13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_R0016 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_R0016  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.598458 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6029  tRNA-Gly  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.065223  normal  0.116693 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1569  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1604  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.841854 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0040  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0056  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268197  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0066  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000867267  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA61  tRNA-Gly  87.23 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0087  tRNA-Gly  87.23 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0256242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0057  tRNA-Gly  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0091  tRNA-Gly  87.23 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.178769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26280  tRNA-Gly  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.15189 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0031  tRNA-Gly  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.390279  normal  0.72229 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>