26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2275 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2275  phage antirepressor protein  100 
 
 		 256 aa  526  1e-148  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.22995 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3791  prophage antirepressor  39.6 
 
 		 283 aa  89.4  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3740  prophage antirepressor  39.6 
 
 		 283 aa  89.4  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1805  hypothetical protein  47.47 
 
 		 170 aa  87  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4013  BRO domain-containing protein  39.16 
 
 		 284 aa  86.3  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0396  gp79  47.31 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839853  hitchhiker  0.0000000000000292927 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0524  prophage antirepressor  36.67 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.844398  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0306  DNA-binding protein Roi  24.29 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000394975  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1112  DNA-binding protein Roi  24.29 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000052914  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1435  DNA-binding protein Roi  23.48 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2869  hypothetical protein  38.64 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000149564  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04260  hypothetical protein  40.48 
 
 		 103 aa  60.1  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01961  hypothetical protein  25.86 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0879  phage antirepressor protein  33.77 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00137369  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40570  phage protein  42.47 
 
 		 223 aa  55.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3645  hypothetical protein  35.96 
 
 		 216 aa  50.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.120899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2462  BRO-like protein  29.75 
 
 		 248 aa  48.5  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000468179  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1680  phage-encoded protein  34.55 
 
 		 239 aa  48.9  0.00009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2133  phage antirepressor protein  37.5 
 
 		 244 aa  47  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2183  phage regulatory protein  32.41 
 
 		 265 aa  46.6  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.408291 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2135  phage-encoded protein  42.42 
 
 		 260 aa  45.4  0.0008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000332219  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0803  prophage antirepressor  30.43 
 
 		 257 aa  44.7  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000145423  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2799  phage-encoded protein-like  26.9 
 
 		 204 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.181279  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1142  phage antirepressor protein  30.22 
 
 		 267 aa  44.3  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000418777  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2475  prophage antirepressor  27.5 
 
 		 261 aa  43.9  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000554878  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2913  Roi protein  27.5 
 
 		 240 aa  43.5  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00203388  hitchhiker  0.00000000000553867 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>