More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1592 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1592  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
224 aa  441  1e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2445  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  63.84 
 
 
224 aa  293  1e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.242091  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1245  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  61.78 
 
 
225 aa  266  2e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15440  amino acid ABC transporter, permease protein, 3-TM region, His/Glu/Gln/Arg/opine family  63.38 
 
 
226 aa  256  1e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00886274  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22720  amino acid ABC transporter membrane protein  60.27 
 
 
224 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0022  amino acid ABC transporter permease  54.67 
 
 
225 aa  242  3e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.110692  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0788  ABC transporter, permease protein  52 
 
 
225 aa  235  4e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2221  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.94 
 
 
222 aa  229  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.281882  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2205  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.88 
 
 
223 aa  203  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2154  amino acid ABC transporter permease  46.29 
 
 
226 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2200  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.29 
 
 
226 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104436  normal  0.0317126 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3970  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.72 
 
 
226 aa  198  6e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2141  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.29 
 
 
226 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.619371  hitchhiker  0.00623238 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1123  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  51.43 
 
 
223 aa  196  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.383699  normal  0.213543 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2426  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.41 
 
 
226 aa  193  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.743713  normal  0.103814 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1789  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.01 
 
 
227 aa  190  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1496  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.54 
 
 
224 aa  187  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3288  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.15 
 
 
228 aa  186  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00269356  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3989  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.2 
 
 
233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.197568  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0808  amino acid ABC transporter, permease protein, 3-TM region, His/Glu/Gln/Arg/opine  45.89 
 
 
224 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0670  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.55 
 
 
224 aa  170  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.45389  normal  0.251162 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2803  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.2 
 
 
216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2523  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.75 
 
 
216 aa  162  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000070944 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1450  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.34 
 
 
215 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27720  amino acid ABC transporter membrane protein  45.37 
 
 
215 aa  159  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.63353  normal  0.398775 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1429  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.05 
 
 
235 aa  156  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1549  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.44 
 
 
218 aa  152  4e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0359918 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1393  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.16 
 
 
235 aa  152  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0376484 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1223  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.78 
 
 
235 aa  151  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.217708 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3521  amino acid ABC transporter permease  43.98 
 
 
189 aa  150  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0521838  normal  0.219342 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3914  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.57 
 
 
215 aa  149  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36860  amino acid ABC transporter membrane protein  41.15 
 
 
216 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.989507 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2807  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.14 
 
 
217 aa  123  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0542  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.49 
 
 
233 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30070  amino acid ABC transporter membrane protein  37.7 
 
 
232 aa  115  6e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0554  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.4 
 
 
218 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0608  amino acid ABC transporter permease  34.67 
 
 
218 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0191188  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0552  glutamine ABC transporter permease  34.67 
 
 
218 aa  113  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0641  amino acid ABC transporter permease  34.67 
 
 
218 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00751047  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0698  amino acid ABC transporter, permease protein  34.67 
 
 
218 aa  112  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4661  amino acid ABC transporter, permease protein  33.78 
 
 
218 aa  112  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.128052  hitchhiker  2.19299e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0709  amino acid ABC transporter, permease protein  34.51 
 
 
218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0553  glutamine ABC transporter permease  34.67 
 
 
218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.421713  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00418  ABC-type amino acid transport system permease component  28.08 
 
 
246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0677  amino acid ABC transporter, permease protein  34.22 
 
 
218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.72 
 
 
214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0101432  normal  0.124275 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1475  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.36 
 
 
217 aa  109  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0770  amino acid ABC transporter, permease protein  33.63 
 
 
218 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4585  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
221 aa  107  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000297343  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2463  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.67 
 
 
231 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05951  ABC transporter ATP-binding/permease protein  31.55 
 
 
265 aa  107  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1430  amino acid ABC transporter permease  38.24 
 
 
233 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.813328  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3985  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  34.45 
 
 
220 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.948359 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2070  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.91 
 
 
231 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0342054  normal  0.592732 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0376  amino acid ABC transporter permease  32.69 
 
 
319 aa  105  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.45598 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1386  amino acid ABC transporter permease  30.77 
 
 
337 aa  105  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0693888  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000215  amino acid ABC transporter permease protein  30.58 
 
 
265 aa  105  7e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2021  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  27.45 
 
 
337 aa  105  8e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.871277  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2491  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  27.45 
 
 
335 aa  104  9e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1052  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.53 
 
 
218 aa  103  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.233768  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1513  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.22 
 
 
212 aa  103  3e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3153  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.36 
 
 
233 aa  102  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0765389 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1135  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.57 
 
 
566 aa  102  5e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.926141  normal  0.186794 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0442  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.77 
 
 
320 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1819  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.06 
 
 
334 aa  102  6e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5023  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  30.77 
 
 
320 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0963279  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4897  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.77 
 
 
320 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.691189  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5073  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.77 
 
 
320 aa  101  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0469  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, permease protein EhuC  32.21 
 
 
216 aa  100  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0684  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.22 
 
 
221 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0799785  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2808  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.73 
 
 
216 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2219  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.27 
 
 
596 aa  100  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.118848  normal  0.796256 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2258  amino acid ABC transporter transmembrane protein  36.53 
 
 
231 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2935  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.34 
 
 
220 aa  99.8  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0418  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  31.19 
 
 
273 aa  99.8  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000690248  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_361  amino acid ABC transporter, permease protein  31.19 
 
 
273 aa  99  5e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000992364  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3886  amino acid ABC transporter permease  37.04 
 
 
501 aa  99  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67040  ABC transporter permease  35.88 
 
 
320 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1029  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.69 
 
 
216 aa  99  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.938438 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5577  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.26 
 
 
304 aa  98.6  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1057  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.92 
 
 
216 aa  98.2  8e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000168875  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0530  ABC-type amino acid transport system, permease component  29.86 
 
 
212 aa  98.2  8e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.928657  hitchhiker  0.000342419 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3695  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.96 
 
 
315 aa  97.8  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.538203  normal  0.259206 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1439  amino acid ABC transporter permease  30.69 
 
 
216 aa  97.8  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.209302 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0928  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.67 
 
 
329 aa  97.8  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0258353  normal  0.0157714 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5814  ABC transporter permease  34.32 
 
 
320 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460546  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4039  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.07 
 
 
231 aa  97.4  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2030  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.65 
 
 
598 aa  97.1  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0310843  hitchhiker  0.00101821 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3584  amino acid ABC transporter permease  33.7 
 
 
223 aa  97.4  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.495139  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0396  amino acid ABC transporter permease  31.61 
 
 
277 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2154  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.57 
 
 
233 aa  97.1  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1061  amino acid ABC transporter permease  30.24 
 
 
263 aa  96.7  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.958726  normal  0.719789 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0918  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.26 
 
 
237 aa  96.7  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.709473 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2587  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.45 
 
 
231 aa  95.5  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4703  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.99 
 
 
492 aa  95.5  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0325  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.72 
 
 
216 aa  94  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2071  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.61 
 
 
230 aa  94.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0750406  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2097  ABC transporter permease  36.25 
 
 
285 aa  94.7  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2464  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.61 
 
 
230 aa  94.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0343  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.72 
 
 
216 aa  94.7  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>