93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1297 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1297  antirestriction protein-like  100 
 
 
92 aa  191  3e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.274902  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3213  antirestriction protein-like  91.94 
 
 
325 aa  125  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3779  hypothetical protein  84.13 
 
 
294 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.694827  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1972  domain of unknown function DUF1738  52.31 
 
 
362 aa  65.5  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0738445  normal  0.0525568 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5543  domain of unknown function DUF1738  49.25 
 
 
306 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234849  hitchhiker  0.00000802915 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4973  domain of unknown function DUF1738  49.25 
 
 
306 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6816  domain of unknown function DUF1738  49.25 
 
 
306 aa  64.7  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232152  normal  0.435368 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6561  domain of unknown function DUF1738  49.25 
 
 
306 aa  64.7  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0255  antirestriction protein  53.03 
 
 
299 aa  61.6  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6336  domain of unknown function DUF1738  46.88 
 
 
297 aa  61.6  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3581  hypothetical protein  50.77 
 
 
284 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0279  putative conjugal transfer antirestriction protein  44.78 
 
 
308 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1844  protein of unknown function DUF1738  52.38 
 
 
285 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  0.779395 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4322  hypothetical protein  45.59 
 
 
308 aa  58.2  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1960  domain of unknown function DUF1738  50 
 
 
299 aa  57.8  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4417  domain of unknown function DUF1738  48.39 
 
 
326 aa  57  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000308922  normal  0.463356 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4521  domain of unknown function DUF1738  48.39 
 
 
326 aa  57  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000111703  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8099  antirestriction protein  47.76 
 
 
308 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1780  antirestriction protein  43.28 
 
 
322 aa  56.2  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.114291  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9564  antirestriction protein  42.65 
 
 
308 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.211525  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9173  antirestriction protein  43.08 
 
 
310 aa  55.5  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12033  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4545  hypothetical protein  46.15 
 
 
295 aa  55.5  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4401  domain of unknown function DUF1738  45.9 
 
 
332 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.505635  normal  0.161946 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0037  hypothetical protein  44.44 
 
 
287 aa  54.7  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4227  antirestriction protein  44.62 
 
 
184 aa  55.1  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0722776  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0128  antirestriction protein  45.9 
 
 
321 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_25  antirestriction protein ArdC  45.9 
 
 
333 aa  54.3  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3793  hypothetical protein  48.48 
 
 
301 aa  54.3  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4610  hypothetical protein  44.26 
 
 
332 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.939593  normal  0.41393 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4587  hypothetical protein  44.26 
 
 
434 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37704  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4426  hypothetical protein  44.26 
 
 
332 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000360955  normal  0.236857 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4483  ArdC gene in pSa(IncW plasmid)-like  44.12 
 
 
308 aa  53.9  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00889579  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1814  hypothetical protein  47.62 
 
 
311 aa  53.5  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4757  hypothetical protein  38.67 
 
 
308 aa  53.5  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0574  antirestriction protein  45.45 
 
 
304 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5261  hypothetical protein  48.39 
 
 
311 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798907  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0306  antirestriction protein  53.23 
 
 
288 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9909  antirestriction protein  44.62 
 
 
285 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3690  antirestriction protein  35.29 
 
 
323 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5920  domain of unknown function DUF1738  46.77 
 
 
311 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0427  antirestriction protein  46.88 
 
 
313 aa  52.8  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.338701 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1162  domain of unknown function DUF1738  44.44 
 
 
299 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287336  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3033  DNA primase  42.19 
 
 
320 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.828057 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1473  domain of unknown function DUF1738  41.94 
 
 
314 aa  50.4  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3568  antirestriction protein; ArdC  43.55 
 
 
316 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.883646  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4749  domain of unknown function DUF1738  49.23 
 
 
327 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.778127  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4123  hypothetical protein  41.79 
 
 
335 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4668  hypothetical protein  36.71 
 
 
1077 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4058  hypothetical protein  40.3 
 
 
336 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0395  hypothetical protein  41.79 
 
 
344 aa  49.7  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.877999  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3326  putative ardC antirestriction protein  44.44 
 
 
318 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3921  antirestriction protein; ArdC  41.94 
 
 
316 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0020  DNA primase TraC  36.71 
 
 
986 aa  48.9  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4029  peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site  42.42 
 
 
301 aa  48.9  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0021  antirestriction protein  43.55 
 
 
319 aa  48.5  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6049  hypothetical protein  42.86 
 
 
326 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5347  antirestriction protein-like protein  44.07 
 
 
134 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.642698 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1461  domain of unknown function DUF1738  41.54 
 
 
297 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4248  hypothetical protein  44.26 
 
 
1580 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00909879  normal  0.515927 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2455  domain of unknown function DUF1738  42.42 
 
 
280 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000230581  unclonable  0.000000000352571 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_19  putative antirestriction protein  41.94 
 
 
328 aa  46.6  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.366429  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6843  domain of unknown function DUF1738  37.88 
 
 
296 aa  47  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.896751  normal  0.17936 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2404  antirestriction protein  43.75 
 
 
125 aa  47  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.236455  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6521  TOPRIM  42.62 
 
 
1448 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3336  hypothetical protein  43.75 
 
 
312 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6616  hypothetical protein  42.62 
 
 
1448 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0777828  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7703  putative ardC antirestriction protein  42.86 
 
 
317 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.166875 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3059  protein of unknown function DUF1738  42.86 
 
 
316 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1648  domain of unknown function DUF1738  38.36 
 
 
410 aa  46.2  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1266  hypothetical protein  39.39 
 
 
660 aa  45.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.678844  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5500  domain of unknown function DUF1738  34.92 
 
 
297 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348911 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2121  antirestriction protein; ArdC  43.55 
 
 
317 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2959  hypothetical protein  42.19 
 
 
312 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409787  normal  0.940796 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2282  antirestriction protein; ArdC  45.16 
 
 
313 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.365104 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1544  hypothetical protein  42.86 
 
 
320 aa  45.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0398449 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2244  hypothetical protein  41.27 
 
 
1495 aa  44.3  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5558  domain of unknown function DUF1738  40 
 
 
338 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.476412  normal  0.0470037 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8295  domain of unknown function DUF1738  41.27 
 
 
315 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399219  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0381  putative ArdC antirestriction protein  40.32 
 
 
312 aa  43.9  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1223  hypothetical protein  41.27 
 
 
320 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.909972  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2009  antirestriction protein-like protein  42.37 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.538486  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0539  hypothetical protein  39.68 
 
 
322 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0034  putative DNA replication primase  36.36 
 
 
682 aa  42.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000123462  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3512  hypothetical protein  41.27 
 
 
320 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.126742  normal  0.925711 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3814  hypothetical protein  41.94 
 
 
321 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0877775  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2408  domain of unknown function DUF1738  44.62 
 
 
313 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0038447  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3504  antirestriction protein-like protein  44.83 
 
 
180 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.519078  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7394  putative ardC antirestriction protein  40.32 
 
 
319 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615073  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4018  hypothetical protein  34.07 
 
 
312 aa  41.6  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.366526  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3149  hypothetical protein  39.68 
 
 
318 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2529  hypothetical protein  39.06 
 
 
384 aa  40.8  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0713703  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3741  hypothetical protein  32.97 
 
 
310 aa  40.4  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0801  hypothetical protein  38.81 
 
 
308 aa  40  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.957883 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>