More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3704 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3704  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 229 aa  453  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.636639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6218  transcriptional regulator, GntR family  28.33 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000229973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2860  GntR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2551  transcriptional regulator, GntR family  28.3 
 
 		 242 aa  71.6  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.321871  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4103  GntR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 246 aa  72  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0525  GntR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2707  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0952006 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  32.09 
 
 		 241 aa  68.6  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2205  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3979  transcriptional regulator, GntR family with LacI sensor  46.48 
 
 		 366 aa  66.2  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.562885  normal  0.577756 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3203  transcriptional regulator, GntR family  24.24 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1994  transcriptional regulator, GntR family  47.83 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2896  GntR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1802  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0871111  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1196  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6857  transcriptional regulator, GntR family  30.06 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.314897 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3031  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  40.28 
 
 		 286 aa  62.4  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.921184 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4360  GntR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 266 aa  62  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1431  transcriptional regulator, GntR family  41.43 
 
 		 270 aa  61.6  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2476  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  44 
 
 		 237 aa  61.6  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00699876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1251  GntR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116745  normal  0.0613053 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2432  GntR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1261  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  42.47 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0267  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0659  GntR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.263292  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3711  GntR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2836  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2212  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.189171  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5975  GntR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.360612 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2825  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214074  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0740  GntR family transcriptional regulator  20.25 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000268297  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3533  GntR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2647  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  41.1 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.135086  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2882  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  42.67 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  42.65 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2552  transcriptional regulator, GntR family  35.44 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3708  transcriptional regulator, GntR family  46.97 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6155  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.272713  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1620  GntR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429858  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2473  GntR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2282  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.557929  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2792  GntR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 284 aa  58.9  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.120812 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2335  GntR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.991331  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0498  GntR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687826  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1180  GntR domain protein  47.83 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1828  GntR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0948232  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3337  transcriptional regulator, GntR family  40.54 
 
 		 480 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.157491  hitchhiker  0.0000000000000475852 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4355  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  27.78 
 
 		 256 aa  58.5  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.250836 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1992  transcriptional regulator, GntR family  40.54 
 
 		 480 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0394003  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2153  GntR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 274 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1750  GntR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 332 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0894  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  27.56 
 
 		 280 aa  58.5  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  39.39 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2152  transcriptional regulator, GntR family  39.39 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0794  GntR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0826  histidine utilization repressor  38.75 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000366249  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3599  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0478  GntR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0696996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4156  GntR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3595  GntR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4434  GntR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0101  histidine utilization repressor  30.05 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2087  transcription regulator, GntR family  40.54 
 
 		 480 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000314762  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1828  transcriptional regulator, GntR family  39.39 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3933  GntR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0096  GntR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2648  histidine utilization repressor transcription regulator protein  41.33 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2221  histidine utilization repressor  42.47 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0955  transcriptional regulator, GntR family  29.33 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.468224  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2112  histidine utilization repressor  42.47 
 
 		 255 aa  57  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.869679  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4253  histidine utilization repressor  41.1 
 
 		 235 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1294  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 243 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.014181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2365  transcriptional regulator, GntR family  40.58 
 
 		 248 aa  57  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1166  GntR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 261 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.448437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0853  GntR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.122159  hitchhiker  0.00270002 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1898  GntR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 263 aa  57  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000197182  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2171  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.233669 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1526  GntR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.059282  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3905  GntR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2511  histidine utilization repressor  42.47 
 
 		 255 aa  57  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0551986 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1697  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 308 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0704  histidine utilization repressor  36.84 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240109  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1804  GntR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 481 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1857  transcriptional regulator, GntR family  37.88 
 
 		 242 aa  57  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1764  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.140741  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2488  GntR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 284 aa  57  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0312157 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4023  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2885  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.790974  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3310  GntR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.758694 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5005  histidine utilization repressor  42.65 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0939  histidine utilization repressor  40.91 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.997369  normal  0.595643 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2228  regulatory protein GntR HTH  32.29 
 
 		 370 aa  56.2  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.916284  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2619  transcriptional regulator, GntR family  28.63 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1929  GntR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2743  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.927097  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>