10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2594 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2594  lycopene cyclase domain protein  100 
 
 		 393 aa  752    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00913111  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2192  lycopene cyclase domain protein  60.1 
 
 		 398 aa  421  1e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.035344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0533  UbiA prenyltransferase  55.9 
 
 		 286 aa  291  2e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.516862  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1972  hypothetical protein  56.94 
 
 		 288 aa  288  9e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2815  UbiA prenyltransferase  55.21 
 
 		 283 aa  275  9e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.154953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1775  lycopene cyclase domain protein  70.53 
 
 		 102 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0770206  normal  0.47141 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0071  lycopene cyclase domain protein  66.67 
 
 		 123 aa  126  7e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2155  lycopene cyclase domain protein  65.59 
 
 		 104 aa  122  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1693  prenyltransferase  26.15 
 
 		 288 aa  43.5  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00802705  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04241  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.91 
 
 		 316 aa  43.1  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>