171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0712 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0712  Methionyl-tRNA formyltransferase-like protein  100 
 
 
287 aa  567  1e-161  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3616  Methionyl-tRNA formyltransferase-like protein  56.49 
 
 
301 aa  335  7e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0058  formyl transferase domain protein  35.51 
 
 
290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0379869  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1070  Methionyl-tRNA formyltransferase-like protein  37.44 
 
 
274 aa  109  5e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.520148 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3177  methionyl-tRNA formyltransferase  30 
 
 
315 aa  62  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000345004  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0373  methionyl-tRNA formyltransferase  25.81 
 
 
308 aa  60.5  0.00000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3689  methionyl-tRNA formyltransferase  27.82 
 
 
314 aa  58.9  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3908  methionyl-tRNA formyltransferase  26.87 
 
 
255 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2491  methionyl-tRNA formyltransferase  27.78 
 
 
319 aa  56.2  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1040  methionyl-tRNA formyltransferase  25.62 
 
 
309 aa  56.2  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1278  methionyl-tRNA formyltransferase  26.32 
 
 
314 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.289128 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3965  methionyl-tRNA formyltransferase  26.32 
 
 
314 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3914  methionyl-tRNA formyltransferase  26.32 
 
 
314 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00718662  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3717  methionyl-tRNA formyltransferase  26.32 
 
 
314 aa  55.8  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00223065  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3607  methionyl-tRNA formyltransferase  26.32 
 
 
314 aa  55.8  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3625  methionyl-tRNA formyltransferase  26.32 
 
 
314 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000492096  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4004  methionyl-tRNA formyltransferase  26.32 
 
 
314 aa  55.8  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3880  methionyl-tRNA formyltransferase  26.32 
 
 
314 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43125e-17 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1063  methionyl-tRNA formyltransferase  30.91 
 
 
318 aa  55.8  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  27.14 
 
 
314 aa  55.5  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0782  methionyl-tRNA formyltransferase  28.78 
 
 
310 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.606283  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09618  methionyl-tRNA formyltransferase  27.93 
 
 
315 aa  55.1  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.315311  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0513  methionyl-tRNA formyltransferase  29.84 
 
 
319 aa  54.7  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0943  methionyl-tRNA formyltransferase  30.48 
 
 
326 aa  54.3  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0205  methionyl-tRNA formyltransferase  30.48 
 
 
303 aa  53.5  0.000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  29.66 
 
 
315 aa  53.9  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4156  methionyl-tRNA formyltransferase  34.91 
 
 
307 aa  53.9  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.413206  hitchhiker  0.00887894 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  33.33 
 
 
302 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  30.08 
 
 
311 aa  53.5  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  35.92 
 
 
308 aa  52.8  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1275  methionyl-tRNA formyltransferase  27.94 
 
 
311 aa  52.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  32.04 
 
 
307 aa  53.1  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf816  methionyl-tRNA formyltransferase  27.78 
 
 
285 aa  52.8  0.000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1300  methionyl-tRNA formyltransferase  27.94 
 
 
311 aa  52.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247026  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3407  methionyl-tRNA formyltransferase  32.71 
 
 
331 aa  52.8  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.667416  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1176  methionyl-tRNA formyltransferase  26.47 
 
 
309 aa  52.8  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0139658  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  28.95 
 
 
317 aa  52.4  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0409  methionyl-tRNA formyltransferase  28.57 
 
 
313 aa  52.4  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0393  methionyl-tRNA formyltransferase  29.09 
 
 
313 aa  52.4  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.691189  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  33.96 
 
 
359 aa  52  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  33.61 
 
 
318 aa  52  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3564  methionyl-tRNA formyltransferase  31.78 
 
 
344 aa  52.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3398  methionyl-tRNA formyltransferase  31.37 
 
 
323 aa  51.6  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.726388  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4053  methionyl-tRNA formyltransferase  31.37 
 
 
323 aa  51.6  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0641  methionyl-tRNA formyltransferase  29.09 
 
 
310 aa  51.2  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2313  methionyl-tRNA formyltransferase  28.21 
 
 
312 aa  50.8  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490925  hitchhiker  0.0006759 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0410  methionyl-tRNA formyltransferase  30.63 
 
 
301 aa  50.4  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3123  methionyl-tRNA formyltransferase  32.14 
 
 
327 aa  50.8  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.760657  normal  0.204185 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  34.65 
 
 
310 aa  50.1  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2535  methionyl-tRNA formyltransferase  29.2 
 
 
302 aa  49.7  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.614949  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1386  methionyl-tRNA formyltransferase  31.93 
 
 
315 aa  50.1  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.442669  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04056  methionyl-tRNA formyltransferase  32.04 
 
 
307 aa  50.1  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0875  methionyl-tRNA formyltransferase  31.43 
 
 
302 aa  49.7  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1953  methionyl-tRNA formyltransferase  31.96 
 
 
319 aa  49.7  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0347  methionyl-tRNA formyltransferase  29.7 
 
 
305 aa  49.3  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.342124  normal  0.0280325 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0897  methionyl-tRNA formyltransferase  28.57 
 
 
303 aa  49.3  0.00007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.861385  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  27.05 
 
 
316 aa  49.3  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2025  Formyl transferase-like  25.76 
 
 
270 aa  49.3  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.45542 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1719  methionyl-tRNA formyltransferase  30.51 
 
 
311 aa  49.3  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.296625  hitchhiker  0.00236307 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  26.5 
 
 
311 aa  48.9  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  22.69 
 
 
311 aa  48.5  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1864  methionyl-tRNA formyltransferase  29.91 
 
 
307 aa  48.1  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3697  putative formyltransferase  28 
 
 
308 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0181  methionyl-tRNA formyltransferase  30.91 
 
 
299 aa  48.9  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.142178  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2842  methionyl-tRNA formyltransferase  29.06 
 
 
337 aa  48.5  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.409607  normal  0.026297 
 
 
-
 
NC_002978  WD0866  methionyl-tRNA formyltransferase  30.48 
 
 
299 aa  48.1  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0143  methionyl-tRNA formyltransferase  30.77 
 
 
327 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  28.44 
 
 
314 aa  47.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0347  methionyl-tRNA formyltransferase  30.77 
 
 
327 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  27.52 
 
 
312 aa  48.1  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4638  methionyl-tRNA formyltransferase  30.39 
 
 
357 aa  47.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.857325  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2868  methionyl-tRNA formyltransferase  30.48 
 
 
325 aa  47.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4017  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  29.2 
 
 
660 aa  47.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.296213  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00190  methionyl-tRNA formyltransferase  29.41 
 
 
314 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.767541  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2805  methionyl-tRNA formyltransferase  30.77 
 
 
337 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0284  methionyl-tRNA formyltransferase  31.13 
 
 
315 aa  47.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0176978 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2275  methionyl-tRNA formyltransferase  30.77 
 
 
337 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  30.77 
 
 
327 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0160  methionyl-tRNA formyltransferase  30.77 
 
 
327 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.701485  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2353  methionyl-tRNA formyltransferase  30.77 
 
 
337 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0626  methionyl-tRNA formyltransferase  32.04 
 
 
310 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274146  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1642  methionyl-tRNA formyltransferase  31.93 
 
 
312 aa  47  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  28.44 
 
 
314 aa  47.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3065  methionyl-tRNA formyltransferase  28.43 
 
 
314 aa  47  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38579  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0036  methionyl-tRNA formyltransferase  29.81 
 
 
327 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  26.92 
 
 
318 aa  47  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  27.12 
 
 
311 aa  47.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4568  methionyl-tRNA formyltransferase  34.74 
 
 
312 aa  47.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  31.03 
 
 
314 aa  47.4  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0392  formyl transferase domain protein  29.36 
 
 
312 aa  47.4  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  31.03 
 
 
314 aa  47.4  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3877  methionyl-tRNA formyltransferase  27.45 
 
 
323 aa  47  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4081  methionyl-tRNA formyltransferase  27.88 
 
 
330 aa  47  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2232  methionyl-tRNA formyltransferase  35.79 
 
 
313 aa  46.6  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  31.82 
 
 
312 aa  46.6  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  31.62 
 
 
330 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1334  methionyl-tRNA formyltransferase  26.09 
 
 
313 aa  46.6  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0783821  normal  0.599523 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  27.93 
 
 
317 aa  46.2  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0959  methionyl-tRNA formyltransferase  25.51 
 
 
328 aa  46.2  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.500083  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  28.97 
 
 
310 aa  46.2  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>