13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0018 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0018  O-antigen polymerase  100 
 
 		 460 aa  887    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00578846  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2284  O-antigen polymerase  28.03 
 
 		 452 aa  162  9e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0279  O-antigen polymerase family protein  33.83 
 
 		 595 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.297863  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0980  O-antigen polymerase family protein  33.83 
 
 		 661 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0650  O-antigen polymerase family protein  32.61 
 
 		 595 aa  45.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2679  O-antigen polymerase family protein  33.83 
 
 		 595 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2397  O-antigen polymerase family protein  33.83 
 
 		 595 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.233574  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0010  O-antigen polymerase family protein  33.83 
 
 		 595 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0817  O-antigen polymerase family protein  33.83 
 
 		 595 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0474  O-antigen polymerase  43.48 
 
 		 595 aa  45.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0821  O-antigen polymerase family protein  32.82 
 
 		 595 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1664  O-antigen polymerase  32.39 
 
 		 806 aa  44.7  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2712  O-antigen polymerase  30 
 
 		 413 aa  43.1  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0646679  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>