92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_R0040 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_R0040  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0016  tRNA-Arg  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.448611  normal  0.584402 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4297  tRNA-Arg  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.801361  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0058  tRNA-Thr  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000775366  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0955  tRNA-Arg  90.74 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0134122  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0023  tRNA-Thr  91.07 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0064  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00190165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0050  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0595881  unclonable  6.505860000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0065  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.68192e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0027  tRNA-Arg  92.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0953414  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0045  tRNA-Arg  92.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0043  tRNA-Arg  92.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315798 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0023  tRNA-Arg  92.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.865399 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0013  tRNA-Arg  92.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.473005 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0050  tRNA-Arg  92.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0043  tRNA-Arg  92.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.478862  hitchhiker  0.000308471 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0004  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.177658  hitchhiker  0.000057248 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1333  tRNA-Arg  88.46 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00705327  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0068  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00328675 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0038  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.495611  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0058  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.341614  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6039  tRNA-Arg  84.72 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.406085  normal  0.551037 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0010  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0181986  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0022  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272603  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0015  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000034077  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0019  tRNA-Lys  88.14 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.475559  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0009  tRNA-Arg  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.29751  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0047  tRNA-Lys  86.57 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.361519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0038  tRNA-Lys  86.57 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0009  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000049137  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0048  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0727081  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0041  tRNA-Arg  84.85 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0056  tRNA-Arg  84.29 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000671008  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0007  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0167892  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0010  tRNA-Arg  90.24 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0771  tRNA-Arg  85.96 
 
 		 79 bp  50.1  0.00008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0057  tRNA-Arg  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0020  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.482311  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0007  tRNA-Trp  88.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000385083  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0063  tRNA-Lys  86.89 
 
 		 73 bp  50.1  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.358792  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA46  tRNA-Arg  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.198158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0025  tRNA-Arg  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0059  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0015  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000775633  decreased coverage  0.0000968931 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07721  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0010  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000624159  hitchhiker  0.00328072 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0056  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243934  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0048  tRNA-Thr  88.46 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000131085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t08  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000135045  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0032  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.151331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0019  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0023  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0078  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0030  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.480252  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0049  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0022  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000000830353  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0055  tRNA-Arg  83.82 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000183529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0003  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.304948  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0014  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000757854  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0084  tRNA-Arg  86.54 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200461  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0012  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0024  tRNA-Thr  88.46 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0700552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0013  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0041  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0009  tRNA-Arg  86.54 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1416  tRNA-Arg  84.13 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0044  tRNA-Arg  85.45 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.310656 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0029  tRNA-Thr  90.7 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000138088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_R0070  tRNA-Arg  89.74 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.143256  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0028  tRNA-Arg  89.74 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00106807  normal  0.150294 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0057  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0053  tRNA-Arg  85.45 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.667012 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0028  tRNA-Arg  84.75 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00528012  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0065  tRNA-Arg  82.67 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000631385  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0024  tRNA-Arg  82.86 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000167821  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0023  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0036  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  1.49468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0041  tRNA-Arg  82.86 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0106412  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0004  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0069  tRNA-Arg  82.86 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0196822  normal  0.911508 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0034  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000100399  hitchhiker  0.00520953 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0023  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0598975  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0032  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178807 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0038  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000250994  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0007  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0088  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.706466  normal  0.421027 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0024  tRNA-Arg  82.86 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000092316  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0012  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000162811  hitchhiker  0.00834179 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0473563  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0025  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000025626  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0056  tRNA-Lys  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>