30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1581 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1581  antenna complex, alpha/beta subunit  100 
 
 
51 aa  104  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2900  light-harvesting protein B-800/850 beta chain  86.27 
 
 
51 aa  92.4  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1556  light-harvesting complex, beta subunit  74.51 
 
 
51 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.234529  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0208  antenna complex, alpha/beta subunit  74.51 
 
 
51 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3037  antenna complex, alpha/beta subunit  74.51 
 
 
51 aa  84.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1238  antenna complex, alpha/beta subunit  70 
 
 
51 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.000000053381  unclonable  0.0000000160108 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0314  LHII beta, light-harvesting B800/850 protein  72.55 
 
 
51 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0981  antenna complex, alpha/beta subunit  72.55 
 
 
51 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1958  antenna complex, alpha/beta subunit  72.55 
 
 
51 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1335  antenna complex, alpha/beta subunit  68 
 
 
51 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.187459 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3890  antenna complex, alpha/beta subunit  68 
 
 
51 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0231845  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3783  antenna complex, alpha/beta subunit  70 
 
 
51 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.999475  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3789  antenna complex, alpha/beta subunit  66 
 
 
51 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4770  antenna complex alpha/beta subunit  68 
 
 
51 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1678  antenna complex alpha/beta subunit  68 
 
 
51 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3787  antenna complex, alpha/beta subunit  68 
 
 
51 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0410146 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2400  antenna complex, alpha/beta subunit  68 
 
 
51 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0700836 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4448  antenna complex, alpha/beta subunit  68 
 
 
51 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.600971 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4033  antenna complex, alpha/beta subunit  68 
 
 
51 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.634064  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3422  antenna complex alpha/beta subunit  66 
 
 
51 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.418252  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0219  antenna complex, alpha/beta subunit  66 
 
 
51 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00256874  decreased coverage  0.00258596 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4440  antenna complex, alpha/beta subunit  64 
 
 
51 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.555045 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3418  antenna complex alpha/beta subunit  64 
 
 
51 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524451  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2391  antenna complex, alpha/beta subunit  62 
 
 
51 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.112688 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1407  antenna complex, alpha/beta subunit  63.83 
 
 
59 aa  70.5  0.000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3081  light harvesting protein B-800-850  60 
 
 
52 aa  69.7  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2927  antenna complex alpha/beta subunit  65 
 
 
47 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2610  antenna complex, alpha/beta subunit  62.5 
 
 
47 aa  60.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.202435  hitchhiker  0.00292827 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2862  antenna complex, alpha/beta subunit  62.5 
 
 
47 aa  60.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0341881  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2032  antenna complex, alpha/beta subunit  42.5 
 
 
60 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.832687 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>