58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0534 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0534  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  525  1e-148  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.645229  normal  0.0111523 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2449  hypothetical protein  69.76 
 
 		 270 aa  352  4e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5379  hypothetical protein  66.54 
 
 		 268 aa  346  3e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.477329  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0321  hypothetical protein  66.67 
 
 		 263 aa  343  2e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3512  hypothetical protein  72.08 
 
 		 269 aa  337  9e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.635527 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3555  protein of unknown function DUF1445  69.08 
 
 		 260 aa  334  1e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5849  hypothetical protein  65.84 
 
 		 268 aa  331  9e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00315108  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0498  hypothetical protein  61.87 
 
 		 264 aa  328  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2200  protein of unknown function DUF1445  67.61 
 
 		 262 aa  321  9.000000000000001e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5194  hypothetical protein  63.82 
 
 		 262 aa  318  5e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.633751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0093  hypothetical protein  62.75 
 
 		 270 aa  315  4e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5735  hypothetical protein  67.35 
 
 		 251 aa  310  1e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19220  hypothetical protein  63.86 
 
 		 270 aa  307  1.0000000000000001e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1142  hypothetical protein  53.73 
 
 		 261 aa  303  2.0000000000000002e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.585996  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3576  hypothetical protein  58.7 
 
 		 267 aa  297  1e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2483  hypothetical protein  61.04 
 
 		 259 aa  290  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0307873 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1597  hypothetical protein  57.09 
 
 		 265 aa  290  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22470  hypothetical protein  63.79 
 
 		 261 aa  288  6e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0174  hypothetical protein  53.66 
 
 		 279 aa  283  2.0000000000000002e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4424  hypothetical protein  57.54 
 
 		 254 aa  283  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0369265  normal  0.270561 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0707  protein of unknown function DUF1445  52.63 
 
 		 267 aa  280  1e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00164756  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1103  hypothetical protein  50.59 
 
 		 263 aa  274  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00199325  normal  0.0783421 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01960  hypothetical protein  53.06 
 
 		 256 aa  268  5e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3393  hypothetical protein  53.36 
 
 		 261 aa  265  5e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0256921 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0337  protein of unknown function DUF1445  48.02 
 
 		 255 aa  255  4e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.915447  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2409  hypothetical protein  55.12 
 
 		 259 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.558045  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4744  hypothetical protein  51.35 
 
 		 294 aa  253  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2570  hypothetical protein  54.03 
 
 		 266 aa  253  3e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.333865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4977  hypothetical protein  49.61 
 
 		 260 aa  250  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.589508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1097  hypothetical protein  53.12 
 
 		 271 aa  251  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00235966  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3292  hypothetical protein  55.16 
 
 		 271 aa  248  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1666  hypothetical protein  50.2 
 
 		 271 aa  248  6e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1435  hypothetical protein  50 
 
 		 261 aa  247  1e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3621  hypothetical protein  50.99 
 
 		 272 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.574773 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1776  hypothetical protein  52.17 
 
 		 274 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0657384 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2125  hypothetical protein  52.53 
 
 		 269 aa  244  6.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.04664  normal  0.0539112 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1947  hypothetical protein  49.61 
 
 		 272 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.334258  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3350  hypothetical protein  51.19 
 
 		 271 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.834671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5125  hypothetical protein  49.43 
 
 		 260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.039985 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2883  hypothetical protein  49.01 
 
 		 272 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126409 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2576  hypothetical protein  50.19 
 
 		 257 aa  243  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13975  predicted protein  49.39 
 
 		 290 aa  243  3e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.722114  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1846  hypothetical protein  51.2 
 
 		 272 aa  241  7e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.140697  normal  0.77685 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3969  hypothetical protein  48.85 
 
 		 257 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0539312 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5282  hypothetical protein  49.62 
 
 		 257 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3550  hypothetical protein  49.24 
 
 		 257 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.354619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3459  hypothetical protein  49.62 
 
 		 257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1731  hypothetical protein  44.36 
 
 		 269 aa  239  4e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.22733 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1503  hypothetical protein  48.02 
 
 		 276 aa  239  4e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.979061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3152  hypothetical protein  49 
 
 		 300 aa  236  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.808227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2364  hypothetical protein  51.87 
 
 		 257 aa  235  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2258  hypothetical protein  50.2 
 
 		 279 aa  231  1e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.761835 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4813  hypothetical protein  50.79 
 
 		 259 aa  231  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575572 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37210  hypothetical protein  51.65 
 
 		 265 aa  229  5e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00953297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0610  hypothetical protein  51.24 
 
 		 260 aa  227  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3193  hypothetical protein  50 
 
 		 265 aa  223  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05290  conserved hypothetical protein  43.61 
 
 		 276 aa  199  3e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2940  protein of unknown function DUF1445  56.31 
 
 		 137 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>