45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_0654 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0654  hypothetical protein  100 
 
 
286 aa  586  1e-166  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1087  hypothetical protein  97.57 
 
 
288 aa  574  1.0000000000000001e-163  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1212  hypothetical protein  94.1 
 
 
288 aa  552  1e-156  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1361  hypothetical protein  28.81 
 
 
319 aa  97.1  3e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000275115  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0233  protein of unknown function DUF535  24.92 
 
 
306 aa  68.6  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4270  hypothetical protein  26.23 
 
 
345 aa  67.4  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2576  hypothetical protein  30.52 
 
 
334 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3138  VirK domain-containing protein  30.52 
 
 
333 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04886  hypothetical protein  25.35 
 
 
303 aa  62.8  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2717  hypothetical protein  29.22 
 
 
334 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000760  VirK protein  25.62 
 
 
302 aa  58.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1394  hypothetical protein  29.63 
 
 
318 aa  57.4  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.0750747 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2613  hypothetical protein  31.25 
 
 
315 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2697  hypothetical protein  26.92 
 
 
315 aa  57.4  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1595  hypothetical protein  26.92 
 
 
315 aa  57.4  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2765  protein of unknown function DUF535  28.1 
 
 
330 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0819238  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0981  hypothetical protein  28.1 
 
 
330 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.47492  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2409  hypothetical protein  27.12 
 
 
313 aa  56.2  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00888  hypothetical protein  28.1 
 
 
330 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1037  hypothetical protein  28.1 
 
 
330 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2453  hypothetical protein  28.1 
 
 
330 aa  56.6  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0233718  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2284  hypothetical protein  28.1 
 
 
330 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00241499  hitchhiker  0.00902859 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2719  hypothetical protein  28.1 
 
 
330 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.805745  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00882  hypothetical protein  28.1 
 
 
330 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0949  hypothetical protein  28.1 
 
 
330 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.422443  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2907  hypothetical protein  27.92 
 
 
321 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.924557 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0935  hypothetical protein  29.29 
 
 
306 aa  55.5  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0127626  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0063  hypothetical protein  26.79 
 
 
316 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4853  hypothetical protein  26.79 
 
 
316 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0262  hypothetical protein  26.79 
 
 
316 aa  55.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0044  hypothetical protein  26.79 
 
 
316 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.793542  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1669  hypothetical protein  27.54 
 
 
322 aa  53.9  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1038  hypothetical protein  25.31 
 
 
316 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.687101  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1058  hypothetical protein  25.31 
 
 
316 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.947736 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0941  hypothetical protein  25.31 
 
 
316 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.374104  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1007  hypothetical protein  25.31 
 
 
316 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.690632  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0975  VirK-like protein  25.31 
 
 
316 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.587318  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2975  virulence protein  25.79 
 
 
309 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.188395 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2922  hypothetical protein  25.79 
 
 
309 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0345216 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2956  virulence protein  25.16 
 
 
309 aa  50.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.492438  hitchhiker  0.00000541429 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3078  hypothetical protein  25.16 
 
 
309 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3894  hypothetical protein  24.78 
 
 
341 aa  49.7  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0831211  normal  0.569871 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2892  virulence protein  25.16 
 
 
309 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1208  protein of unknown function DUF535  22.85 
 
 
331 aa  47.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2837  protein of unknown function DUF535  26.47 
 
 
316 aa  45.8  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>