16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0716 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0716  proteasome Rpn11 subunit JAMM motif protein  100 
 
 
169 aa  340  5e-93  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1908  proteasome Rpn11 subunit JAMM motif protein  73.33 
 
 
163 aa  256  1e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.117708  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2117  metal-dependent protease of the PAD1/JAB1 superfamily-like protein  70.89 
 
 
164 aa  225  2e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2405  hypothetical protein  66.46 
 
 
173 aa  221  4e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.600019  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0620  hypothetical protein  66.24 
 
 
164 aa  213  9.999999999999999e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0623  JAMM-like protein. metallo peptidase. MEROPS family M67B  46.62 
 
 
135 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.64489  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3046  JAMM-like protein. metallo peptidase. MEROPS family M67B  42.86 
 
 
131 aa  108  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.208196  normal  0.597749 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0311  hypothetical protein  44.19 
 
 
123 aa  103  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.734999  normal  0.454808 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2403  hypothetical protein  42.11 
 
 
149 aa  102  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0210  hypothetical protein  46.9 
 
 
123 aa  101  6e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2297  hypothetical protein  40.91 
 
 
123 aa  93.2  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0077  hypothetical protein  37.98 
 
 
123 aa  87.8  6e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.825117  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0792  Mov34 family protein  39.69 
 
 
124 aa  85.1  4e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0407  hypothetical protein  43.93 
 
 
107 aa  84.7  6e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.167584  hitchhiker  0.00520945 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0715  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.59 
 
 
133 aa  57.8  0.00000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0658  hypothetical protein  41.79 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.125511  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>