
 
 
226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2200  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.69 
 
 
226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104436  normal  0.0317126 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2205  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.74 
 
 
223 aa  165  5.9999999999999996e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1245  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.47 
 
 
225 aa  165  5.9999999999999996e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2141  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.17 
 
 
226 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.619371  hitchhiker  0.00623238 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3989  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.83 
 
 
233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.197568  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0808  amino acid ABC transporter, permease protein, 3-TM region, His/Glu/Gln/Arg/opine  43.41 
 
 
224 aa  162  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2426  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  52.2 
 
 
226 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.743713  normal  0.103814 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1450  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.12 
 
 
215 aa  161  8.000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0670  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.9 
 
 
224 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.45389  normal  0.251162 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1549  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.92 
 
 
218 aa  149  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0359918 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0022  amino acid ABC transporter permease  46.24 
 
 
225 aa  149  3e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.110692  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1789  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.78 
 
 
227 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3914  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.33 
 
 
215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2807  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.9 
 
 
217 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0788  ABC transporter, permease protein  41.44 
 
 
225 aa  129  3e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30070  amino acid ABC transporter membrane protein  40.54 
 
 
232 aa  124  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0554  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.36 
 
 
218 aa  122  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1513  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.49 
 
 
212 aa  120  9.999999999999999e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.99 
 
 
214 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0101432  normal  0.124275 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0608  amino acid ABC transporter permease  34.7 
 
 
218 aa  116  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0191188  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0552  glutamine ABC transporter permease  34.7 
 
 
218 aa  116  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3985  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  40.64 
 
 
220 aa  116  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.948359 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0698  amino acid ABC transporter, permease protein  34.7 
 
 
218 aa  116  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0641  amino acid ABC transporter permease  34.7 
 
 
218 aa  116  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00751047  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4661  amino acid ABC transporter, permease protein  34.25 
 
 
218 aa  115  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.128052  hitchhiker  2.19299e-21 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0542  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.86 
 
 
233 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0553  glutamine ABC transporter permease  34.7 
 
 
218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.421713  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0709  amino acid ABC transporter, permease protein  34.25 
 
 
218 aa  113  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1475  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.24 
 
 
217 aa  112  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0482  glutamate/aspartate transmembrane ABC transporter protein  35.45 
 
 
242 aa  111  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.441465 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0530  ABC-type amino acid transport system, permease component  34.88 
 
 
212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.928657  hitchhiker  0.000342419 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0770  amino acid ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
218 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2572  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.88 
 
 
246 aa  109  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0188674 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4044  ABC transporter permease  33.94 
 
 
248 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0677  amino acid ABC transporter, permease protein  33.79 
 
 
218 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46920  putative permease of ABC transporter  33.94 
 
 
248 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00588556 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2154  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.18 
 
 
233 aa  108  6e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2463  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.57 
 
 
231 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0304  ABC glutamate/aspartate transporter, inner membrane subunit GltJ  33.85 
 
 
248 aa  106  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0400  amino acid ABC transporter permease  35.16 
 
 
242 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.123104 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2097  ABC transporter permease  35.65 
 
 
285 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2070  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.57 
 
 
231 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0342054  normal  0.592732 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4172  amino acid ABC transporter, permease protein  33.03 
 
 
248 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.364835  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1181  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.18 
 
 
246 aa  106  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0647083 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0598  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter inner membrane protein  33.64 
 
 
246 aa  105  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.312716  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5602  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.47 
 
 
241 aa  105  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0469  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, permease protein EhuC  32.41 
 
 
216 aa  105  4e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1052  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.29 
 
 
218 aa  105  5e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.233768  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3361  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.18 
 
 
246 aa  105  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0235046  hitchhiker  0.00000227279 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0458  amino acid ABC transporter permease  35.86 
 
 
242 aa  105  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0358  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.32 
 
 
242 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0871077  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0359  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.87 
 
 
227 aa  104  8e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185979  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0374  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.87 
 
 
227 aa  104  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.49013  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3395  glutamate/aspartate ABC transporter, permease protein GltJ  33.95 
 
 
246 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0373  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.32 
 
 
242 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.25147  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0591  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.95 
 
 
246 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.273036  normal  0.437079 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3433  glutamate/aspartate transport system permease protein  33.95 
 
 
246 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0179732  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3756  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  33.95 
 
 
246 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1210  glutamate/aspartate ABC transporter, permease protein GltJ  33.95 
 
 
246 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0637  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.42 
 
 
246 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0335  amino acid ABC transporter permease  33.33 
 
 
248 aa  104  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3430  glutamate/aspartate ABC transporter, permease protein GltJ  33.95 
 
 
246 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0187  amino acid ABC transporter permease  34.42 
 
 
246 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2621  glutamate/aspartate ABC transporter, permease protein GltJ  33.95 
 
 
246 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0565  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.95 
 
 
246 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0670  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.42 
 
 
246 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15953  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0349  glutamate/aspartate ABC transporter, permease protein GltJ  33.95 
 
 
246 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0597857  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1923  amino acid ABC transporter permease/periplasmic protein  29.7 
 
 
714 aa  103  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.132292  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0343  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.78 
 
 
216 aa  103  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3962  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.91 
 
 
240 aa  102  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57318  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4330  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.91 
 
 
240 aa  102  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.152879 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2853  amino acid ABC transporter permease  33.64 
 
 
292 aa  102  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0684  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.08 
 
 
221 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0799785  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2713  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.42 
 
 
246 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5577  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
304 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2021  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.86 
 
 
337 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.871277  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1561  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.08 
 
 
249 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00198784  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0724  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.98 
 
 
241 aa  102  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0483  glutamate/aspartate transmembrane ABC transporter protein  34.05 
 
 
227 aa  102  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.431545 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2258  amino acid ABC transporter transmembrane protein  42.55 
 
 
231 aa  102  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4039  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.54 
 
 
231 aa  102  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2954  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.75 
 
 
246 aa  102  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>