More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1959 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1959  ABC transporter related  100 
 
 
242 aa  475  1e-133  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.303889  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3214  ABC transporter related  72.89 
 
 
233 aa  317  1e-85  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.418962  normal  0.11192 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1943  ABC transporter related protein  64.16 
 
 
288 aa  289  3e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3761  ABC transporter related protein  65.64 
 
 
265 aa  280  1e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  55.2 
 
 
230 aa  258  5.0000000000000005e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  54.95 
 
 
238 aa  254  7e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  57.4 
 
 
248 aa  254  8e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  56.16 
 
 
228 aa  254  9e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  54.63 
 
 
226 aa  249  2e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  53.64 
 
 
260 aa  249  3e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  58.65 
 
 
236 aa  248  6e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  53.6 
 
 
227 aa  248  7e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  53.42 
 
 
240 aa  248  9e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  53.3 
 
 
246 aa  247  1e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0211  ABC transporter related  56.71 
 
 
256 aa  247  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  56.44 
 
 
244 aa  246  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  54.38 
 
 
230 aa  246  2e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  55.61 
 
 
255 aa  246  3e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  55.5 
 
 
228 aa  246  3e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  51.85 
 
 
225 aa  244  6.999999999999999e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  52.51 
 
 
236 aa  243  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  53.45 
 
 
240 aa  242  3e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  54.02 
 
 
247 aa  242  5e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  56.31 
 
 
222 aa  240  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  50.69 
 
 
229 aa  240  1e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  54.67 
 
 
234 aa  241  1e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  54.67 
 
 
234 aa  241  1e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  55.5 
 
 
244 aa  240  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  52.78 
 
 
224 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  52.78 
 
 
224 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1533  ABC transporter related  53.33 
 
 
228 aa  238  4e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1635  ABC transporter related  55.09 
 
 
229 aa  238  6.999999999999999e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  52.78 
 
 
230 aa  237  1e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  53 
 
 
237 aa  237  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  52.31 
 
 
224 aa  236  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  51.85 
 
 
224 aa  236  2e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  52.25 
 
 
242 aa  236  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  53.24 
 
 
225 aa  236  2e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4286  ABC transporter-related protein  57.8 
 
 
241 aa  236  2e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  52.31 
 
 
224 aa  236  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  51.85 
 
 
224 aa  236  3e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  51.85 
 
 
224 aa  236  3e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  51.85 
 
 
224 aa  236  3e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4308  ABC transporter related  57.8 
 
 
241 aa  236  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  57.01 
 
 
238 aa  236  3e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4155  ABC transporter, ATPase subunit  57.8 
 
 
241 aa  236  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  53.92 
 
 
233 aa  235  5.0000000000000005e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  55.16 
 
 
230 aa  235  6e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  52.53 
 
 
239 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  52.53 
 
 
232 aa  233  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  50.93 
 
 
224 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  51.85 
 
 
231 aa  233  2.0000000000000002e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  54.75 
 
 
233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  49.33 
 
 
286 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  51.39 
 
 
224 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  53.54 
 
 
228 aa  233  3e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4849  ABC transporter related  51.38 
 
 
239 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2073  ABC transporter related protein  48.21 
 
 
228 aa  231  6e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  53.24 
 
 
239 aa  231  7.000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  50.46 
 
 
224 aa  230  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  53.42 
 
 
229 aa  230  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  53.24 
 
 
237 aa  231  1e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  54.13 
 
 
230 aa  230  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  55.66 
 
 
226 aa  229  4e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  52.73 
 
 
233 aa  228  5e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3012  ABC transporter, ATP-binding protein  50.67 
 
 
319 aa  228  5e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.331598  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  51.15 
 
 
242 aa  228  5e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  52.53 
 
 
235 aa  228  5e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  49.07 
 
 
266 aa  228  6e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  53.39 
 
 
238 aa  228  6e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  53.88 
 
 
277 aa  228  8e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  54.33 
 
 
228 aa  228  8e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0701  ABC transporter, ATPase subunit  51.27 
 
 
241 aa  227  1e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.471185  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  52.73 
 
 
291 aa  226  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1760  ABC transporter related  53.77 
 
 
250 aa  225  4e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  51.35 
 
 
228 aa  225  5.0000000000000005e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1900  ABC transporter related  55.12 
 
 
234 aa  224  7e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  50.93 
 
 
236 aa  224  8e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  50.46 
 
 
226 aa  224  8e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  52.53 
 
 
244 aa  224  1e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  54.26 
 
 
233 aa  223  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  54.71 
 
 
233 aa  223  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0252  ABC transporter related  50.67 
 
 
244 aa  223  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  50.46 
 
 
226 aa  222  4e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  50.46 
 
 
248 aa  222  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  50.46 
 
 
248 aa  222  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  49.78 
 
 
228 aa  222  4e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  53.88 
 
 
241 aa  222  4e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  52.31 
 
 
252 aa  222  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  50.46 
 
 
226 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  52.78 
 
 
256 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  50.46 
 
 
226 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4296  ABC transporter related  56.42 
 
 
242 aa  221  6e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0438871  normal  0.557698 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  50.46 
 
 
226 aa  221  8e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  50.46 
 
 
226 aa  221  8e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  43.78 
 
 
293 aa  221  8e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  52.07 
 
 
653 aa  221  8e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  50.46 
 
 
226 aa  221  8e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1024  ABC transporter related  53.46 
 
 
234 aa  221  8e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.306992 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  46.79 
 
 
221 aa  221  8e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>