38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1795 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1795  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  477  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0285646  normal  0.335298 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2196  hypothetical protein  50.51 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.710845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4674  hypothetical protein  41.77 
 
 		 240 aa  127  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3021  hypothetical protein  40 
 
 		 206 aa  94.7  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2219  hypothetical protein  38.19 
 
 		 203 aa  93.6  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.185785 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3623  hypothetical protein  32.61 
 
 		 212 aa  90.1  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0945  hypothetical protein  36.5 
 
 		 211 aa  89  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0803  hypothetical protein  27.35 
 
 		 211 aa  86.3  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1083  hypothetical protein  27 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0006  hypothetical protein  33.56 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01974  hypothetical protein  27.94 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.64724  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0681  protein of unknown function DUF1449  35.09 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00978896 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3145  protein of unknown function DUF1449  27.8 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.630907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1185  hypothetical protein  25.11 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2997  hypothetical protein  23.83 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3100  hypothetical protein  25.1 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3110  hypothetical protein  25.11 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1266  protein of unknown function DUF1449  25.11 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.654061  hitchhiker  0.000225209 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3253  hypothetical protein  25.1 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2900  hypothetical protein  23.4 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2817  hypothetical protein  23.4 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1376  hypothetical protein  25.11 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2881  protein of unknown function DUF1449  35.07 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752639  normal  0.082564 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02920  predicted inner membrane protein  28.12 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02870  hypothetical protein  28.12 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0650  protein of unknown function DUF1449  28.12 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3513  putative inner membrane protein  28.12 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3226  putative inner membrane protein  29.71 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.507681  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0649  hypothetical protein  28.12 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3342  putative inner membrane protein  27.5 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.781071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0669  hypothetical protein  37.78 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603513  normal  0.609229 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3387  inner membrane protein YqiJ  29.63 
 
 		 206 aa  62  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3457  inner membrane protein YqiJ  25.76 
 
 		 206 aa  62  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.832198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3451  hypothetical protein  25.76 
 
 		 206 aa  62  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.674317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3383  inner membrane protein YqiJ  25.76 
 
 		 206 aa  62  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3553  inner membrane protein YqiJ  25.76 
 
 		 206 aa  62  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0143  hypothetical protein  29.57 
 
 		 191 aa  44.3  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0121  aromatic amino acid aminotransferase  29.46 
 
 		 406 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>