12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2022 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2022  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  372  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2115  hypothetical protein  63.25 
 
 
241 aa  212  2.9999999999999995e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0969  hypothetical protein  63.12 
 
 
253 aa  207  9e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.637317  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1909  hypothetical protein  63.12 
 
 
247 aa  206  1e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.928728  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0220  hypothetical protein  63.75 
 
 
226 aa  200  9e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0568109  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0390  hypothetical protein  62.96 
 
 
216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0757  hypothetical protein  54.43 
 
 
190 aa  178  4e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.016863  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0716  hypothetical protein  53.85 
 
 
271 aa  178  4.999999999999999e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0592782  normal  0.0503342 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0487  hypothetical protein  49.7 
 
 
186 aa  174  7e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0786  hypothetical protein  53.59 
 
 
201 aa  168  4e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00417642  unclonable  0.0000000000000881752 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1198  hypothetical protein  51.32 
 
 
202 aa  164  5e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.666429  normal  0.0400405 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1474  hypothetical protein  38.16 
 
 
153 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000625179  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>