More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0819 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_1254  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  71.62 
 
 
584 aa  857    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4846  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  71.95 
 
 
584 aa  858    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892416  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04830  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  74.14 
 
 
595 aa  899    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0988  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  81.83 
 
 
611 aa  979    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0631467  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0965  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  70.94 
 
 
583 aa  856    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.297334  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0785  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  55.9 
 
 
576 aa  646    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1309  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  72.41 
 
 
583 aa  885    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0985993  normal  0.361254 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2952  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  76.85 
 
 
600 aa  937    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.090106  decreased coverage  0.000187391 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1015  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  85.25 
 
 
610 aa  1032    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6464  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  71.92 
 
 
583 aa  871    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.723061  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0679  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  70.16 
 
 
584 aa  845    Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00348299  normal  0.0897043 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0819  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  100 
 
 
609 aa  1253    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13349  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  71.62 
 
 
590 aa  855    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.287952 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1776  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  71.92 
 
 
584 aa  874    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0210  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  57.57 
 
 
579 aa  648    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0887  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  59.93 
 
 
583 aa  640    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1228  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  71.62 
 
 
584 aa  857    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.394279  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3954  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  73.97 
 
 
610 aa  900    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25820  succinate dehydrogenase subunit A  88.24 
 
 
612 aa  1073    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.722118  normal  0.667788 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1202  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  74.92 
 
 
599 aa  925    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000072111 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0312  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  64.1 
 
 
585 aa  765    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1129  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  75.08 
 
 
599 aa  924    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1437  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  60.2 
 
 
577 aa  706    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.217137  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21330  succinate dehydrogenase subunit A  72.34 
 
 
591 aa  882    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0770  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  70.23 
 
 
593 aa  843    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.130049 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05360  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  71.64 
 
 
595 aa  874    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0259373  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1245  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  71.62 
 
 
584 aa  857    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.193625  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1587  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  71.95 
 
 
584 aa  862    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.243588  normal  0.596865 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2255  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  53.69 
 
 
584 aa  623  1e-177  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.794625  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2104  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  53.44 
 
 
574 aa  602  1.0000000000000001e-171  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0119641 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2514  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  52.57 
 
 
585 aa  601  1e-170  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.136164  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2323  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  52.3 
 
 
592 aa  597  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4491  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  52.13 
 
 
592 aa  590  1e-167  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238917 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1825  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  51.95 
 
 
592 aa  589  1e-167  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.231317  normal  0.587479 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4358  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  52.13 
 
 
592 aa  590  1e-167  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2149  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  52.13 
 
 
592 aa  590  1e-167  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.44337  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2484  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  52.66 
 
 
592 aa  591  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.076646 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3034  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  51.75 
 
 
597 aa  590  1e-167  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1994  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  52.13 
 
 
592 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398561  normal  0.821237 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1204  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  51.94 
 
 
594 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.431605  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  51.11 
 
 
598 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.62165  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2863  succinate dehydrogenase subunit A  50.69 
 
 
594 aa  578  1e-164  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1881  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  51.86 
 
 
603 aa  578  1e-164  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6854  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  51.33 
 
 
591 aa  580  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.232059 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2168  succinate dehydrogenase subunit A  51.14 
 
 
596 aa  580  1e-164  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.274751 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0662  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  50.98 
 
 
591 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.536777  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2332  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  50.98 
 
 
591 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.790132  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1747  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  50.98 
 
 
591 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5588  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  51.15 
 
 
591 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4363  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  51.15 
 
 
591 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0791  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  50.98 
 
 
591 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127831  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0501  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  50.98 
 
 
591 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.426579  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2893  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  50.44 
 
 
591 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1831  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  50.98 
 
 
591 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.385612  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2470  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  50.98 
 
 
591 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328563  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1623  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  50.98 
 
 
591 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.829702  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0760  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  48.28 
 
 
592 aa  572  1.0000000000000001e-162  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2202  succinate dehydrogenase subunit A  50.87 
 
 
602 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.443729  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1537  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  51.15 
 
 
596 aa  568  1e-161  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3602  succinate dehydrogenase subunit A  50.61 
 
 
598 aa  571  1e-161  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4431  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  50.44 
 
 
591 aa  571  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  50.44 
 
 
591 aa  571  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.373287  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3592  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  50.44 
 
 
591 aa  571  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322313  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  50.61 
 
 
605 aa  565  1e-160  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.609874  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1061  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  50.53 
 
 
592 aa  567  1e-160  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.760541  normal  0.0367901 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3894  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  50.61 
 
 
605 aa  566  1e-160  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.197251  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2107  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  52.74 
 
 
603 aa  568  1e-160  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3313  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  50.27 
 
 
591 aa  566  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.775913 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3829  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  50.27 
 
 
591 aa  566  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.726427  normal  0.325233 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2548  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  52.01 
 
 
597 aa  565  1e-160  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.393014  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5838  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  50.27 
 
 
591 aa  566  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4646  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  50.27 
 
 
591 aa  566  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303055  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2425  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  49.74 
 
 
601 aa  564  1.0000000000000001e-159  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1428  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  49.65 
 
 
602 aa  565  1.0000000000000001e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2150  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  50.18 
 
 
592 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4278  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  50.26 
 
 
605 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0459  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  50.87 
 
 
605 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414111  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2285  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  49.21 
 
 
601 aa  561  1.0000000000000001e-159  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2795  succinate dehydrogenase subunit A  49.21 
 
 
601 aa  561  1.0000000000000001e-159  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0609564 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2704  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  50.09 
 
 
602 aa  560  1e-158  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.017234 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1965  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  50.97 
 
 
611 aa  560  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  50.44 
 
 
596 aa  560  1e-158  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0437  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  50.44 
 
 
599 aa  558  1e-157  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0688  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  50.43 
 
 
598 aa  558  1e-157  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1746  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  49.74 
 
 
604 aa  556  1e-157  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721199  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0109  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  48.63 
 
 
616 aa  557  1e-157  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.461726  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0380  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  50.09 
 
 
596 aa  555  1e-157  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1310  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  49.12 
 
 
595 aa  553  1e-156  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194206  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1799  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  48.95 
 
 
601 aa  554  1e-156  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4352  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  49.91 
 
 
601 aa  554  1e-156  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.602613  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0344  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  50.27 
 
 
596 aa  555  1e-156  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0100  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  47.95 
 
 
616 aa  551  1e-155  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.576611  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3032  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  48.76 
 
 
604 aa  551  1e-155  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2029  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  50 
 
 
596 aa  545  1e-154  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.21  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2749  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  49.82 
 
 
612 aa  548  1e-154  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1184  succinate dehydrogenase subunit A  51.49 
 
 
584 aa  542  1e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6040  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  50.87 
 
 
608 aa  545  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2846  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  50.8 
 
 
595 aa  542  1e-153  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7244  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  50.79 
 
 
608 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0389176  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3563  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  48.87 
 
 
612 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>