More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0786 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0652  adenylosuccinate lyase  73.8 
 
 
460 aa  668    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.550161  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2736  adenylosuccinate lyase  85.9 
 
 
465 aa  785    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286756  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3158  adenylosuccinate lyase  77.17 
 
 
460 aa  701    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.764466 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0924  adenylosuccinate lyase  73.19 
 
 
486 aa  646    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000172429 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0786  adenylosuccinate lyase  100 
 
 
461 aa  931    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4199  adenylosuccinate lyase  51.3 
 
 
451 aa  416  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225542  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0043  adenylosuccinate lyase  51.09 
 
 
451 aa  415  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3246  adenylosuccinate lyase  49.13 
 
 
458 aa  412  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.164872  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2720  adenylosuccinate lyase  47.62 
 
 
457 aa  411  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.382764 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1673  adenylosuccinate lyase  49.67 
 
 
465 aa  410  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2554  adenylosuccinate lyase  47.4 
 
 
457 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.660215 
 
 
-
 
NC_002950  PG1123  adenylosuccinate lyase  46.52 
 
 
447 aa  402  1e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2964  adenylosuccinate lyase  47.19 
 
 
457 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.989167  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2593  adenylosuccinate lyase  45.16 
 
 
456 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.138176  normal  0.0552843 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2635  adenylosuccinate lyase  45.16 
 
 
456 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1871  adenylosuccinate lyase  45.16 
 
 
456 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0121528  hitchhiker  0.00000377009 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1558  adenylosuccinate lyase  45.04 
 
 
456 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0115488  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2235  adenylosuccinate lyase  45.06 
 
 
456 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0334521  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2480  adenylosuccinate lyase  45.16 
 
 
456 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.866176  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1511  adenylosuccinate lyase  47.07 
 
 
483 aa  400  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.411987 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1879  adenylosuccinate lyase  45.36 
 
 
455 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000162136 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2473  adenylosuccinate lyase  45.16 
 
 
456 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00166519  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3366  adenylosuccinate lyase  47.32 
 
 
462 aa  398  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000111293 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1333  adenylosuccinate lyase  44.81 
 
 
456 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.887926  normal  0.184863 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2902  adenylosuccinate lyase  45.34 
 
 
456 aa  398  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451735  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1610  adenylosuccinate lyase  44.28 
 
 
456 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2134  adenylosuccinate lyase  44.81 
 
 
456 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0323604 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2853  adenylosuccinate lyase  44.28 
 
 
456 aa  397  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1952  adenylosuccinate lyase  44.81 
 
 
456 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2576  adenylosuccinate lyase  47.25 
 
 
462 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000542791 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1718  adenylosuccinate lyase  44.28 
 
 
456 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2540  adenylosuccinate lyase  44.69 
 
 
456 aa  397  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1349  adenylosuccinate lyase  44.81 
 
 
456 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1675  adenylosuccinate lyase  45.3 
 
 
459 aa  397  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3858  adenylosuccinate lyase  43.53 
 
 
460 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1601  adenylosuccinate lyase  44.73 
 
 
456 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2707  adenylosuccinate lyase  44.3 
 
 
456 aa  397  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0624698 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01129  adenylosuccinate lyase  43.94 
 
 
456 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2195  adenylosuccinate lyase  44.69 
 
 
456 aa  392  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2442  adenylosuccinate lyase  46.47 
 
 
462 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0863  adenylosuccinate lyase  43.29 
 
 
456 aa  392  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0834  adenylosuccinate lyase  43.29 
 
 
456 aa  393  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1867  adenylosuccinate lyase  44.37 
 
 
456 aa  392  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2819  adenylosuccinate lyase  46.3 
 
 
458 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0358  adenylosuccinate lyase  46.47 
 
 
462 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2152  adenylosuccinate lyase  44.16 
 
 
456 aa  392  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0629713  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1273  adenylosuccinate lyase  47.16 
 
 
455 aa  392  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01137  hypothetical protein  43.94 
 
 
456 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1309  adenylosuccinate lyase  43.94 
 
 
456 aa  392  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1221  adenylosuccinate lyase  45.86 
 
 
483 aa  392  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0593  adenylosuccinate lyase  47.32 
 
 
462 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1294  adenylosuccinate lyase  43.94 
 
 
456 aa  392  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2956  adenylosuccinate lyase  45.43 
 
 
458 aa  395  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0960  adenylosuccinate lyase  46.39 
 
 
469 aa  394  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000552742 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1644  adenylosuccinate lyase  44.37 
 
 
456 aa  392  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0183  adenylosuccinate lyase  46.25 
 
 
462 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31796  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0633  adenylosuccinate lyase  46.25 
 
 
462 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2381  adenylosuccinate lyase  44.03 
 
 
455 aa  392  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.701794  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1593  adenylosuccinate lyase  43.82 
 
 
455 aa  394  1e-108  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1676  adenylosuccinate lyase  44.52 
 
 
456 aa  395  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.167323  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1592  adenylosuccinate lyase  43.94 
 
 
456 aa  392  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000440379 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0666  adenylosuccinate lyase  46.25 
 
 
462 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.600757  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1745  adenylosuccinate lyase  44.52 
 
 
456 aa  394  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1311  adenylosuccinate lyase  44.59 
 
 
456 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.634296  normal  0.266567 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1764  adenylosuccinate lyase  45.87 
 
 
455 aa  392  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.207471  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2516  adenylosuccinate lyase  43.94 
 
 
456 aa  391  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00611502  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2578  adenylosuccinate lyase  46.05 
 
 
456 aa  388  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.763537  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2020  adenylosuccinate lyase  43.72 
 
 
456 aa  390  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.581783  normal  0.312762 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2627  adenylosuccinate lyase  46.47 
 
 
462 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0157894  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1994  adenylosuccinate lyase  43.94 
 
 
456 aa  392  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.922086 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2472  adenylosuccinate lyase  43.94 
 
 
456 aa  391  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3288  adenylosuccinate lyase  45.81 
 
 
455 aa  389  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.650237  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3376  adenylosuccinate lyase  45.77 
 
 
459 aa  390  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28380  adenylosuccinate lyase  45.93 
 
 
462 aa  389  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3752  adenylosuccinate lyase  46.04 
 
 
482 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1251  adenylosuccinate lyase  43.94 
 
 
456 aa  391  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1794  adenylosuccinate lyase  46.74 
 
 
459 aa  390  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0813752  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1216  adenylosuccinate lyase  46.47 
 
 
462 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4026  adenylosuccinate lyase  45.77 
 
 
459 aa  390  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3402  adenylosuccinate lyase  46.47 
 
 
462 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02370  adenylosuccinate lyase  44.78 
 
 
455 aa  390  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.718136  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2446  adenylosuccinate lyase  47.19 
 
 
454 aa  391  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.673472  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1849  adenylosuccinate lyase  47.6 
 
 
455 aa  392  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30110  adenylosuccinate lyase  46.27 
 
 
456 aa  392  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3268  adenylosuccinate lyase  46.17 
 
 
457 aa  390  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00567464 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5167  adenylosuccinate lyase  45.36 
 
 
459 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.518617  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1940  adenylosuccinate lyase  43.38 
 
 
455 aa  389  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2402  adenylosuccinate lyase  45.93 
 
 
456 aa  391  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.129184  normal  0.0983593 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2627  adenylosuccinate lyase  46.15 
 
 
455 aa  385  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108718  normal  0.687472 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1238  adenylosuccinate lyase  46.56 
 
 
443 aa  385  1e-106  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2065  adenylosuccinate lyase  44.03 
 
 
455 aa  388  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1826  adenylosuccinate lyase  42.89 
 
 
456 aa  387  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2262  adenylosuccinate lyase  43.01 
 
 
456 aa  388  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0852  adenylosuccinate lyase  45.77 
 
 
481 aa  387  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.697977 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1360  adenylosuccinate lyase  42.83 
 
 
463 aa  387  1e-106  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0961  adenylosuccinate lyase  46.2 
 
 
457 aa  388  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.118587 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3624  adenylosuccinate lyase  46.3 
 
 
457 aa  383  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.12495  normal  0.263757 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3436  adenylosuccinate lyase  46.47 
 
 
462 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.587084  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01822  adenylosuccinate lyase  43.47 
 
 
478 aa  384  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06215  adenylosuccinate lyase  44.47 
 
 
445 aa  382  1e-105  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.232812  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>